188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1420 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1420  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 574 aa  1168    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2213  glycyl-tRNA synthetase  64.83 
 
 		 571 aa  778    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.472902  hitchhiker  0.00000523773 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0336  glycyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 590 aa  514  1e-144  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1628  glycyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 588 aa  474  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0895  glycyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 585 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1821  glycyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 585 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1433  glycyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 583 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 574 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 574 aa  433  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 581 aa  429  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 579 aa  428  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 574 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 557 aa  422  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 607 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 594 aa  422  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 593 aa  420  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 575 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 586 aa  419  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 577 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 589 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 630 aa  404  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0814  glycyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 573 aa  394  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1156  glycyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 576 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1419  glycyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 576 aa  380  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1707  glycyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 572 aa  379  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1061  glycyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 573 aa  363  3e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.238733  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 497 aa  353  4e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11125  glycyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05920)  32.33 
 
 		 689 aa  297  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12730  predicted protein  32.27 
 
 		 677 aa  295  2e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.384524 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19761  predicted protein  31.05 
 
 		 702 aa  276  8e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64855  cyl-tRNA synthase  30.84 
 
 		 661 aa  275  2.0000000000000002e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270271 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00730  glycine-tRNA ligase, putative  31.85 
 
 		 699 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 460 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 467 aa  249  9e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 467 aa  249  9e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 		 462 aa  249  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4697  glycyl-tRNA synthetase  31.56 
 
 		 459 aa  245  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 		 464 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1716  glycyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 504 aa  243  9e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.391991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 		 539 aa  240  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4906  glycyl-tRNA synthetase  30.98 
 
 		 494 aa  240  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3249  glycyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 		 495 aa  239  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281053  decreased coverage  0.00448945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 		 530 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 		 460 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2174  glycyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 		 507 aa  236  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0798497  normal  0.636164 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 		 551 aa  234  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1623  glycyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 463 aa  231  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1657  glycyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 463 aa  231  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1132  glycyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 		 463 aa  229  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 485 aa  226  1e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0933  glycyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 		 458 aa  223  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1692  glycyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 502 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 466 aa  217  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1379  glycyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2165  glycyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 		 515 aa  211  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 462 aa  211  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 456 aa  210  5e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0796  glycyl-tRNA synthetase  28.93 
 
 		 513 aa  206  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412856  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3224  glycyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 462 aa  206  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0778215  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  35.89 
 
 		 506 aa  206  7e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0861  glycyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 		 462 aa  206  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.651582  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 462 aa  206  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0020  glycyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 451 aa  204  4e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.485977  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 		 461 aa  204  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 458 aa  203  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2067  glycyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 456 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 		 458 aa  200  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 462 aa  200  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 		 468 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 461 aa  200  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000023951 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 458 aa  200  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 468 aa  200  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 468 aa  200  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 458 aa  199  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 		 443 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1410  glycyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 434 aa  198  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0564  glycyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.425616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1330  glycyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 461 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  31.55 
 
 		 602 aa  196  7e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 471 aa  196  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3433  glycyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 459 aa  196  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3810  glycyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 459 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 467 aa  196  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 451 aa  195  2e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000087846  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 490 aa  195  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 467 aa  195  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>