185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0336 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0895  glycyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 		 585 aa  687    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1628  glycyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 		 588 aa  683    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1821  glycyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 		 585 aa  672    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0336  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 590 aa  1206    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1433  glycyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 583 aa  673    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1420  glycyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 574 aa  514  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2213  glycyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 571 aa  499  1e-140  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.472902  hitchhiker  0.00000523773 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 574 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 574 aa  451  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 574 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 581 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 575 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 607 aa  434  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 579 aa  429  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0814  glycyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 573 aa  426  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 557 aa  425  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 577 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1707  glycyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1156  glycyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 576 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1419  glycyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 576 aa  403  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 586 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1061  glycyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 573 aa  383  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.238733  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 594 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 589 aa  377  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 630 aa  375  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 593 aa  363  7.0000000000000005e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64855  cyl-tRNA synthase  35.93 
 
 		 661 aa  342  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270271 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12730  predicted protein  36.35 
 
 		 677 aa  341  2e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.384524 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19761  predicted protein  34.68 
 
 		 702 aa  340  5e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00730  glycine-tRNA ligase, putative  34.88 
 
 		 699 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11125  glycyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05920)  34.53 
 
 		 689 aa  329  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 497 aa  298  1e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 485 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  30.59 
 
 		 602 aa  241  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 		 539 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4697  glycyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 459 aa  230  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  30.76 
 
 		 462 aa  229  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0046  glycyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 		 530 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 530 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 		 468 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 		 468 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1266  glycyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 		 461 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13710  glycyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 462 aa  225  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797043  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 		 551 aa  224  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 		 468 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  30.1 
 
 		 467 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 508 aa  220  5e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 		 468 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13710  glycyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 463 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17070  glycyl-tRNA synthetase  31.53 
 
 		 463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0010588  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3249  glycyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 495 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281053  decreased coverage  0.00448945 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  30.97 
 
 		 506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1716  glycyl-tRNA synthetase  29.76 
 
 		 504 aa  211  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.391991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3369  glycyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 462 aa  209  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.0704929 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 490 aa  205  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4906  glycyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 		 494 aa  203  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1263  glycyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11840  glycyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000800535  normal  0.839416 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 460 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 		 460 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 462 aa  198  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 458 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 458 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 458 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 		 467 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 		 467 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1692  glycyl-tRNA synthetase  28.95 
 
 		 502 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 458 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 		 466 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 458 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2174  glycyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 		 507 aa  194  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0798497  normal  0.636164 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0361  glycyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 496 aa  194  4e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 466 aa  194  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0933  glycyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 458 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 462 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 462 aa  189  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1774  glycyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 525 aa  187  5e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.360257  normal  0.456837 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 462 aa  187  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0020  glycyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 		 451 aa  186  7e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.485977  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 		 445 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 		 443 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 		 433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3489  glycyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 		 504 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 456 aa  184  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 		 451 aa  181  4.999999999999999e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000087846  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 		 461 aa  179  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000023951 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 456 aa  177  6e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1330  glycyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 461 aa  177  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06090  glycyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 		 460 aa  176  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 		 457 aa  174  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>