217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1488 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  66.83 
 
 		 630 aa  816    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  68.31 
 
 		 593 aa  833    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  76.91 
 
 		 589 aa  916    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  64.14 
 
 		 594 aa  749    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 586 aa  1180    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 		 577 aa  558  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 581 aa  546  1e-154  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 607 aa  533  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1419  glycyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 576 aa  526  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0814  glycyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 573 aa  525  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1707  glycyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 572 aa  524  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1156  glycyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 576 aa  513  1e-144  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1061  glycyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 573 aa  486  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.238733  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 574 aa  480  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 579 aa  480  1e-134  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 574 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 574 aa  472  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 557 aa  467  9.999999999999999e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 575 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1628  glycyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 588 aa  430  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1433  glycyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 583 aa  424  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1420  glycyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 574 aa  419  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0895  glycyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 585 aa  421  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1821  glycyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 585 aa  419  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2213  glycyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 571 aa  413  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.472902  hitchhiker  0.00000523773 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0336  glycyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 590 aa  400  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12730  predicted protein  38.05 
 
 		 677 aa  395  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.384524 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11125  glycyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05920)  35.17 
 
 		 689 aa  392  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64855  cyl-tRNA synthase  35.48 
 
 		 661 aa  387  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270271 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00730  glycine-tRNA ligase, putative  35.1 
 
 		 699 aa  364  2e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19761  predicted protein  35.04 
 
 		 702 aa  364  3e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 551 aa  286  8e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  32.48 
 
 		 602 aa  281  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1716  glycyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 		 504 aa  268  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.391991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3369  glycyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.0704929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 		 530 aa  265  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 485 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 497 aa  263  8e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0933  glycyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01740  glycyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 511 aa  258  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 508 aa  256  6e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0046  glycyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 		 530 aa  256  7e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4697  glycyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 		 459 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 539 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2174  glycyl-tRNA synthetase  30.87 
 
 		 507 aa  252  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0798497  normal  0.636164 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0373  glycyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 		 445 aa  252  2e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 		 462 aa  250  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1263  glycyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 448 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 		 462 aa  237  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13710  glycyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 		 462 aa  236  9e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797043  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1926  glycyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 		 460 aa  234  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0030323  hitchhiker  0.00269107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2743  glycyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 478 aa  229  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 466 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3433  glycyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 459 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3810  glycyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 459 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 458 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 		 468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 458 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 458 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 458 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 458 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 458 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 458 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 458 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 458 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 458 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 468 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 467 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 		 468 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 		 468 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17070  glycyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 463 aa  209  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0010588  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 		 467 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 		 462 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13710  glycyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 		 463 aa  207  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 		 471 aa  207  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  33.43 
 
 		 506 aa  206  7e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1623  glycyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 463 aa  206  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1657  glycyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 463 aa  206  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 461 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1132  glycyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 		 463 aa  206  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 464 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 466 aa  204  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06090  glycyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 460 aa  204  5e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 451 aa  203  6e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000087846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 		 462 aa  203  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  30.87 
 
 		 456 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000023951 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 		 490 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0861  glycyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.651582  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 		 445 aa  200  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1330  glycyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 		 461 aa  200  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 		 443 aa  200  5e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0564  glycyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 473 aa  199  9e-50  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.425616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>