More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2138 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2138  ABC transporter related  100 
 
 
215 aa  437  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1956  ABC transporter related  60.56 
 
 
217 aa  262  3e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  9.85727e-19 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1091  ABC transporter related  60.09 
 
 
218 aa  254  7e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00377996  hitchhiker  0.000564642 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1517  ABC transporter related  58.33 
 
 
217 aa  234  7e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.000000000032537 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1712  ATPase  31.51 
 
 
299 aa  100  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0678  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.34 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0637  ABC transporter related  33.18 
 
 
251 aa  99.4  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1467  ABC transporter related protein  33.51 
 
 
219 aa  99  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3800  ABC transporter related  33 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0635  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.51 
 
 
252 aa  97.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  32.51 
 
 
252 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  29.72 
 
 
253 aa  96.7  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  32.63 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  32.71 
 
 
287 aa  96.7  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1605  ABC transporter related  33.17 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.82764  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0650  ABC transporter related protein  29.47 
 
 
277 aa  96.7  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  32.73 
 
 
267 aa  95.9  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  32.11 
 
 
266 aa  95.9  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  32.51 
 
 
262 aa  95.1  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1167  ABC transporter related protein  36.61 
 
 
229 aa  94.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.227464 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  34.15 
 
 
273 aa  95.1  8e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0552  ABC transporter related  31.73 
 
 
206 aa  94.7  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.110356 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  31.86 
 
 
271 aa  94.7  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  31.86 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  31.86 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  31.86 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  31.86 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.39 
 
 
355 aa  94  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  31.19 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  31.86 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0018  ABC transporter-like protein  29.65 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  31.86 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  35.03 
 
 
264 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  31.86 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  31.66 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  35.32 
 
 
265 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2038  ABC transporter related protein  29.74 
 
 
252 aa  93.2  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  32.59 
 
 
264 aa  93.6  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0068  ABC transporter related  30.15 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4147  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  30.15 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.045067  normal  0.0104969 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0281  ABC transporter related protein  32.65 
 
 
393 aa  93.2  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
254 aa  92.8  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1766  ABC transporter related  29.74 
 
 
252 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0708561  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0122  ABC transporter related  38.24 
 
 
250 aa  92  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.102502  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  30.65 
 
 
268 aa  92  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  30.26 
 
 
579 aa  92  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0402  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 
259 aa  92  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  31.61 
 
 
254 aa  91.7  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2134  ABC transporter related protein  31.98 
 
 
368 aa  90.9  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  32.51 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  34.11 
 
 
599 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3500  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, ATPase subunit  38.24 
 
 
279 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2481  ABC transporter, ATP-binding protein  28.96 
 
 
325 aa  90.9  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  34.43 
 
 
396 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4095  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  29.65 
 
 
252 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0212  ABC transporter related  28.07 
 
 
244 aa  90.9  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.701682 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  34.63 
 
 
353 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  31.12 
 
 
267 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  26.92 
 
 
252 aa  90.1  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  33.33 
 
 
259 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  32.83 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0767  molybdate transporter ATP-binding protein  28.77 
 
 
361 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  28.29 
 
 
295 aa  90.5  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2369  ABC transporter related  30.96 
 
 
252 aa  90.1  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.068232 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1157  ABC transporter related  32.24 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  31.07 
 
 
293 aa  90.1  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0216  ABC transporter related  31.2 
 
 
308 aa  90.1  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  29.68 
 
 
367 aa  89.7  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1654  ABC transporter related  33.66 
 
 
225 aa  89.4  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  32.5 
 
 
257 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  32.64 
 
 
246 aa  89.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  32.5 
 
 
257 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  34.93 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  31.96 
 
 
273 aa  89.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  30.41 
 
 
289 aa  89.4  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  29.32 
 
 
247 aa  89.4  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0741  molybdate transporter ATP-binding protein  28.77 
 
 
361 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  30.38 
 
 
259 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  28.38 
 
 
309 aa  89  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  32 
 
 
256 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.57 
 
 
367 aa  89.4  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  33.82 
 
 
353 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1687  ABC transporter related protein  30.32 
 
 
260 aa  89  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  32.31 
 
 
263 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  32.81 
 
 
285 aa  89  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  31.16 
 
 
290 aa  89  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  31.07 
 
 
254 aa  89  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1829  ABC transporter related  32.16 
 
 
328 aa  89  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.853496 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  33.9 
 
 
250 aa  89  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2913  ABC transporter related  30.65 
 
 
250 aa  89  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000412877  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  31.63 
 
 
251 aa  89  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  33.64 
 
 
261 aa  89  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 
357 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 
259 aa  88.6  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0776  ABC transporter related  29.95 
 
 
253 aa  88.6  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.166423  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 
353 aa  88.6  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  31.44 
 
 
262 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0759  ABC transporter related  29.95 
 
 
253 aa  88.6  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0112  ABC transporter related  29.89 
 
 
375 aa  88.6  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.818375  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.06 
 
 
344 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>