More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_860 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_860  acetyltransferase, GNAT family  100 
 
 
144 aa  300  5.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0788969  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0988  acetyltransferase  79.17 
 
 
144 aa  243  9e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0199888  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0879  GCN5-related N-acetyltransferase  75.24 
 
 
105 aa  167  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0544  GCN5-related N-acetyltransferase  41.01 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1113  GCN5-related N-acetyltransferase  38.97 
 
 
144 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00477349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1136  GCN5-related N-acetyltransferase  38.97 
 
 
144 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00122389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2597  GCN5-related N-acetyltransferase  35.97 
 
 
144 aa  97.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00223569  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0718  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  39.69 
 
 
144 aa  93.6  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.268987  normal  0.639753 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3245  GCN5-related N-acetyltransferase  39.85 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2802  acetyltransferase, GNAT family  36.43 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 
145 aa  92  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  39.01 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.595635 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2823  acetyltransferase  34.56 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000798429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2522  acetyltransferase  34.88 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0369491  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2938  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
177 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0637  acetyltransferase  34.51 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000598553  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0280  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.539366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2490  acetyltransferase, GNAT family  34.53 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000166015  normal  0.210823 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2844  acetyltransferase, GNAT family  34.88 
 
 
144 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0189947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2555  acetyltransferase  34.11 
 
 
144 aa  88.6  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0530574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2603  acetyltransferase  34.11 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.280255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2799  acetyltransferase, GNAT family  34.11 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134155 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2792  acetyltransferase  34.11 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.7554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0647  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4357  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744506  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2943  GCN5-related N-acetyltransferase  38.4 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.8 
 
 
285 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4202  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4334  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0042  acetyltransferase  36.72 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  35.77 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5884  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  35.83 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1673  acyltransferase-like  31.75 
 
 
320 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 
521 aa  81.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1339  GCN5-related N-acetyltransferase  29.84 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1915  putative acetyltransferase  35.2 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0688  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0716  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.795595  normal  0.113165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1282  acetyltransferase, GNAT family  34.59 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1308  acetyltransferase, GNAT family  34.59 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000157971 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1147  acetyltransferase  34.59 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1128  acetyltransferase  34.59 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1121  acetyltransferase  34.59 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4062  acetyltransferase, GNAT family  34.59 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.048127  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1240  acetyltransferase  34.59 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.797535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1347  acetyltransferase  34.59 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1385  acetyltransferase, GNAT family  34.59 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00609559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0919  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.441761  normal  0.570602 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  36.5 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1134  GCN5-related N-acetyltransferase  33.83 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415058  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  36.72 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.53 
 
 
289 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  37.3 
 
 
289 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1303  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06024  acetyltransferase  34.81 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0771  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  38.58 
 
 
287 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540179  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2995  GCN5-related N-acetyltransferase  35.11 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  38.58 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0049  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1016  GCN5-related N-acetyltransferase  35.04 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  35.2 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1114  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  36.46 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1330  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0879736  normal  0.150143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10100  predicted acyltransferase  34.88 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.374622  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 
286 aa  70.1  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2599  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1069  acetyltransferase  34.62 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3270  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376684 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2986  acetyltransferase, GNAT family  35.38 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0143175  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1417  GCN5-related N-acetyltransferase  34.85 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal  0.0433406 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1116  acetyltransferase  34.07 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0013  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592718  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1654  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.670285  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1634  acetyltransferase  40.98 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.927882 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2843  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2576  putative acetyl transferase  31.67 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3246  GCN5-related N-acetyltransferase  36.72 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3623  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.928868  normal  0.813134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30090  putative acetyl transferase  31.67 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 
292 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2788  GCN5-related N-acetyltransferase  31.39 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.349423  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1127  acetyltransferase  31.39 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  30.77 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3600  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189095  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.688065  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0440  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4351  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.620863 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1805  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.0000000131755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28400  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2861  GCN5-related N-acetyltransferase  31.09 
 
 
417 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.315611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1774  hypothetical protein  32.52 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5865  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1897  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>