62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3446 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3446  thioesterase, putative  100 
 
 		 192 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000290362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3905  thioesterase domain-containing protein  52.38 
 
 		 149 aa  177  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000215203  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4397  acetyltransferase  53.99 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3541  thioesterase domain-containing protein  52.47 
 
 		 156 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0324  thioesterase domain protein  52.38 
 
 		 150 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0323  thioesterase domain-containing protein  52.38 
 
 		 150 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.42127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0319  thioesterase domain-containing protein  52.38 
 
 		 150 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00732818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0318  thioesterase domain-containing protein  52.38 
 
 		 150 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000336886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0320  thioesterase domain-containing protein  55.21 
 
 		 145 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3704  thioesterase domain-containing protein  55.21 
 
 		 145 aa  164  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120731  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0333  thioesterase domain-containing protein  51.88 
 
 		 164 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0306  thioesterase domain-containing protein  50.31 
 
 		 157 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00971414  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0420  thioesterase domain-containing protein  50.62 
 
 		 149 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0315  thioesterase domain-containing protein  55.21 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00708885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4614  thioesterase domain-containing protein  49.06 
 
 		 158 aa  161  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3401  acetyltransferase  49.08 
 
 		 147 aa  154  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0902  acetyltransferase  37.23 
 
 		 298 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03531  fused GNAT family acetyltransferase/PaaI-related uncharacterized conserved domain  37.82 
 
 		 304 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3949  thioesterase domain-containing protein  38.31 
 
 		 308 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00595  acetyltransferase  36.9 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4418  GNAT family acetyltransferase  34.73 
 
 		 329 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0993621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4262  acetyltransferase, gnat family  34.73 
 
 		 329 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4240  acetyltransferase, gnat family  34.73 
 
 		 329 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4353  GNAT family acetyltransferase  34.73 
 
 		 313 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4307  acetyltransferase, gnat family  34.73 
 
 		 329 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.913175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3955  thioesterase domain protein  35.33 
 
 		 313 aa  101  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4366  acetyltransferase, GNAT family  33.53 
 
 		 313 aa  100  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4152  thioesterase domain protein  35.93 
 
 		 313 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001898  galactoside O-acetyltransferase  37.42 
 
 		 305 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0032  acetyltransferase domain-containing protein  34.73 
 
 		 307 aa  99.4  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4184  thioesterase domain-containing protein  34.73 
 
 		 307 aa  99.4  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0037  acetyltransferase domain-containing protein  34.73 
 
 		 307 aa  99.4  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4090  thioesterase domain-containing protein  33.53 
 
 		 329 aa  99  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03722  hypothetical protein  32.74 
 
 		 329 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.645417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03773  putative acetyltransferase  32.74 
 
 		 329 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5335  acetyltransferase, GNAT family  32.74 
 
 		 329 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.251571 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4098  thioesterase domain protein  32.95 
 
 		 313 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4273  acetyltransferase  32.95 
 
 		 313 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4130  thioesterase domain-containing protein  32.95 
 
 		 313 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.480913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4411  thioesterase/acetyltransferase domain-containing protein  32.74 
 
 		 313 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4113  acetyltransferase  32.95 
 
 		 313 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4216  thioesterase domain protein  35.33 
 
 		 313 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4499  thioesterase domain protein  34.73 
 
 		 313 aa  95.5  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2936  putative acyltransferase  33.53 
 
 		 299 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2312  hypothetical protein  40 
 
 		 310 aa  92  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4876  thioesterase domain-containing protein  34.13 
 
 		 314 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372984 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2722  thioesterase domain protein  28.57 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4939  hypothetical protein  35.87 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0132  thioesterase domain protein  30.77 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5400  hypothetical protein  34.26 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1324  thioesterase domain-containing protein  38.3 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.317856  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0286  thioesterase, putative  33.33 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03973  thioesterase domain, putative subfamily  30.82 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4948  thioesterase domain-containing protein  26.98 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625869  hitchhiker  0.0000169868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0277  thioesterase domain-containing protein  30.61 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0262  hypothetical protein  30.61 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0142583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0287  thioesterase domain-containing protein  30.61 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0274  thioesterase domain-containing protein  33.33 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2158  thioesterase, putative  21.71 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1720  thioesterase domain protein  22.37 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0960141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1791  thioesterase domain protein  22.37 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1355  hypothetical protein  25.17 
 
 		 159 aa  41.6  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>