161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0246 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0246  peptidase T2 asparaginase 2  100 
 
 
363 aa  738    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1576  peptidase T2 asparaginase 2  57.45 
 
 
353 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03725  asparaginase  57.39 
 
 
356 aa  398  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.113674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1111  asparaginase family protein  56.7 
 
 
343 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1612  Asparaginase  55.46 
 
 
338 aa  362  6e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2435  asparaginase  51.65 
 
 
361 aa  358  9e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2686  peptidase T2 asparaginase 2  52.81 
 
 
352 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4155  Beta-aspartyl-peptidase  53.13 
 
 
306 aa  349  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4227  asparaginase  51.91 
 
 
340 aa  349  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1162  peptidase T2, asparaginase 2  52.34 
 
 
354 aa  347  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0970303  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1898  peptidase T2, asparaginase 2  49.86 
 
 
343 aa  346  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519562  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2508  peptidase T2, asparaginase 2  51.72 
 
 
352 aa  345  6e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.178704  normal  0.567192 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2171  peptidase T2, asparaginase 2  51.23 
 
 
348 aa  345  8e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1837  peptidase T2, asparaginase 2  50 
 
 
343 aa  342  7e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2140  peptidase T2, asparaginase 2  50 
 
 
343 aa  341  9e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0198242 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2389  peptidase T2 asparaginase 2  49.73 
 
 
343 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.858086  normal  0.179697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1904  peptidase T2 asparaginase 2  49.45 
 
 
343 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1937  peptidase T2 asparaginase 2  52.02 
 
 
326 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1930  peptidase T2 asparaginase 2  49.45 
 
 
343 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1895  peptidase T2, asparaginase 2  49.73 
 
 
343 aa  339  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1617  asparaginase family protein  52.98 
 
 
327 aa  338  7e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.202156 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1445  peptidase T2, asparaginase 2  50.55 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02403  Asparaginase family protein  51.4 
 
 
347 aa  336  2.9999999999999997e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2115  asparaginase family protein  51.61 
 
 
326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3976  peptidase T2 asparaginase 2  51.47 
 
 
320 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1549  peptidase T2 asparaginase 2  51.84 
 
 
315 aa  335  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4294  peptidase T2 asparaginase 2  51.76 
 
 
335 aa  333  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000452249  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4722  asparaginase  51.78 
 
 
342 aa  330  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0741  peptidase T2 asparaginase 2  50 
 
 
338 aa  330  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125091  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0141  peptidase T2 asparaginase 2  49.56 
 
 
319 aa  329  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.122192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1928  asparaginase  51.62 
 
 
324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270438  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1122  peptidase T2 asparaginase 2  51.83 
 
 
338 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.4764  hitchhiker  0.00175948 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1317  peptidase T2 asparaginase 2  49.56 
 
 
320 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0193765  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1869  peptidase T2, asparaginase 2  48.81 
 
 
335 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119371  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0834  peptidase T2, asparaginase 2  49.85 
 
 
330 aa  322  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1251  peptidase T2 asparaginase 2  48.68 
 
 
320 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205112  normal  0.873141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1378  L-asparaginase precursor protein  49.25 
 
 
320 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1322  L-asparaginase  49.4 
 
 
312 aa  317  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4114  peptidase T2 asparaginase 2  50.61 
 
 
315 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4403  peptidase T2 asparaginase 2  50.31 
 
 
315 aa  315  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0886  L-asparaginase  48.97 
 
 
321 aa  315  8e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2816  L-asparaginase  48.97 
 
 
321 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0948  L-asparaginase  48.82 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0888  L-asparaginase  48.82 
 
 
313 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.898156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0998  L-asparaginase  48.82 
 
 
313 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0853  L-asparaginase  48.97 
 
 
321 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2814  peptidase T2 asparaginase 2  48.67 
 
 
321 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137606  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0977  L-asparaginase  48.53 
 
 
313 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00795  L-asparaginase  48.67 
 
 
321 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00812  hypothetical protein  48.67 
 
 
321 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0899  L-asparaginase  48.67 
 
 
321 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0915  L-asparaginase  48.53 
 
 
313 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0141  asparaginase  47.76 
 
 
328 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3569  peptidase T2, asparaginase 2  50.29 
 
 
335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304654  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3101  peptidase T2, asparaginase 2  50 
 
 
328 aa  310  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3132  Asparaginase  48.36 
 
 
330 aa  309  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3898  peptidase T2, asparaginase 2  48.81 
 
 
339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2520  L-asparaginase  48.08 
 
 
321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1012  peptidase T2 asparaginase 2  48.68 
 
 
426 aa  304  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2166  peptidase T2, asparaginase 2  51.63 
 
 
333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3084  peptidase T2 asparaginase 2  46.87 
 
 
312 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4205  peptidase T2, asparaginase 2  48.81 
 
 
345 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4161  peptidase T2, asparaginase 2  48.81 
 
 
345 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00224968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3355  peptidase T2 asparaginase 2  48.81 
 
 
333 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.209488  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1111  asparaginase family protein  50.29 
 
 
342 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.756996  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4050  peptidase T2 asparaginase 2  49.55 
 
 
335 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135158  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4589  peptidase T2, asparaginase 2  45.51 
 
 
320 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258837  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3233  peptidase T2 asparaginase 2  49.4 
 
 
339 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163663  normal  0.687988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1656  asparaginase  49.85 
 
 
330 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3245  peptidase T2 asparaginase 2  49.09 
 
 
325 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428959  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0630  peptidase T2 asparaginase 2  47.6 
 
 
311 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0429768  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4428  asparaginase  49.11 
 
 
329 aa  294  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445861  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3001  Beta-aspartyl-peptidase  44.74 
 
 
320 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1771  asparaginase  48.84 
 
 
344 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.483538  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0326  asparaginase  48.28 
 
 
687 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0405  asparaginase family protein  48.97 
 
 
348 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0236  asparaginase family protein  48.97 
 
 
348 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1362  asparaginase family protein  48.97 
 
 
348 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0443922  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1856  asparaginase  48.97 
 
 
348 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0516  peptidase T2 asparaginase 2  44.35 
 
 
298 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.180348  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1406  asparaginase  49.26 
 
 
322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0225592  normal  0.0880734 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0973  asparaginase family protein  47.84 
 
 
356 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.420006  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2824  peptidase T2, asparaginase 2  47.37 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0560418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3603  peptidase T2 asparaginase 2  44.28 
 
 
324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.0219644 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1393  L-asparaginase  46.89 
 
 
344 aa  279  5e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.414746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002289  asp-X dipeptidase  43.79 
 
 
317 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0809544  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1716  peptidase T2, asparaginase 2  46.61 
 
 
315 aa  270  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.935832  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1791  putative L-asparaginase  46.4 
 
 
343 aa  266  4e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00065  L-asparaginase  44.08 
 
 
313 aa  265  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3409  peptidase T2, asparaginase 2  53.93 
 
 
275 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7322  asparaginase  43.47 
 
 
321 aa  258  8e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2181  putative asparaginase  44.57 
 
 
326 aa  258  9e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166152  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2127  peptidase T2, asparaginase 2  42.33 
 
 
318 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13940  asparaginase  40.9 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.885662  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01470  asparaginase  40.85 
 
 
307 aa  224  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.666987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1593  Asparaginase  40.73 
 
 
300 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1498  Asparaginase  40 
 
 
300 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2366  peptidase T2, asparaginase 2  40.61 
 
 
300 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.532674  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0900  asparaginase  39.1 
 
 
310 aa  204  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0025  asparaginase  41.14 
 
 
287 aa  202  7e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>