63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0262 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0262  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  313  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0142583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0277  thioesterase domain-containing protein  98.68 
 
 
151 aa  310  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0287  thioesterase domain-containing protein  96.03 
 
 
151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4948  thioesterase domain-containing protein  90.73 
 
 
151 aa  289  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625869  hitchhiker  0.0000169868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0286  thioesterase, putative  74.17 
 
 
151 aa  238  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5400  hypothetical protein  73.61 
 
 
158 aa  227  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4939  hypothetical protein  70.75 
 
 
157 aa  224  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1720  thioesterase domain protein  40.97 
 
 
151 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0960141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2158  thioesterase, putative  41.78 
 
 
151 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1791  thioesterase domain protein  40 
 
 
151 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2722  thioesterase domain protein  28.97 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3028  hypothetical protein  34.25 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03973  thioesterase domain, putative subfamily  34.46 
 
 
180 aa  83.6  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0132  thioesterase domain protein  35.92 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03531  fused GNAT family acetyltransferase/PaaI-related uncharacterized conserved domain  34.51 
 
 
304 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0306  thioesterase domain-containing protein  35.51 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00971414  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4614  thioesterase domain-containing protein  33.57 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4397  acetyltransferase  33.33 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3704  thioesterase domain-containing protein  33.8 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120731  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3949  thioesterase domain-containing protein  36.84 
 
 
308 aa  70.1  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1324  thioesterase domain-containing protein  32.88 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.317856  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0333  thioesterase domain-containing protein  32.17 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3905  thioesterase domain-containing protein  30.07 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000215203  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2936  putative acyltransferase  29.05 
 
 
299 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3955  thioesterase domain protein  31.69 
 
 
313 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3541  thioesterase domain-containing protein  33.33 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0315  thioesterase domain-containing protein  34.51 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00708885  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0320  thioesterase domain-containing protein  33.1 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127147  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0324  thioesterase domain protein  32.17 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304239  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0274  thioesterase domain-containing protein  31.37 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4152  thioesterase domain protein  30.28 
 
 
313 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3401  acetyltransferase  32.87 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0319  thioesterase domain-containing protein  31.47 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00732818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0318  thioesterase domain-containing protein  31.47 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000336886  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0323  thioesterase domain-containing protein  31.47 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.42127  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4098  thioesterase domain protein  28.87 
 
 
313 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5335  acetyltransferase, GNAT family  28.87 
 
 
329 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.251571 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03722  hypothetical protein  28.87 
 
 
329 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.645417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4130  thioesterase domain-containing protein  28.87 
 
 
313 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.480913  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03773  putative acetyltransferase  28.87 
 
 
329 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871645  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4113  acetyltransferase  28.87 
 
 
313 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4411  thioesterase/acetyltransferase domain-containing protein  28.87 
 
 
313 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4273  acetyltransferase  28.87 
 
 
313 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4499  thioesterase domain protein  30.28 
 
 
313 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4366  acetyltransferase, GNAT family  28.87 
 
 
313 aa  63.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0032  acetyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 
307 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0420  thioesterase domain-containing protein  29.08 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4184  thioesterase domain-containing protein  33.33 
 
 
307 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0037  acetyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 
307 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4216  thioesterase domain protein  29.58 
 
 
313 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0902  acetyltransferase  31.72 
 
 
298 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001898  galactoside O-acetyltransferase  30.99 
 
 
305 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4240  acetyltransferase, gnat family  28.87 
 
 
329 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00595  acetyltransferase  30.28 
 
 
300 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4262  acetyltransferase, gnat family  28.87 
 
 
329 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4418  GNAT family acetyltransferase  28.87 
 
 
329 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0993621  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4353  GNAT family acetyltransferase  28.87 
 
 
313 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449185  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4307  acetyltransferase, gnat family  28.87 
 
 
329 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.913175  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4090  thioesterase domain-containing protein  28.77 
 
 
329 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4876  thioesterase domain-containing protein  36.26 
 
 
314 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000372984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3446  thioesterase, putative  30.61 
 
 
192 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000290362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1355  hypothetical protein  32.76 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749221  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2312  hypothetical protein  28.17 
 
 
310 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>