185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1156 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 607 aa  675    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1061  glycyl-tRNA synthetase  64.97 
 
 		 573 aa  777    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.238733  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1707  glycyl-tRNA synthetase  65.32 
 
 		 572 aa  790    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 581 aa  647    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1156  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 576 aa  1194    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1419  glycyl-tRNA synthetase  64.27 
 
 		 576 aa  747    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0814  glycyl-tRNA synthetase  66.31 
 
 		 573 aa  808    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 577 aa  627  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 574 aa  550  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 579 aa  545  1e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 574 aa  544  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 574 aa  542  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 575 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 586 aa  513  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 630 aa  503  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 589 aa  501  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 593 aa  491  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 594 aa  482  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 557 aa  444  1e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12730  predicted protein  39.44 
 
 		 677 aa  412  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.384524 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0336  glycyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 590 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1628  glycyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 588 aa  397  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1821  glycyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 585 aa  390  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1433  glycyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 583 aa  385  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1420  glycyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 574 aa  384  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2213  glycyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 571 aa  383  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.472902  hitchhiker  0.00000523773 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0895  glycyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 585 aa  380  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19761  predicted protein  38.47 
 
 		 702 aa  378  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11125  glycyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05920)  37.17 
 
 		 689 aa  369  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26972  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00730  glycine-tRNA ligase, putative  35.77 
 
 		 699 aa  365  1e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64855  cyl-tRNA synthase  34.03 
 
 		 661 aa  339  8e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 471 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  33.28 
 
 		 462 aa  272  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0861  glycyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.651582  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  32.49 
 
 		 506 aa  269  1e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 530 aa  268  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0046  glycyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 		 530 aa  266  8.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 		 468 aa  266  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 		 462 aa  263  8.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 468 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 468 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 468 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 		 467 aa  262  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 		 490 aa  262  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  31.54 
 
 		 602 aa  262  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2346  anticodon binding domain protein  32.32 
 
 		 461 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06090  glycyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 460 aa  255  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 		 551 aa  254  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11840  glycyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 468 aa  253  8.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000800535  normal  0.839416 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1532  glycyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 		 461 aa  253  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.605257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  29.97 
 
 		 456 aa  250  4e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 539 aa  249  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 497 aa  248  1e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1266  glycyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 		 461 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17070  glycyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 		 463 aa  248  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0010588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13710  glycyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 		 463 aa  247  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0798  glycyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 		 465 aa  246  9e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.511892  normal  0.155631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3369  glycyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 462 aa  246  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.0704929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4697  glycyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 459 aa  243  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13710  glycyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 		 462 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797043  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 485 aa  240  5.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  31.95 
 
 		 466 aa  239  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12383  glycyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 		 463 aa  238  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2743  glycyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 		 478 aa  234  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0933  glycyl-tRNA synthetase  31 
 
 		 458 aa  233  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3433  glycyl-tRNA synthetase  30.93 
 
 		 459 aa  229  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000023951 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0017  glycyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 		 489 aa  228  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 		 445 aa  226  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 467 aa  209  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 467 aa  209  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 462 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 462 aa  208  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 462 aa  205  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 464 aa  205  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 467 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 443 aa  203  6e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 456 aa  198  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0024  glycyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 488 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.757041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 		 461 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 		 458 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0564  glycyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 		 473 aa  191  2e-47  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.425616  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3224  glycyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 		 462 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0778215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 460 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 458 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 458 aa  189  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 458 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 458 aa  189  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 458 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 458 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 458 aa  187  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 458 aa  187  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 458 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 458 aa  186  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>