193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1419 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  55.57 
 
 		 607 aa  661    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1707  glycyl-tRNA synthetase  70.18 
 
 		 572 aa  857    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1061  glycyl-tRNA synthetase  69 
 
 		 573 aa  819    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.238733  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1156  glycyl-tRNA synthetase  64.27 
 
 		 576 aa  773    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1419  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 576 aa  1182    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0814  glycyl-tRNA synthetase  67.6 
 
 		 573 aa  827    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 		 577 aa  633  1e-180  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 		 581 aa  624  1e-177  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 579 aa  593  1e-168  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 574 aa  556  1e-157  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 586 aa  550  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 574 aa  548  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 574 aa  548  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 589 aa  544  1e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 575 aa  536  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 630 aa  527  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 593 aa  513  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 557 aa  496  1e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 594 aa  492  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12730  predicted protein  42.35 
 
 		 677 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.384524 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0336  glycyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 590 aa  422  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1433  glycyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 583 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11125  glycyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05920)  38.15 
 
 		 689 aa  414  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1628  glycyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 588 aa  413  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1821  glycyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 585 aa  414  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0895  glycyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 585 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2213  glycyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.472902  hitchhiker  0.00000523773 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19761  predicted protein  39.39 
 
 		 702 aa  401  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1420  glycyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 574 aa  393  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64855  cyl-tRNA synthase  35.28 
 
 		 661 aa  365  1e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270271 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00730  glycine-tRNA ligase, putative  41.28 
 
 		 699 aa  334  2e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  34.15 
 
 		 602 aa  303  5.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 460 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 530 aa  259  9e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 497 aa  259  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 		 551 aa  258  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4697  glycyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 459 aa  256  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11840  glycyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 		 468 aa  256  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000800535  normal  0.839416 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 485 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0046  glycyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 		 530 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2174  glycyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 507 aa  246  9e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0798497  normal  0.636164 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1716  glycyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 504 aa  245  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.391991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 539 aa  243  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 		 508 aa  242  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3369  glycyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 		 462 aa  233  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.0704929 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 		 464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 462 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 462 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 		 467 aa  206  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 		 466 aa  206  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 443 aa  203  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 		 462 aa  202  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 		 467 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 		 467 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 457 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 460 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 456 aa  198  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 		 468 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 468 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 468 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  35.06 
 
 		 506 aa  196  8.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 468 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1266  glycyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 461 aa  196  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 467 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 		 461 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 462 aa  194  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 460 aa  194  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 462 aa  194  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 466 aa  194  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 458 aa  193  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 490 aa  193  7e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1410  glycyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 		 434 aa  193  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 458 aa  193  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 458 aa  193  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3224  glycyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0778215  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1263  glycyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 448 aa  192  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0564  glycyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 473 aa  190  5.999999999999999e-47  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.425616  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0020  glycyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 		 451 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.485977  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0861  glycyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 462 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.651582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2346  anticodon binding domain protein  33.61 
 
 		 461 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13710  glycyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 		 463 aa  188  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 462 aa  188  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1132  glycyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 463 aa  187  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1623  glycyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 463 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1657  glycyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 463 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06090  glycyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 		 460 aa  187  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3433  glycyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 459 aa  186  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 		 461 aa  186  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000023951 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>