161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1406 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1406  asparaginase  100 
 
 		 322 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0225592  normal  0.0880734 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1928  asparaginase  82.72 
 
 		 324 aa  525  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270438  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1251  peptidase T2 asparaginase 2  73.21 
 
 		 320 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205112  normal  0.873141 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1317  peptidase T2 asparaginase 2  72.9 
 
 		 320 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0193765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1378  L-asparaginase precursor protein  73.21 
 
 		 320 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1549  peptidase T2 asparaginase 2  66.77 
 
 		 315 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3132  Asparaginase  70.03 
 
 		 330 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1869  peptidase T2, asparaginase 2  66.26 
 
 		 335 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119371  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0834  peptidase T2, asparaginase 2  70.34 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4227  asparaginase  65.28 
 
 		 340 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4114  peptidase T2 asparaginase 2  63.98 
 
 		 315 aa  411  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4403  peptidase T2 asparaginase 2  63.98 
 
 		 315 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3976  peptidase T2 asparaginase 2  64.06 
 
 		 320 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0141  peptidase T2 asparaginase 2  64.69 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.122192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0141  asparaginase  65.33 
 
 		 328 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3569  peptidase T2, asparaginase 2  66.26 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304654  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3355  peptidase T2 asparaginase 2  66.26 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.209488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4050  peptidase T2 asparaginase 2  66.56 
 
 		 335 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4205  peptidase T2, asparaginase 2  63.31 
 
 		 345 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4161  peptidase T2, asparaginase 2  63.31 
 
 		 345 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00224968 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4428  asparaginase  66.88 
 
 		 329 aa  381  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1111  asparaginase family protein  64.07 
 
 		 342 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.756996  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3898  peptidase T2, asparaginase 2  61.98 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0326  asparaginase  63.24 
 
 		 687 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0405  asparaginase family protein  62.94 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0236  asparaginase family protein  62.94 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1856  asparaginase  62.65 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1771  asparaginase  63.69 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.483538  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1362  asparaginase family protein  62.94 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0443922  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0973  asparaginase family protein  61.49 
 
 		 356 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.420006  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3101  peptidase T2, asparaginase 2  62.93 
 
 		 328 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0977  L-asparaginase  60.25 
 
 		 313 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0998  L-asparaginase  60.25 
 
 		 313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0888  L-asparaginase  60.25 
 
 		 313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.898156  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0948  L-asparaginase  59.94 
 
 		 313 aa  354  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2814  peptidase T2 asparaginase 2  59.32 
 
 		 321 aa  354  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137606  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00795  L-asparaginase  59.32 
 
 		 321 aa  353  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0915  L-asparaginase  59.94 
 
 		 313 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00812  hypothetical protein  59.32 
 
 		 321 aa  353  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0899  L-asparaginase  59.32 
 
 		 321 aa  353  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2816  L-asparaginase  59.32 
 
 		 321 aa  353  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0853  L-asparaginase  59.32 
 
 		 321 aa  353  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0886  L-asparaginase  59.01 
 
 		 321 aa  352  4e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2520  L-asparaginase  58.7 
 
 		 321 aa  349  5e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1322  L-asparaginase  58.07 
 
 		 312 aa  348  8e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3245  peptidase T2 asparaginase 2  60.12 
 
 		 325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3001  Beta-aspartyl-peptidase  58.41 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1656  asparaginase  61.99 
 
 		 330 aa  330  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4589  peptidase T2, asparaginase 2  59.09 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258837  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1576  peptidase T2 asparaginase 2  52.96 
 
 		 353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0246  peptidase T2 asparaginase 2  48.96 
 
 		 363 aa  311  7.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03725  asparaginase  49.21 
 
 		 356 aa  309  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.113674  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1612  Asparaginase  53.12 
 
 		 338 aa  309  4e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1111  asparaginase family protein  52.05 
 
 		 343 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2171  peptidase T2, asparaginase 2  49.84 
 
 		 348 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3084  peptidase T2 asparaginase 2  55.41 
 
 		 312 aa  299  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4155  Beta-aspartyl-peptidase  54.1 
 
 		 306 aa  299  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2686  peptidase T2 asparaginase 2  49.53 
 
 		 352 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2435  asparaginase  47.59 
 
 		 361 aa  295  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1617  asparaginase family protein  50.63 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.202156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2389  peptidase T2 asparaginase 2  49.21 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.858086  normal  0.179697 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1898  peptidase T2, asparaginase 2  49.21 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1904  peptidase T2 asparaginase 2  48.9 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1930  peptidase T2 asparaginase 2  48.9 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1937  peptidase T2 asparaginase 2  48.9 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2508  peptidase T2, asparaginase 2  47.96 
 
 		 352 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.178704  normal  0.567192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3409  peptidase T2, asparaginase 2  62.21 
 
 		 275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1837  peptidase T2, asparaginase 2  48.58 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1445  peptidase T2, asparaginase 2  49.22 
 
 		 344 aa  286  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2140  peptidase T2, asparaginase 2  48.58 
 
 		 343 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0198242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2115  asparaginase family protein  48.58 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1895  peptidase T2, asparaginase 2  48.26 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1122  peptidase T2 asparaginase 2  50.64 
 
 		 338 aa  282  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.4764  hitchhiker  0.00175948 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4294  peptidase T2 asparaginase 2  50.63 
 
 		 335 aa  281  8.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4722  asparaginase  47.19 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3603  peptidase T2 asparaginase 2  51.89 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.0219644 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2166  peptidase T2, asparaginase 2  51.61 
 
 		 333 aa  277  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1162  peptidase T2, asparaginase 2  49.07 
 
 		 354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0970303  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0630  peptidase T2 asparaginase 2  51.46 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0429768  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00065  L-asparaginase  48.43 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0741  peptidase T2 asparaginase 2  49.02 
 
 		 338 aa  267  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3233  peptidase T2 asparaginase 2  52.24 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163663  normal  0.687988 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1393  L-asparaginase  44.27 
 
 		 344 aa  266  4e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.414746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002289  asp-X dipeptidase  48.11 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0809544  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2824  peptidase T2, asparaginase 2  52.92 
 
 		 353 aa  263  4e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0560418 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02403  Asparaginase family protein  45.17 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1791  putative L-asparaginase  43.93 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1716  peptidase T2, asparaginase 2  54.25 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.935832  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2181  putative asparaginase  47.48 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1012  peptidase T2 asparaginase 2  44.59 
 
 		 426 aa  249  6e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0516  peptidase T2 asparaginase 2  47.17 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7322  asparaginase  48.85 
 
 		 321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01470  asparaginase  47.7 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.666987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2127  peptidase T2, asparaginase 2  47.65 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13940  asparaginase  49.84 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.885662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0025  asparaginase  44.22 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1369  peptidase T2 asparaginase 2  46.05 
 
 		 307 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.910347  normal  0.265326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4831  peptidase T2 asparaginase 2  44.95 
 
 		 292 aa  206  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1593  Asparaginase  48.37 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1498  Asparaginase  46.89 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>