225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1707 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 607 aa  645    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1061  glycyl-tRNA synthetase  69.06 
 
 		 573 aa  819    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.238733  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1707  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 572 aa  1183    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0814  glycyl-tRNA synthetase  72.2 
 
 		 573 aa  871    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1156  glycyl-tRNA synthetase  65.32 
 
 		 576 aa  790    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1419  glycyl-tRNA synthetase  70.18 
 
 		 576 aa  820    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 		 581 aa  627  1e-178  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 577 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 579 aa  558  1e-158  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 574 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 574 aa  528  1e-149  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 574 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 586 aa  524  1e-147  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 575 aa  520  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 589 aa  501  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 593 aa  497  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 630 aa  488  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 594 aa  486  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 557 aa  479  1e-134  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12730  predicted protein  40.82 
 
 		 677 aa  437  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.384524 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0336  glycyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 590 aa  414  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19761  predicted protein  37.85 
 
 		 702 aa  400  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11125  glycyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05920)  35.67 
 
 		 689 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1628  glycyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 588 aa  390  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1821  glycyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 585 aa  390  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1433  glycyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 583 aa  384  1e-105  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0895  glycyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 585 aa  380  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2213  glycyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 571 aa  381  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.472902  hitchhiker  0.00000523773 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1420  glycyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 574 aa  379  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00730  glycine-tRNA ligase, putative  35.22 
 
 		 699 aa  372  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 497 aa  352  1e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64855  cyl-tRNA synthase  35.26 
 
 		 661 aa  349  9e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270271 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 445 aa  286  7e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0020  glycyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 		 451 aa  280  4e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.485977  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 456 aa  280  6e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1926  glycyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 		 460 aa  258  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0030323  hitchhiker  0.00269107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 		 530 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0046  glycyl-tRNA synthetase  31.23 
 
 		 530 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 		 458 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 458 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 539 aa  243  9e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 485 aa  239  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0933  glycyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 		 458 aa  237  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3249  glycyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 		 495 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281053  decreased coverage  0.00448945 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1716  glycyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 504 aa  223  9e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.391991 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 508 aa  218  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 		 551 aa  217  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4906  glycyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 494 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4697  glycyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 		 459 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 462 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 		 467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 		 467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 462 aa  196  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 443 aa  196  9e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  34.18 
 
 		 506 aa  194  4e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 462 aa  193  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 460 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 467 aa  191  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3224  glycyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 462 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0778215  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 		 462 aa  190  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 		 468 aa  188  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1000  glycyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 		 509 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.450604  hitchhiker  0.00350123 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 		 490 aa  187  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 466 aa  187  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 466 aa  186  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 		 468 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 		 468 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 		 468 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06090  glycyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0861  glycyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 		 462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.651582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 460 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 462 aa  184  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 		 461 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2174  glycyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 		 507 aa  183  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0798497  normal  0.636164 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 		 460 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1410  glycyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1263  glycyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 448 aa  182  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 471 aa  181  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13710  glycyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 463 aa  181  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0373  glycyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 445 aa  180  4.999999999999999e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11840  glycyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 		 468 aa  180  5.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000800535  normal  0.839416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12383  glycyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 463 aa  179  9e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 		 461 aa  178  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000023951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2743  glycyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 478 aa  179  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1657  glycyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>