161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4114 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4114  peptidase T2 asparaginase 2  100 
 
 		 315 aa  641    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4403  peptidase T2 asparaginase 2  97.78 
 
 		 315 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3976  peptidase T2 asparaginase 2  80.19 
 
 		 320 aa  511  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0141  peptidase T2 asparaginase 2  80.19 
 
 		 319 aa  508  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.122192  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1549  peptidase T2 asparaginase 2  77.07 
 
 		 315 aa  491  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1322  L-asparaginase  66.98 
 
 		 312 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0886  L-asparaginase  65.71 
 
 		 321 aa  418  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2816  L-asparaginase  66.03 
 
 		 321 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1251  peptidase T2 asparaginase 2  64.8 
 
 		 320 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205112  normal  0.873141 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00795  L-asparaginase  65.4 
 
 		 321 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2814  peptidase T2 asparaginase 2  65.4 
 
 		 321 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137606  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00812  hypothetical protein  65.4 
 
 		 321 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0899  L-asparaginase  65.4 
 
 		 321 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0853  L-asparaginase  65.71 
 
 		 321 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4227  asparaginase  61.65 
 
 		 340 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0915  L-asparaginase  65.71 
 
 		 313 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1317  peptidase T2 asparaginase 2  63.86 
 
 		 320 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0193765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0998  L-asparaginase  65.4 
 
 		 313 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0888  L-asparaginase  65.4 
 
 		 313 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.898156  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0977  L-asparaginase  65.4 
 
 		 313 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2520  L-asparaginase  64.76 
 
 		 321 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0948  L-asparaginase  65.08 
 
 		 313 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1378  L-asparaginase precursor protein  63.55 
 
 		 320 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1928  asparaginase  63.14 
 
 		 324 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270438  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0834  peptidase T2, asparaginase 2  61.09 
 
 		 330 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3898  peptidase T2, asparaginase 2  59.82 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3132  Asparaginase  60.18 
 
 		 330 aa  384  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0141  asparaginase  60.87 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1869  peptidase T2, asparaginase 2  57.1 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119371  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1406  asparaginase  62.73 
 
 		 322 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0225592  normal  0.0880734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3001  Beta-aspartyl-peptidase  58.47 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3245  peptidase T2 asparaginase 2  61.22 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1111  asparaginase family protein  57.52 
 
 		 342 aa  361  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.756996  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4428  asparaginase  59.08 
 
 		 329 aa  359  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4589  peptidase T2, asparaginase 2  57.96 
 
 		 320 aa  358  7e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258837  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3569  peptidase T2, asparaginase 2  57.1 
 
 		 335 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304654  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1656  asparaginase  60.44 
 
 		 330 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3355  peptidase T2 asparaginase 2  57.58 
 
 		 333 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.209488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4205  peptidase T2, asparaginase 2  55.85 
 
 		 345 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4161  peptidase T2, asparaginase 2  55.85 
 
 		 345 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00224968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3101  peptidase T2, asparaginase 2  59.01 
 
 		 328 aa  351  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1771  asparaginase  57.77 
 
 		 344 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.483538  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0405  asparaginase family protein  57.1 
 
 		 348 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0236  asparaginase family protein  57.1 
 
 		 348 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1856  asparaginase  57.1 
 
 		 348 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1362  asparaginase family protein  57.1 
 
 		 348 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0443922  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4050  peptidase T2 asparaginase 2  56.5 
 
 		 335 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0326  asparaginase  57.1 
 
 		 687 aa  348  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0973  asparaginase family protein  55.81 
 
 		 356 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.420006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1576  peptidase T2 asparaginase 2  56.91 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1612  Asparaginase  54.67 
 
 		 338 aa  322  8e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1111  asparaginase family protein  52.49 
 
 		 343 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4155  Beta-aspartyl-peptidase  55.84 
 
 		 306 aa  319  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0246  peptidase T2 asparaginase 2  50.61 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03725  asparaginase  51.99 
 
 		 356 aa  316  4e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.113674  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3084  peptidase T2 asparaginase 2  53.35 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1617  asparaginase family protein  51.76 
 
 		 327 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.202156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2171  peptidase T2, asparaginase 2  49.23 
 
 		 348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2686  peptidase T2 asparaginase 2  49.22 
 
 		 352 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4294  peptidase T2 asparaginase 2  52.54 
 
 		 335 aa  295  7e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4722  asparaginase  47.92 
 
 		 342 aa  292  6e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2389  peptidase T2 asparaginase 2  50 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.858086  normal  0.179697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1904  peptidase T2 asparaginase 2  49.69 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1930  peptidase T2 asparaginase 2  49.69 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1937  peptidase T2 asparaginase 2  49.69 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3409  peptidase T2, asparaginase 2  59.77 
 
 		 275 aa  289  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1898  peptidase T2, asparaginase 2  49.38 
 
 		 343 aa  287  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519562  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2508  peptidase T2, asparaginase 2  46.91 
 
 		 352 aa  287  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.178704  normal  0.567192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1837  peptidase T2, asparaginase 2  49.69 
 
 		 343 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1162  peptidase T2, asparaginase 2  48.77 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0970303  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1122  peptidase T2 asparaginase 2  51.51 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.4764  hitchhiker  0.00175948 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02403  Asparaginase family protein  51.01 
 
 		 347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2140  peptidase T2, asparaginase 2  49.69 
 
 		 343 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0198242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2435  asparaginase  48.14 
 
 		 361 aa  286  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1445  peptidase T2, asparaginase 2  47.95 
 
 		 344 aa  285  8e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2115  asparaginase family protein  49.69 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1895  peptidase T2, asparaginase 2  49.69 
 
 		 343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221769 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0630  peptidase T2 asparaginase 2  50.83 
 
 		 311 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0429768  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1393  L-asparaginase  44.69 
 
 		 344 aa  279  5e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.414746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3603  peptidase T2 asparaginase 2  49.2 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.0219644 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2166  peptidase T2, asparaginase 2  49.51 
 
 		 333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2824  peptidase T2, asparaginase 2  49.67 
 
 		 353 aa  271  7e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0560418 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00065  L-asparaginase  51.28 
 
 		 313 aa  271  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0741  peptidase T2 asparaginase 2  49.5 
 
 		 338 aa  269  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1791  putative L-asparaginase  44.37 
 
 		 343 aa  269  5e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002289  asp-X dipeptidase  50.32 
 
 		 317 aa  268  7e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0809544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0516  peptidase T2 asparaginase 2  47.81 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3233  peptidase T2 asparaginase 2  48.41 
 
 		 339 aa  258  8e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163663  normal  0.687988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1012  peptidase T2 asparaginase 2  46.51 
 
 		 426 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2181  putative asparaginase  48.87 
 
 		 326 aa  249  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166152  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1716  peptidase T2, asparaginase 2  49.32 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.935832  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2127  peptidase T2, asparaginase 2  46.77 
 
 		 318 aa  245  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13940  asparaginase  46.46 
 
 		 321 aa  232  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.885662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7322  asparaginase  42.81 
 
 		 321 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01470  asparaginase  42.26 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.666987 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1369  peptidase T2 asparaginase 2  45.12 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.910347  normal  0.265326 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1593  Asparaginase  43.85 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1498  Asparaginase  43.19 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0025  asparaginase  43.34 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0550  peptidase T2, asparaginase 2  40.65 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.116393 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>