131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3949 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3949  thioesterase domain-containing protein  100 
 
 
308 aa  645    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03531  fused GNAT family acetyltransferase/PaaI-related uncharacterized conserved domain  69.36 
 
 
304 aa  460  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123025  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001898  galactoside O-acetyltransferase  45.45 
 
 
305 aa  296  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00595  acetyltransferase  44.78 
 
 
300 aa  295  8e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2936  putative acyltransferase  43.77 
 
 
299 aa  289  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2312  hypothetical protein  45.12 
 
 
310 aa  289  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4152  thioesterase domain protein  42.24 
 
 
313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4418  GNAT family acetyltransferase  42.28 
 
 
329 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0993621  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4216  thioesterase domain protein  41.06 
 
 
313 aa  268  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0032  acetyltransferase domain-containing protein  40.94 
 
 
307 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0037  acetyltransferase domain-containing protein  40.94 
 
 
307 aa  268  7e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4184  thioesterase domain-containing protein  40.94 
 
 
307 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3955  thioesterase domain protein  41.25 
 
 
313 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4307  acetyltransferase, gnat family  41.95 
 
 
329 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.913175  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4353  GNAT family acetyltransferase  41.95 
 
 
313 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449185  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4240  acetyltransferase, gnat family  41.95 
 
 
329 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4262  acetyltransferase, gnat family  41.95 
 
 
329 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4499  thioesterase domain protein  40.73 
 
 
313 aa  265  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4366  acetyltransferase, GNAT family  40.94 
 
 
313 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03773  putative acetyltransferase  40.6 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871645  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03722  hypothetical protein  40.6 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.645417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5335  acetyltransferase, GNAT family  40.6 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.251571 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4098  thioesterase domain protein  40.6 
 
 
313 aa  261  8e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4113  acetyltransferase  40.6 
 
 
313 aa  261  8e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4130  thioesterase domain-containing protein  40.6 
 
 
313 aa  261  8e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.480913  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4273  acetyltransferase  40.6 
 
 
313 aa  261  8e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4411  thioesterase/acetyltransferase domain-containing protein  40.6 
 
 
313 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4090  thioesterase domain-containing protein  39.26 
 
 
329 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4876  thioesterase domain-containing protein  41.06 
 
 
314 aa  255  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000372984 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0902  acetyltransferase  39.12 
 
 
298 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0306  thioesterase domain-containing protein  47.06 
 
 
157 aa  123  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00971414  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3905  thioesterase domain-containing protein  43.62 
 
 
149 aa  123  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000215203  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0333  thioesterase domain-containing protein  41.5 
 
 
164 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4614  thioesterase domain-containing protein  45.32 
 
 
158 aa  119  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3541  thioesterase domain-containing protein  43.88 
 
 
156 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4397  acetyltransferase  40.71 
 
 
145 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0315  thioesterase domain-containing protein  42.14 
 
 
145 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00708885  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3401  acetyltransferase  42.14 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0420  thioesterase domain-containing protein  40.69 
 
 
149 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0320  thioesterase domain-containing protein  41.01 
 
 
145 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127147  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3704  thioesterase domain-containing protein  41.01 
 
 
145 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120731  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0319  thioesterase domain-containing protein  40 
 
 
150 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00732818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0323  thioesterase domain-containing protein  40 
 
 
150 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.42127  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0318  thioesterase domain-containing protein  40 
 
 
150 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000336886  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0324  thioesterase domain protein  40 
 
 
150 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304239  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3446  thioesterase, putative  38.31 
 
 
192 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000290362  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4948  thioesterase domain-containing protein  30.71 
 
 
151 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625869  hitchhiker  0.0000169868 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2722  thioesterase domain protein  30.22 
 
 
148 aa  74.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4939  hypothetical protein  33.65 
 
 
157 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0286  thioesterase, putative  36.08 
 
 
151 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0262  hypothetical protein  36.84 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0142583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0277  thioesterase domain-containing protein  36.84 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0287  thioesterase domain-containing protein  35.79 
 
 
151 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5400  hypothetical protein  34.02 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2158  thioesterase, putative  27.54 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0274  thioesterase domain-containing protein  31.54 
 
 
153 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1720  thioesterase domain protein  26.81 
 
 
151 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0960141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1791  thioesterase domain protein  27.54 
 
 
151 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1324  thioesterase domain-containing protein  26.76 
 
 
150 aa  63.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.317856  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1113  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
144 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00477349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1136  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
144 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00122389  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1355  hypothetical protein  29.1 
 
 
159 aa  59.3  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0132  thioesterase domain protein  34.88 
 
 
155 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  28.16 
 
 
287 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0434  acetyltransferase  36.96 
 
 
158 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000409483  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_399  acetyltransferase, GNAT family  35.48 
 
 
160 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00235227  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03973  thioesterase domain, putative subfamily  26.81 
 
 
180 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0334  N-acetylglutamate synthase  31.52 
 
 
169 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  26.05 
 
 
144 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1330  GCN5-related N-acetyltransferase  22.73 
 
 
146 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0879736  normal  0.150143 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  26.4 
 
 
147 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0457  acetyltransferase  33.33 
 
 
158 aa  49.7  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1843  GCN5-related N-acetyltransferase  22.73 
 
 
159 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_860  acetyltransferase, GNAT family  23.31 
 
 
144 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0788969  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0170  N-acetylglutamate synthase  32.56 
 
 
169 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1774  hypothetical protein  26.5 
 
 
148 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2799  acetyltransferase, GNAT family  25.93 
 
 
144 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
155 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  22.73 
 
 
147 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2358  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
180 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0501  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
154 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.077334  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0280  GCN5-related N-acetyltransferase  24.59 
 
 
155 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.539366  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13050  N-acetylglutamate synthase  33.71 
 
 
169 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
155 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.762819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0836  N-acetylglutamate synthase  34.52 
 
 
170 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2844  acetyltransferase, GNAT family  25.37 
 
 
144 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0189947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2555  acetyltransferase  26.12 
 
 
144 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0530574  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1295  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
164 aa  46.2  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.476668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2823  acetyltransferase  25.37 
 
 
144 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000798429  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0988  acetyltransferase  22.22 
 
 
144 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0199888  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2603  acetyltransferase  25.37 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.280255  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4220  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
151 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 
149 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2792  acetyltransferase  25.37 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.7554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3092  acetyltransferase  30.34 
 
 
150 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0220833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0921  acetyltransferase  27.06 
 
 
151 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2522  acetyltransferase  25.37 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0369491  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03220  hypothetical protein  26.67 
 
 
165 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.554181  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
141 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>