155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_64855 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_11125  glycyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05920)  63.35 
 
 		 689 aa  832    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26972  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00730  glycine-tRNA ligase, putative  58.27 
 
 		 699 aa  782    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64855  cyl-tRNA synthase  100 
 
 		 661 aa  1364    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270271 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12730  predicted protein  45.92 
 
 		 677 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.384524 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19761  predicted protein  45.52 
 
 		 702 aa  573  1.0000000000000001e-162  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 579 aa  445  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 577 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 574 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 574 aa  438  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 574 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 575 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 581 aa  419  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 607 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 586 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 557 aa  392  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 		 630 aa  389  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 593 aa  388  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 594 aa  385  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 589 aa  385  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0814  glycyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 573 aa  379  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1419  glycyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 576 aa  369  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1707  glycyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 572 aa  362  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1156  glycyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 		 576 aa  360  6e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0895  glycyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 585 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0336  glycyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 590 aa  347  4e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1628  glycyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 		 588 aa  347  5e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1821  glycyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 585 aa  343  4e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1433  glycyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 583 aa  342  1e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1061  glycyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 573 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.238733  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2213  glycyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 		 571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.472902  hitchhiker  0.00000523773 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1420  glycyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 		 574 aa  265  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  29.81 
 
 		 602 aa  249  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 497 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 485 aa  204  3e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 		 551 aa  194  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 		 466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1774  glycyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 525 aa  162  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.360257  normal  0.456837 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 		 508 aa  160  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 462 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2477  glycyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 		 481 aa  158  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 462 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 		 457 aa  153  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2174  glycyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 507 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0798497  normal  0.636164 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 471 aa  151  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  27.86 
 
 		 458 aa  150  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 458 aa  150  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 458 aa  150  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 458 aa  150  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 458 aa  150  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 458 aa  150  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 458 aa  150  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 458 aa  150  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 458 aa  150  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 		 458 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 460 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2165  glycyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 515 aa  149  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 		 458 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 461 aa  148  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000023951 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1000  glycyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 		 509 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.450604  hitchhiker  0.00350123 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0024  glycyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 488 aa  148  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00479834  normal  0.0124989 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 		 462 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf348  glycyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 		 463 aa  148  4.0000000000000006e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 		 467 aa  146  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1623  glycyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1657  glycyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0024  glycyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.757041 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0023  glycyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 489 aa  144  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1132  glycyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 463 aa  144  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 468 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1330  glycyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 461 aa  144  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 468 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0796  glycyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 		 513 aa  144  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412856  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3249  glycyl-tRNA synthetase  29.07 
 
 		 495 aa  144  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281053  decreased coverage  0.00448945 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1716  glycyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.391991 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 		 530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13710  glycyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 		 467 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0017  glycyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 489 aa  140  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 539 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1379  glycyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 		 516 aa  139  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 		 462 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2743  glycyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 		 478 aa  138  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  27.44 
 
 		 506 aa  138  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 		 462 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0361  glycyl-tRNA synthetase  27.58 
 
 		 496 aa  138  4e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12383  glycyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 463 aa  137  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11840  glycyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000800535  normal  0.839416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13710  glycyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 		 462 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797043  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2058  glycyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 461 aa  137  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  27.3 
 
 		 490 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0036  glycyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 489 aa  135  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.479025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>