More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4381 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2146  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  67.57 
 
 		 492 aa  669    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6141  aldehyde dehydrogenase  70.23 
 
 		 492 aa  686    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.435023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4381  succinate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 485 aa  987    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3859  aldehyde dehydrogenase  68.19 
 
 		 501 aa  659    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0060  succinate semialdehyde dehydrogenase  69.44 
 
 		 507 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.455704  hitchhiker  0.00355427 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5800  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  70.86 
 
 		 492 aa  681    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0865854  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6023  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  71.73 
 
 		 501 aa  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.774984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5779  aldehyde dehydrogenase  71.49 
 
 		 492 aa  670    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0369545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6164  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  70.86 
 
 		 492 aa  681    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.633257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6645  aldehyde dehydrogenase  71.07 
 
 		 492 aa  702    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000636  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  56.54 
 
 		 506 aa  551  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2725  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.25 
 
 		 515 aa  541  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.774266  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.54 
 
 		 482 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.12 
 
 		 483 aa  478  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5232  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  51.15 
 
 		 498 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.88595  normal  0.882474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.32 
 
 		 493 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2417  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.59 
 
 		 525 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.02914  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.96 
 
 		 483 aa  470  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.99 
 
 		 486 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0646  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.74 
 
 		 484 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.868265  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.92 
 
 		 484 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.84 
 
 		 482 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.29 
 
 		 482 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.29 
 
 		 482 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.67 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.29 
 
 		 482 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.67 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  45.83 
 
 		 483 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.67 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.88 
 
 		 509 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.29 
 
 		 482 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.67 
 
 		 482 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  46.78 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.88 
 
 		 482 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.36 
 
 		 485 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.71 
 
 		 489 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.23 
 
 		 496 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.33 
 
 		 493 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.08 
 
 		 482 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.92 
 
 		 482 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  45.83 
 
 		 483 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.43 
 
 		 492 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  46.25 
 
 		 482 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.67 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.46 
 
 		 482 aa  458  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  46.25 
 
 		 482 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.67 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.46 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.57 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.93 
 
 		 485 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.82 
 
 		 482 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.25 
 
 		 482 aa  455  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5500  Aldehyde Dehydrogenase  50.73 
 
 		 498 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 479 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.46 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2291  succinate semialdehyde dehydrogenase  47 
 
 		 485 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.75 
 
 		 483 aa  455  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.25 
 
 		 482 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2692  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.69 
 
 		 491 aa  458  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.41255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.67 
 
 		 482 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.15 
 
 		 480 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.92 
 
 		 482 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.5 
 
 		 489 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.5 
 
 		 489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3471  aldehyde dehydrogenase  51.36 
 
 		 498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.793386  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  47.5 
 
 		 489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.67 
 
 		 489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  47.71 
 
 		 489 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.29 
 
 		 489 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  47.5 
 
 		 489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  47.5 
 
 		 489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  47.5 
 
 		 489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.75 
 
 		 488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3703  aldehyde dehydrogenase  51.57 
 
 		 498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  47.71 
 
 		 482 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1785  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.45 
 
 		 486 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  47.29 
 
 		 489 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  45.62 
 
 		 480 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.88 
 
 		 489 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.3 
 
 		 484 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.88 
 
 		 489 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.88 
 
 		 489 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.17 
 
 		 483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2286  aldehyde dehydrogenase  51.77 
 
 		 490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595022  hitchhiker  0.00886969 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0428  succinic semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 		 486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.29 
 
 		 484 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2637  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  48.23 
 
 		 480 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.602715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.47 
 
 		 481 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.36 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.23 
 
 		 485 aa  443  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.76 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.99 
 
 		 486 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.09 
 
 		 486 aa  444  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  48.32 
 
 		 491 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.4 
 
 		 479 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3225  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.5 
 
 		 486 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00532289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.74 
 
 		 490 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.32 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.74 
 
 		 488 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.19 
 
 		 479 aa  438  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>