161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02403 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02403  Asparaginase family protein  100 
 
 
347 aa  705    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2686  peptidase T2 asparaginase 2  57.27 
 
 
352 aa  371  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2389  peptidase T2 asparaginase 2  56.51 
 
 
343 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.858086  normal  0.179697 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1617  asparaginase family protein  59.38 
 
 
327 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.202156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1930  peptidase T2 asparaginase 2  56.51 
 
 
343 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1837  peptidase T2, asparaginase 2  55.62 
 
 
343 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2140  peptidase T2, asparaginase 2  55.62 
 
 
343 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0198242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1904  peptidase T2 asparaginase 2  56.21 
 
 
343 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1898  peptidase T2, asparaginase 2  55.92 
 
 
343 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519562  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2435  asparaginase  52.84 
 
 
361 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1895  peptidase T2, asparaginase 2  55.62 
 
 
343 aa  363  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221769 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1937  peptidase T2 asparaginase 2  56.92 
 
 
326 aa  361  8e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2115  asparaginase family protein  56.92 
 
 
326 aa  360  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2171  peptidase T2, asparaginase 2  54.39 
 
 
348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2508  peptidase T2, asparaginase 2  54.19 
 
 
352 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.178704  normal  0.567192 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4722  asparaginase  56.34 
 
 
342 aa  354  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1445  peptidase T2, asparaginase 2  57.28 
 
 
344 aa  349  3e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0246  peptidase T2 asparaginase 2  51.58 
 
 
363 aa  333  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1576  peptidase T2 asparaginase 2  49.71 
 
 
353 aa  322  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1612  Asparaginase  51.38 
 
 
338 aa  319  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03725  asparaginase  50.73 
 
 
356 aa  319  5e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.113674  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4294  peptidase T2 asparaginase 2  50.97 
 
 
335 aa  305  7e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000452249  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1162  peptidase T2, asparaginase 2  49.85 
 
 
354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0970303  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1111  asparaginase family protein  50 
 
 
343 aa  295  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3976  peptidase T2 asparaginase 2  49.53 
 
 
320 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3084  peptidase T2 asparaginase 2  48.69 
 
 
312 aa  288  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0886  L-asparaginase  52.51 
 
 
321 aa  288  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4403  peptidase T2 asparaginase 2  51.34 
 
 
315 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2816  L-asparaginase  52.51 
 
 
321 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00795  L-asparaginase  52.17 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2814  peptidase T2 asparaginase 2  52.17 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137606  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0899  L-asparaginase  52.17 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00812  hypothetical protein  52.17 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0853  L-asparaginase  52.17 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4114  peptidase T2 asparaginase 2  51.01 
 
 
315 aa  286  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0948  L-asparaginase  51.69 
 
 
313 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0998  L-asparaginase  51.69 
 
 
313 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0888  L-asparaginase  51.69 
 
 
313 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.898156  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0977  L-asparaginase  51.35 
 
 
313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1322  L-asparaginase  51.88 
 
 
312 aa  283  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4155  Beta-aspartyl-peptidase  50.16 
 
 
306 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1549  peptidase T2 asparaginase 2  51.18 
 
 
315 aa  282  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0915  L-asparaginase  51.35 
 
 
313 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2520  L-asparaginase  51.51 
 
 
321 aa  281  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0741  peptidase T2 asparaginase 2  46.5 
 
 
338 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125091  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0630  peptidase T2 asparaginase 2  50 
 
 
311 aa  278  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0429768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0141  peptidase T2 asparaginase 2  46.86 
 
 
319 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.122192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0141  asparaginase  46.3 
 
 
328 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1656  asparaginase  46.81 
 
 
330 aa  276  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1122  peptidase T2 asparaginase 2  49.19 
 
 
338 aa  276  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.4764  hitchhiker  0.00175948 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3233  peptidase T2 asparaginase 2  47.39 
 
 
339 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163663  normal  0.687988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4589  peptidase T2, asparaginase 2  46.62 
 
 
320 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258837  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3001  Beta-aspartyl-peptidase  47.74 
 
 
320 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1716  peptidase T2, asparaginase 2  48.54 
 
 
315 aa  269  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.935832  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2181  putative asparaginase  47.5 
 
 
326 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166152  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3101  peptidase T2, asparaginase 2  49.04 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3245  peptidase T2 asparaginase 2  47.27 
 
 
325 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428959  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3898  peptidase T2, asparaginase 2  46.89 
 
 
339 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2824  peptidase T2, asparaginase 2  46.58 
 
 
353 aa  263  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0560418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4227  asparaginase  44.61 
 
 
340 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1928  asparaginase  45.34 
 
 
324 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270438  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00065  L-asparaginase  47.74 
 
 
313 aa  259  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002289  asp-X dipeptidase  47.1 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0809544  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3603  peptidase T2 asparaginase 2  44.65 
 
 
324 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.0219644 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1869  peptidase T2, asparaginase 2  43.08 
 
 
335 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119371  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4428  asparaginase  45.14 
 
 
329 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445861  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1251  peptidase T2 asparaginase 2  45.25 
 
 
320 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205112  normal  0.873141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0834  peptidase T2, asparaginase 2  45.99 
 
 
330 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1012  peptidase T2 asparaginase 2  45.14 
 
 
426 aa  254  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3132  Asparaginase  46.91 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1378  L-asparaginase precursor protein  45 
 
 
320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2166  peptidase T2, asparaginase 2  45.57 
 
 
333 aa  253  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1317  peptidase T2 asparaginase 2  44.62 
 
 
320 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0193765  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3569  peptidase T2, asparaginase 2  44.48 
 
 
335 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304654  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1111  asparaginase family protein  43.54 
 
 
342 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.756996  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4050  peptidase T2 asparaginase 2  44.17 
 
 
335 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135158  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0516  peptidase T2 asparaginase 2  44.63 
 
 
298 aa  246  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.180348  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3355  peptidase T2 asparaginase 2  43.21 
 
 
333 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.209488  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1393  L-asparaginase  43.1 
 
 
344 aa  241  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.414746  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4205  peptidase T2, asparaginase 2  41.96 
 
 
345 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4161  peptidase T2, asparaginase 2  41.96 
 
 
345 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00224968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1406  asparaginase  44.48 
 
 
322 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0225592  normal  0.0880734 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1771  asparaginase  42.39 
 
 
344 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.483538  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1791  putative L-asparaginase  43.03 
 
 
343 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0326  asparaginase  42.48 
 
 
687 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0405  asparaginase family protein  41.89 
 
 
348 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0236  asparaginase family protein  41.89 
 
 
348 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1362  asparaginase family protein  41.89 
 
 
348 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0443922  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7322  asparaginase  43.41 
 
 
321 aa  235  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1856  asparaginase  41.59 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0973  asparaginase family protein  40.92 
 
 
356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.420006  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3409  peptidase T2, asparaginase 2  51.21 
 
 
275 aa  219  6e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2127  peptidase T2, asparaginase 2  40.39 
 
 
318 aa  209  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13940  asparaginase  41.58 
 
 
321 aa  207  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.885662  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01470  asparaginase  41.06 
 
 
307 aa  199  7e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.666987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4831  peptidase T2 asparaginase 2  41.25 
 
 
292 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1498  Asparaginase  39.8 
 
 
300 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0025  asparaginase  39.09 
 
 
287 aa  185  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1593  Asparaginase  38.16 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0900  asparaginase  37.22 
 
 
310 aa  176  5e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>