161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0125 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0125  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 327 aa  676    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0299  asparaginase  72.31 
 
 		 321 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6563  N(4)-(beta-N-acetylglucosaminyl)-L-asparaginase  57.93 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2037  N(4)-(beta-N-acetylglucosaminyl)-L-asparaginase  55.12 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01618  N(4)-(Beta-N-acetylglucosaminyl)-L-asparaginase (Glycosylasparaginase) (Aspartylglucosaminidase) (N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)-L-asparagine amidase) (AGA)  55.92 
 
 		 389 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.649932  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5698  N(4)-(beta-N-acetylglucosaminyl)-L-asparaginase  54.44 
 
 		 340 aa  355  5.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2594  N(4)-(beta-N-acetylglucosaminyl)-L-asparaginase  54.46 
 
 		 342 aa  342  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1344  N(4)-(beta-N-acetylglucosaminyl)-L-asparaginase  56.44 
 
 		 305 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1767  N(4)-(beta-N-acetylglucosaminyl)-L-asparaginase  56.85 
 
 		 332 aa  318  9e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250239 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08716  asparaginase  49.68 
 
 		 334 aa  303  4.0000000000000003e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0602  glycosylasparaginase  37.6 
 
 		 402 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1433  asparaginase  37.79 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0678483  normal  0.307578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2511  asparaginase  40.82 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1658  glycosylasparaginase  36.59 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0347574  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0353  Asparaginase  40.58 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0874  Asparaginase  39.41 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0748  asparaginase  36.64 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.292894  decreased coverage  0.000158237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4430  asparaginase  35.93 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2982  peptidase T2, asparaginase 2  35.38 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.783543  normal  0.134887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0550  peptidase T2, asparaginase 2  35.61 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1070  Asparaginase  39.33 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0602947  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2851  asparaginase  37.11 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1593  Asparaginase  38.89 
 
 		 300 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1000  peptidase T2, asparaginase 2  34.04 
 
 		 315 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.918613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0839  Asparaginase  35.02 
 
 		 329 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174008 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2284  asparaginase  36.67 
 
 		 301 aa  149  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1612  Asparaginase  38.37 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0104  asparaginase  33.22 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5681  peptidase T2 asparaginase 2  37.4 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0841  peptidase T2, asparaginase 2  36 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0241513  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0343  asparaginase  32.89 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.303998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1498  Asparaginase  42.27 
 
 		 300 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1503  asparaginase  36.86 
 
 		 310 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.606949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0977  L-asparaginase  38.84 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0998  L-asparaginase  38.39 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0888  L-asparaginase  38.39 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.898156  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0948  L-asparaginase  38.39 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0915  L-asparaginase  37.95 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1322  L-asparaginase  39.91 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4448  peptidase T2 asparaginase 2  36.36 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2366  peptidase T2, asparaginase 2  37.74 
 
 		 300 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.532674  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0141  peptidase T2 asparaginase 2  37.77 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.122192  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1445  peptidase T2, asparaginase 2  39.61 
 
 		 344 aa  133  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4114  peptidase T2 asparaginase 2  36.25 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1576  peptidase T2 asparaginase 2  36.95 
 
 		 353 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1549  peptidase T2 asparaginase 2  38.86 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3976  peptidase T2 asparaginase 2  38.94 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4403  peptidase T2 asparaginase 2  35.83 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2171  peptidase T2, asparaginase 2  37.32 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4155  Beta-aspartyl-peptidase  34.92 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2814  peptidase T2 asparaginase 2  36.24 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137606  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00795  L-asparaginase  36.24 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002289  asp-X dipeptidase  37.93 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0809544  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0899  L-asparaginase  36.24 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0853  L-asparaginase  36.24 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00812  hypothetical protein  36.24 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3084  peptidase T2 asparaginase 2  36.54 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2520  L-asparaginase  36.24 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4294  peptidase T2 asparaginase 2  37.61 
 
 		 335 aa  129  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1393  L-asparaginase  32.58 
 
 		 344 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.414746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2115  asparaginase family protein  41.58 
 
 		 326 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1122  peptidase T2 asparaginase 2  38.29 
 
 		 338 aa  129  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.4764  hitchhiker  0.00175948 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1904  peptidase T2 asparaginase 2  40.1 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2389  peptidase T2 asparaginase 2  39.6 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.858086  normal  0.179697 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1369  peptidase T2 asparaginase 2  34.22 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.910347  normal  0.265326 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1111  asparaginase family protein  34.47 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1937  peptidase T2 asparaginase 2  39.6 
 
 		 326 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1895  peptidase T2, asparaginase 2  41.09 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1930  peptidase T2 asparaginase 2  39.6 
 
 		 343 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2816  L-asparaginase  35.81 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0886  L-asparaginase  35.81 
 
 		 321 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1837  peptidase T2, asparaginase 2  40.59 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2140  peptidase T2, asparaginase 2  40.59 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0198242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1898  peptidase T2, asparaginase 2  42.08 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519562  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2435  asparaginase  35.24 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1774  peptidase T2 asparaginase 2  36.36 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2686  peptidase T2 asparaginase 2  33.08 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00065  L-asparaginase  37.07 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1162  peptidase T2, asparaginase 2  33.22 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0970303  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1716  peptidase T2, asparaginase 2  34.66 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.935832  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0555  peptidase T2 asparaginase 2  34.22 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0141  asparaginase  36.1 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1378  L-asparaginase precursor protein  34.87 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4831  peptidase T2 asparaginase 2  38.33 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0741  peptidase T2 asparaginase 2  34.98 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3233  peptidase T2 asparaginase 2  39.69 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163663  normal  0.687988 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2824  peptidase T2, asparaginase 2  36.4 
 
 		 353 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0560418 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0970  asparaginase  34.02 
 
 		 299 aa  119  9e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.125633 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1928  asparaginase  34.45 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270438  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2508  peptidase T2, asparaginase 2  34.96 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.178704  normal  0.567192 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7322  asparaginase  35.42 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1617  asparaginase family protein  35.44 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.202156 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0516  peptidase T2 asparaginase 2  33.88 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4227  asparaginase  31.82 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0630  peptidase T2 asparaginase 2  33.2 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0429768  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3603  peptidase T2 asparaginase 2  31.75 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.0219644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0246  peptidase T2 asparaginase 2  32.68 
 
 		 363 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0908  peptidase T2, asparaginase 2  33.98 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03725  asparaginase  31.58 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.113674  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02403  Asparaginase family protein  33.85 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>