63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4397 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4397  acetyltransferase  100 
 
 		 145 aa  303  6e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0320  thioesterase domain-containing protein  90.34 
 
 		 145 aa  267  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0315  thioesterase domain-containing protein  89.66 
 
 		 145 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00708885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3704  thioesterase domain-containing protein  88.97 
 
 		 145 aa  262  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120731  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0324  thioesterase domain protein  75.68 
 
 		 150 aa  236  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0319  thioesterase domain-containing protein  75 
 
 		 150 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00732818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0323  thioesterase domain-containing protein  75 
 
 		 150 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.42127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0318  thioesterase domain-containing protein  75 
 
 		 150 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000336886  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0420  thioesterase domain-containing protein  67.59 
 
 		 149 aa  218  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3905  thioesterase domain-containing protein  66.67 
 
 		 149 aa  206  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000215203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3541  thioesterase domain-containing protein  65.97 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0306  thioesterase domain-containing protein  65 
 
 		 157 aa  202  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00971414  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0333  thioesterase domain-containing protein  65.71 
 
 		 164 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4614  thioesterase domain-containing protein  61.97 
 
 		 158 aa  193  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3401  acetyltransferase  61.43 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3446  thioesterase, putative  53.99 
 
 		 192 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000290362  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3955  thioesterase domain protein  43.05 
 
 		 313 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0032  acetyltransferase domain-containing protein  42.38 
 
 		 307 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0037  acetyltransferase domain-containing protein  42.38 
 
 		 307 aa  122  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4184  thioesterase domain-containing protein  42.38 
 
 		 307 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4152  thioesterase domain protein  41.06 
 
 		 313 aa  121  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4499  thioesterase domain protein  41.06 
 
 		 313 aa  120  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4366  acetyltransferase, GNAT family  39.07 
 
 		 313 aa  120  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4216  thioesterase domain protein  40.4 
 
 		 313 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4090  thioesterase domain-containing protein  39.07 
 
 		 329 aa  117  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5335  acetyltransferase, GNAT family  38.41 
 
 		 329 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.251571 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03722  hypothetical protein  38.41 
 
 		 329 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.645417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4411  thioesterase/acetyltransferase domain-containing protein  38.41 
 
 		 313 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03773  putative acetyltransferase  38.41 
 
 		 329 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4130  thioesterase domain-containing protein  38.41 
 
 		 313 aa  117  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.480913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4273  acetyltransferase  38.41 
 
 		 313 aa  117  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4098  thioesterase domain protein  38.41 
 
 		 313 aa  117  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4113  acetyltransferase  38.41 
 
 		 313 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3949  thioesterase domain-containing protein  40.71 
 
 		 308 aa  114  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4353  GNAT family acetyltransferase  37.75 
 
 		 313 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4418  GNAT family acetyltransferase  37.75 
 
 		 329 aa  113  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0993621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4262  acetyltransferase, gnat family  37.75 
 
 		 329 aa  113  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4240  acetyltransferase, gnat family  37.75 
 
 		 329 aa  113  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4307  acetyltransferase, gnat family  37.75 
 
 		 329 aa  113  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.913175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03531  fused GNAT family acetyltransferase/PaaI-related uncharacterized conserved domain  39.86 
 
 		 304 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123025  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001898  galactoside O-acetyltransferase  39.16 
 
 		 305 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00595  acetyltransferase  39.86 
 
 		 300 aa  103  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2312  hypothetical protein  38.89 
 
 		 310 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0902  acetyltransferase  41.38 
 
 		 298 aa  101  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4876  thioesterase domain-containing protein  38.46 
 
 		 314 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372984 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2936  putative acyltransferase  38.97 
 
 		 299 aa  97.1  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2722  thioesterase domain protein  35.71 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0132  thioesterase domain protein  34.56 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0142583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0277  thioesterase domain-containing protein  33.33 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03973  thioesterase domain, putative subfamily  33.08 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0287  thioesterase domain-containing protein  32.62 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2158  thioesterase, putative  26.67 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4948  thioesterase domain-containing protein  31.21 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625869  hitchhiker  0.0000169868 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1791  thioesterase domain protein  25.19 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4939  hypothetical protein  35.16 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1324  thioesterase domain-containing protein  31.72 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.317856  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5400  hypothetical protein  36.36 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1720  thioesterase domain protein  24.44 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0960141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0286  thioesterase, putative  29.79 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3028  hypothetical protein  29.45 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1355  hypothetical protein  28.44 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749221  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0274  thioesterase domain-containing protein  30.23 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>