63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0287 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0287  thioesterase domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  315  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0277  thioesterase domain-containing protein  96.03 
 
 		 151 aa  302  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0262  hypothetical protein  96.03 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0142583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4948  thioesterase domain-containing protein  90.07 
 
 		 151 aa  286  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625869  hitchhiker  0.0000169868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0286  thioesterase, putative  74.83 
 
 		 151 aa  241  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5400  hypothetical protein  71.53 
 
 		 158 aa  222  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4939  hypothetical protein  68.71 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1720  thioesterase domain protein  41.41 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0960141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2158  thioesterase, putative  42.31 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1791  thioesterase domain protein  40.32 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03973  thioesterase domain, putative subfamily  35.14 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0132  thioesterase domain protein  34.9 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2722  thioesterase domain protein  27.59 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3028  hypothetical protein  32 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4614  thioesterase domain-containing protein  32.68 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03531  fused GNAT family acetyltransferase/PaaI-related uncharacterized conserved domain  30.99 
 
 		 304 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0306  thioesterase domain-containing protein  33.33 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00971414  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1324  thioesterase domain-containing protein  32.19 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.317856  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4152  thioesterase domain protein  32.64 
 
 		 313 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3905  thioesterase domain-containing protein  30.07 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000215203  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0333  thioesterase domain-containing protein  33.57 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4397  acetyltransferase  32.62 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4098  thioesterase domain protein  31.51 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4366  acetyltransferase, GNAT family  31.51 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5335  acetyltransferase, GNAT family  30.56 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.251571 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03722  hypothetical protein  30.56 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.645417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4273  acetyltransferase  31.51 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4130  thioesterase domain-containing protein  31.51 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.480913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4411  thioesterase/acetyltransferase domain-containing protein  31.51 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03773  putative acetyltransferase  30.56 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871645  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4113  acetyltransferase  31.51 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4499  thioesterase domain protein  32.64 
 
 		 313 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0032  acetyltransferase domain-containing protein  34.25 
 
 		 307 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0037  acetyltransferase domain-containing protein  34.25 
 
 		 307 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4184  thioesterase domain-containing protein  34.25 
 
 		 307 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3704  thioesterase domain-containing protein  33.8 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120731  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3949  thioesterase domain-containing protein  35.79 
 
 		 308 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3541  thioesterase domain-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4216  thioesterase domain protein  31.94 
 
 		 313 aa  67  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3955  thioesterase domain protein  32.64 
 
 		 313 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2936  putative acyltransferase  28.38 
 
 		 299 aa  67  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0274  thioesterase domain-containing protein  32.68 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0324  thioesterase domain protein  32.17 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4418  GNAT family acetyltransferase  31.25 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0993621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4262  acetyltransferase, gnat family  31.25 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4240  acetyltransferase, gnat family  31.25 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4353  GNAT family acetyltransferase  31.25 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4307  acetyltransferase, gnat family  31.25 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.913175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4090  thioesterase domain-containing protein  31.08 
 
 		 329 aa  65.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0315  thioesterase domain-containing protein  34.51 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00708885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0320  thioesterase domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0420  thioesterase domain-containing protein  29.08 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0319  thioesterase domain-containing protein  31.47 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00732818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0318  thioesterase domain-containing protein  31.47 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000336886  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0902  acetyltransferase  32.41 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0323  thioesterase domain-containing protein  31.47 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.42127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3401  acetyltransferase  32.17 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001898  galactoside O-acetyltransferase  31.25 
 
 		 305 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00595  acetyltransferase  30.56 
 
 		 300 aa  60.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4876  thioesterase domain-containing protein  36.26 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3446  thioesterase, putative  30.61 
 
 		 192 aa  57  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000290362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1355  hypothetical protein  33.62 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749221  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2312  hypothetical protein  29.17 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>