162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0104 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0104  asparaginase  100 
 
 		 325 aa  635    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0343  asparaginase  80 
 
 		 334 aa  527  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.303998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2511  asparaginase  54.95 
 
 		 304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0874  Asparaginase  57.83 
 
 		 299 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1000  peptidase T2, asparaginase 2  52.26 
 
 		 315 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.918613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0839  Asparaginase  52.34 
 
 		 329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0550  peptidase T2, asparaginase 2  50 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2284  asparaginase  47.35 
 
 		 301 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5681  peptidase T2 asparaginase 2  42.9 
 
 		 307 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1503  asparaginase  49.09 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.606949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4448  peptidase T2 asparaginase 2  43.96 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1593  Asparaginase  48.56 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2882  peptidase T2 asparaginase 2  44.44 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.562831  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1612  Asparaginase  44.14 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1498  Asparaginase  48.56 
 
 		 300 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0555  peptidase T2 asparaginase 2  45.31 
 
 		 283 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1576  peptidase T2 asparaginase 2  41.51 
 
 		 353 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2366  peptidase T2, asparaginase 2  47.28 
 
 		 300 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.532674  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1369  peptidase T2 asparaginase 2  42.15 
 
 		 307 aa  192  8e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.910347  normal  0.265326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3603  peptidase T2 asparaginase 2  42.41 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.0219644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0141  asparaginase  43.67 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1393  L-asparaginase  36.01 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.414746  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4294  peptidase T2 asparaginase 2  42.94 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1111  asparaginase family protein  39.56 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5802  Asparaginase  38.41 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1445  peptidase T2, asparaginase 2  38.41 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4722  asparaginase  35.45 
 
 		 342 aa  179  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3245  peptidase T2 asparaginase 2  43.17 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0516  peptidase T2 asparaginase 2  39.24 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3233  peptidase T2 asparaginase 2  41.8 
 
 		 339 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163663  normal  0.687988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0998  L-asparaginase  38.99 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0888  L-asparaginase  38.99 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.898156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0246  peptidase T2 asparaginase 2  35.96 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0948  L-asparaginase  38.99 
 
 		 313 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4227  asparaginase  40.47 
 
 		 340 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2508  peptidase T2, asparaginase 2  36.97 
 
 		 352 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.178704  normal  0.567192 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00795  L-asparaginase  38.97 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1869  peptidase T2, asparaginase 2  40.06 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119371  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0977  L-asparaginase  38.69 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00812  hypothetical protein  38.97 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0899  L-asparaginase  38.97 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2435  asparaginase  37.01 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0915  L-asparaginase  38.69 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0886  L-asparaginase  38.97 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2816  L-asparaginase  38.97 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0853  L-asparaginase  38.97 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1322  L-asparaginase  39.09 
 
 		 312 aa  172  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2814  peptidase T2 asparaginase 2  38.97 
 
 		 321 aa  172  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137606  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2115  asparaginase family protein  39.26 
 
 		 326 aa  172  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4155  Beta-aspartyl-peptidase  38.05 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2520  L-asparaginase  38.67 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1837  peptidase T2, asparaginase 2  38.32 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3084  peptidase T2 asparaginase 2  39.5 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2140  peptidase T2, asparaginase 2  38.32 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0198242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2171  peptidase T2, asparaginase 2  36.5 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1791  putative L-asparaginase  33.76 
 
 		 343 aa  169  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1895  peptidase T2, asparaginase 2  38.02 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1898  peptidase T2, asparaginase 2  38.15 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519562  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03725  asparaginase  35.08 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.113674  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1317  peptidase T2 asparaginase 2  39.3 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0193765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1162  peptidase T2, asparaginase 2  40.3 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0970303  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3001  Beta-aspartyl-peptidase  40.13 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1122  peptidase T2 asparaginase 2  39.16 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.4764  hitchhiker  0.00175948 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3101  peptidase T2, asparaginase 2  41.51 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1617  asparaginase family protein  37.46 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.202156 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2686  peptidase T2 asparaginase 2  36.04 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0748  asparaginase  40.07 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.292894  decreased coverage  0.000158237 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0741  peptidase T2 asparaginase 2  39.1 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1928  asparaginase  38.55 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270438  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3132  Asparaginase  41.53 
 
 		 330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4430  asparaginase  40.82 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1251  peptidase T2 asparaginase 2  39.3 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205112  normal  0.873141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1549  peptidase T2 asparaginase 2  39.35 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1111  asparaginase family protein  41.82 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.756996  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4589  peptidase T2, asparaginase 2  39.32 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258837  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00065  L-asparaginase  37.15 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1774  peptidase T2 asparaginase 2  38.24 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2389  peptidase T2 asparaginase 2  37.42 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.858086  normal  0.179697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1904  peptidase T2 asparaginase 2  37.12 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1930  peptidase T2 asparaginase 2  38.04 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1937  peptidase T2 asparaginase 2  38.04 
 
 		 326 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4114  peptidase T2 asparaginase 2  38.3 
 
 		 315 aa  162  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002289  asp-X dipeptidase  36.53 
 
 		 317 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0809544  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0834  peptidase T2, asparaginase 2  41.4 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3569  peptidase T2, asparaginase 2  40.12 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304654  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2166  peptidase T2, asparaginase 2  39.62 
 
 		 333 aa  159  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0141  peptidase T2 asparaginase 2  35.78 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.122192  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4050  peptidase T2 asparaginase 2  39.76 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3976  peptidase T2 asparaginase 2  36.07 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0353  Asparaginase  38.33 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0630  peptidase T2 asparaginase 2  37.42 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0429768  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1378  L-asparaginase precursor protein  40 
 
 		 320 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4403  peptidase T2 asparaginase 2  37.39 
 
 		 315 aa  156  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2181  putative asparaginase  37.85 
 
 		 326 aa  156  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166152  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1656  asparaginase  39.43 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3898  peptidase T2, asparaginase 2  38.57 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6563  N(4)-(beta-N-acetylglucosaminyl)-L-asparaginase  37.15 
 
 		 350 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7322  asparaginase  41.09 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0970  asparaginase  38.22 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.125633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3355  peptidase T2 asparaginase 2  39.93 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.209488  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>