155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4273 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03773  putative acetyltransferase  100 
 
 
329 aa  654    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871645  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4098  thioesterase domain protein  100 
 
 
313 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03722  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  654    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.645417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5335  acetyltransferase, GNAT family  100 
 
 
329 aa  654    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.251571 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4113  acetyltransferase  100 
 
 
313 aa  652    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4411  thioesterase/acetyltransferase domain-containing protein  99.68 
 
 
313 aa  652    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4130  thioesterase domain-containing protein  100 
 
 
313 aa  652    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.480913  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4273  acetyltransferase  100 
 
 
313 aa  652    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4366  acetyltransferase, GNAT family  99.68 
 
 
313 aa  649    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4418  GNAT family acetyltransferase  94.25 
 
 
329 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0993621  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4090  thioesterase domain-containing protein  92.65 
 
 
329 aa  613  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4353  GNAT family acetyltransferase  94.57 
 
 
313 aa  604  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449185  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4240  acetyltransferase, gnat family  94.57 
 
 
329 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4262  acetyltransferase, gnat family  94.57 
 
 
329 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4307  acetyltransferase, gnat family  94.57 
 
 
329 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.913175  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4216  thioesterase domain protein  83.6 
 
 
313 aa  559  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4499  thioesterase domain protein  82.32 
 
 
313 aa  552  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4152  thioesterase domain protein  83.23 
 
 
313 aa  548  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0032  acetyltransferase domain-containing protein  83.89 
 
 
307 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0037  acetyltransferase domain-containing protein  83.89 
 
 
307 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4184  thioesterase domain-containing protein  83.89 
 
 
307 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4876  thioesterase domain-containing protein  83.28 
 
 
314 aa  528  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000372984 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3955  thioesterase domain protein  79.19 
 
 
313 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001898  galactoside O-acetyltransferase  50.34 
 
 
305 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00595  acetyltransferase  50.67 
 
 
300 aa  333  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2936  putative acyltransferase  49.66 
 
 
299 aa  327  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2312  hypothetical protein  50.34 
 
 
310 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3949  thioesterase domain-containing protein  40.6 
 
 
308 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03531  fused GNAT family acetyltransferase/PaaI-related uncharacterized conserved domain  41.95 
 
 
304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123025  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0902  acetyltransferase  40.74 
 
 
298 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0315  thioesterase domain-containing protein  41.01 
 
 
145 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00708885  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0306  thioesterase domain-containing protein  42.86 
 
 
157 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00971414  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0320  thioesterase domain-containing protein  41.01 
 
 
145 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127147  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0319  thioesterase domain-containing protein  42.45 
 
 
150 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00732818  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3905  thioesterase domain-containing protein  41.18 
 
 
149 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000215203  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0323  thioesterase domain-containing protein  42.45 
 
 
150 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.42127  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0324  thioesterase domain protein  42.45 
 
 
150 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304239  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4397  acetyltransferase  38.41 
 
 
145 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0318  thioesterase domain-containing protein  42.45 
 
 
150 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000336886  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3704  thioesterase domain-containing protein  41.73 
 
 
145 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120731  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0333  thioesterase domain-containing protein  37.86 
 
 
164 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3401  acetyltransferase  41.73 
 
 
147 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0420  thioesterase domain-containing protein  43.17 
 
 
149 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3541  thioesterase domain-containing protein  39.57 
 
 
156 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4614  thioesterase domain-containing protein  39.29 
 
 
158 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3446  thioesterase, putative  32.74 
 
 
192 aa  98.2  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000290362  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2158  thioesterase, putative  33.82 
 
 
151 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0274  thioesterase domain-containing protein  26.62 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1720  thioesterase domain protein  32.59 
 
 
151 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0960141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0287  thioesterase domain-containing protein  30.56 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1791  thioesterase domain protein  29.79 
 
 
151 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2722  thioesterase domain protein  25.69 
 
 
148 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4948  thioesterase domain-containing protein  29.58 
 
 
151 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625869  hitchhiker  0.0000169868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3035  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
152 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1324  thioesterase domain-containing protein  27.14 
 
 
150 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.317856  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0277  thioesterase domain-containing protein  29.86 
 
 
151 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0262  hypothetical protein  28.87 
 
 
151 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0142583 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4939  hypothetical protein  34.91 
 
 
157 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1330  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
146 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0879736  normal  0.150143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0286  thioesterase, putative  27.46 
 
 
151 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 
147 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1843  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
159 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  35.05 
 
 
292 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 
147 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5400  hypothetical protein  34.69 
 
 
158 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03973  thioesterase domain, putative subfamily  27.12 
 
 
180 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  35.58 
 
 
138 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 
141 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1624  acetyltransferase  30.3 
 
 
161 aa  53.5  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0132  thioesterase domain protein  29.63 
 
 
155 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5274  GCN5-related N-acetyltransferase  38.96 
 
 
137 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3245  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 
142 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4357  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 
143 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4334  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 
143 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0217  N-acetylglutamate synthase  36.47 
 
 
196 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1708  acetyltransferase  30 
 
 
150 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1013  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
135 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3419  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
189 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2879  N-acetylglutamate synthase  42.03 
 
 
191 aa  50.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00976241  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1915  putative acetyltransferase  32.26 
 
 
141 aa  49.7  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  28.8 
 
 
162 aa  49.7  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2490  acetyltransferase, GNAT family  27.01 
 
 
144 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000166015  normal  0.210823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  30.93 
 
 
287 aa  49.3  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2799  acetyltransferase, GNAT family  25.34 
 
 
144 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0439  transketolase  26.02 
 
 
146 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2358  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
180 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05633  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2946  acetyltransferase  28.93 
 
 
150 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2061  acetyltransferase  30 
 
 
149 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450214  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2701  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
181 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.905415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1947  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
159 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4202  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
143 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1429  GCN5-related N-acetyltransferase  29.06 
 
 
142 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.097269  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4479  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
186 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
289 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13050  N-acetylglutamate synthase  33.33 
 
 
169 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3246  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 
141 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1830  phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribotide isomerase  34.72 
 
 
389 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2802  acetyltransferase, GNAT family  26.28 
 
 
144 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283335  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1730  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
157 aa  47  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.421002 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>