146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1209 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 607 aa  1250    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1707  glycyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 572 aa  647    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  71.43 
 
 		 581 aa  886    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  58.44 
 
 		 577 aa  739    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1156  glycyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 576 aa  676    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0814  glycyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 573 aa  641    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1061  glycyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 573 aa  635    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.238733  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1419  glycyl-tRNA synthetase  55.57 
 
 		 576 aa  632  1e-180  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 574 aa  596  1e-169  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 574 aa  592  1e-168  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 574 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 575 aa  586  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 579 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 586 aa  536  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 589 aa  520  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 593 aa  506  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 630 aa  506  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 594 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 557 aa  481  1e-134  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12730  predicted protein  39.72 
 
 		 677 aa  461  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.384524 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0336  glycyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 590 aa  434  1e-120  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11125  glycyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05920)  39.5 
 
 		 689 aa  430  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19761  predicted protein  38.69 
 
 		 702 aa  429  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1420  glycyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 574 aa  426  1e-118  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1628  glycyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 588 aa  426  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00730  glycine-tRNA ligase, putative  36.38 
 
 		 699 aa  417  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1821  glycyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 585 aa  412  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1433  glycyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 583 aa  412  1e-113  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64855  cyl-tRNA synthase  36.32 
 
 		 661 aa  406  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270271 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2213  glycyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 571 aa  404  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.472902  hitchhiker  0.00000523773 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0895  glycyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 585 aa  401  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 485 aa  277  4e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 497 aa  273  9e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  31.41 
 
 		 602 aa  271  2.9999999999999997e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0046  glycyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 530 aa  270  8e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 		 530 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 		 551 aa  253  6e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  31.23 
 
 		 539 aa  250  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0933  glycyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 458 aa  240  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4697  glycyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 459 aa  235  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 		 508 aa  233  6e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 460 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 462 aa  231  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 467 aa  226  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 		 456 aa  226  1e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 462 aa  226  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 462 aa  226  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 462 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 467 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 467 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 460 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 468 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 468 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 468 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 462 aa  220  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 466 aa  220  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  37.03 
 
 		 506 aa  220  7e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 458 aa  219  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13710  glycyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 463 aa  218  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 458 aa  217  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 458 aa  217  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 458 aa  217  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 458 aa  217  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 458 aa  217  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 458 aa  217  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 458 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 458 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 458 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 458 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 		 445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 433 aa  213  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 443 aa  213  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 461 aa  213  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000023951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13710  glycyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 462 aa  213  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797043  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 		 451 aa  213  1e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000087846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 468 aa  213  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 461 aa  212  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1926  glycyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 460 aa  211  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0030323  hitchhiker  0.00269107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 456 aa  210  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0020  glycyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 451 aa  210  7e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.485977  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1263  glycyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 448 aa  210  7e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1410  glycyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 434 aa  210  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 462 aa  209  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0861  glycyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 462 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.651582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 		 462 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3224  glycyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 462 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0778215  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1330  glycyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 461 aa  207  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12383  glycyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 463 aa  206  8e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 471 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 460 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1132  glycyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 463 aa  204  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2346  anticodon binding domain protein  35.68 
 
 		 461 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06090  glycyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 460 aa  203  7e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1266  glycyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 461 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3146  glycyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 463 aa  200  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>