228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2213 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1420  glycyl-tRNA synthetase  64.83 
 
 		 574 aa  778    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2213  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 571 aa  1174    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.472902  hitchhiker  0.00000523773 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0336  glycyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 590 aa  499  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1628  glycyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 588 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1433  glycyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 583 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0895  glycyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 585 aa  461  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1821  glycyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 585 aa  451  1e-125  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 574 aa  423  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 574 aa  422  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 589 aa  418  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 575 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 574 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 579 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 586 aa  413  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 594 aa  409  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 581 aa  410  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 577 aa  409  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 607 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 630 aa  403  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 593 aa  405  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 557 aa  400  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1419  glycyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 576 aa  397  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1156  glycyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 576 aa  383  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1707  glycyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 572 aa  381  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0814  glycyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1061  glycyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 573 aa  366  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.238733  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12730  predicted protein  33.95 
 
 		 677 aa  336  5.999999999999999e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.384524 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11125  glycyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05920)  32.84 
 
 		 689 aa  318  2e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64855  cyl-tRNA synthase  32.52 
 
 		 661 aa  316  7e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270271 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00730  glycine-tRNA ligase, putative  32.85 
 
 		 699 aa  316  9e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19761  predicted protein  34.02 
 
 		 702 aa  309  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 497 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 461 aa  286  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0861  glycyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 		 462 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.651582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 		 462 aa  277  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2346  anticodon binding domain protein  32.38 
 
 		 461 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 		 460 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4697  glycyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 459 aa  269  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0020  glycyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 451 aa  266  5.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.485977  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  30.15 
 
 		 602 aa  266  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 462 aa  265  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 		 461 aa  264  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000023951 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0373  glycyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13710  glycyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 		 462 aa  263  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797043  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1926  glycyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 460 aa  263  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0030323  hitchhiker  0.00269107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1330  glycyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 		 461 aa  262  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 458 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 458 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 458 aa  260  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 458 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 458 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 462 aa  260  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 458 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 458 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3249  glycyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 495 aa  259  8e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281053  decreased coverage  0.00448945 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 458 aa  259  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 458 aa  259  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0036  glycyl-tRNA synthetase  32.18 
 
 		 489 aa  258  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.479025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  31.23 
 
 		 530 aa  257  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0023  glycyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 		 489 aa  257  5e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 		 539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0017  glycyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 		 489 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 551 aa  254  4.0000000000000004e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1716  glycyl-tRNA synthetase  31.54 
 
 		 504 aa  253  9.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.391991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0046  glycyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 530 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1266  glycyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 		 461 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0024  glycyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 		 488 aa  246  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00479834  normal  0.0124989 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0045  glycyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 		 489 aa  244  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0024  glycyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 488 aa  242  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.757041 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 508 aa  242  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0030  glycyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1132  glycyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 463 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1623  glycyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 463 aa  239  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1657  glycyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 463 aa  239  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1692  glycyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 		 502 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 485 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4906  glycyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 		 494 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2174  glycyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 		 507 aa  234  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0798497  normal  0.636164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0933  glycyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 		 458 aa  229  9e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3224  glycyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 462 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0778215  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  35.69 
 
 		 506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 451 aa  213  7e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000087846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 456 aa  213  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 464 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 460 aa  213  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 		 456 aa  212  2e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 471 aa  210  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 462 aa  210  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 466 aa  209  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 460 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 462 aa  207  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 462 aa  206  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1263  glycyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 448 aa  206  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1410  glycyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 		 434 aa  204  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 490 aa  203  8e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3433  glycyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 459 aa  202  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>