298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1061 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 607 aa  642    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0814  glycyl-tRNA synthetase  69.34 
 
 		 573 aa  849    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1707  glycyl-tRNA synthetase  69.06 
 
 		 572 aa  832    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1061  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 573 aa  1182    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.238733  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1156  glycyl-tRNA synthetase  64.97 
 
 		 576 aa  785    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1419  glycyl-tRNA synthetase  69 
 
 		 576 aa  789    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 581 aa  609  1e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 577 aa  596  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 579 aa  560  1e-158  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 574 aa  545  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 574 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 574 aa  542  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 575 aa  529  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 630 aa  498  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 586 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 594 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 593 aa  483  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 589 aa  483  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 557 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12730  predicted protein  40.89 
 
 		 677 aa  435  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.384524 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19761  predicted protein  38.85 
 
 		 702 aa  392  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11125  glycyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05920)  38.26 
 
 		 689 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0336  glycyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 590 aa  385  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0895  glycyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 585 aa  375  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1628  glycyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 588 aa  374  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1821  glycyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 585 aa  373  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1433  glycyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 583 aa  373  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2213  glycyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 571 aa  369  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.472902  hitchhiker  0.00000523773 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1420  glycyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 		 574 aa  367  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64855  cyl-tRNA synthase  34.57 
 
 		 661 aa  352  1e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270271 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00730  glycine-tRNA ligase, putative  39.29 
 
 		 699 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 497 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  33.72 
 
 		 602 aa  288  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3224  glycyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 462 aa  272  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0778215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11840  glycyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 		 468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000800535  normal  0.839416 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  32.21 
 
 		 506 aa  263  4.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 467 aa  261  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 462 aa  259  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 		 490 aa  258  3e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 		 530 aa  257  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 		 466 aa  256  6e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 		 551 aa  256  7e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 461 aa  256  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000023951 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 460 aa  253  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1330  glycyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 		 461 aa  252  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1532  glycyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 461 aa  250  6e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.605257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0046  glycyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 		 530 aa  244  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4697  glycyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 		 539 aa  239  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2174  glycyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 		 507 aa  237  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0798497  normal  0.636164 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 485 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0933  glycyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 458 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 462 aa  213  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 		 467 aa  212  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 		 467 aa  212  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 464 aa  211  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 462 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  29.97 
 
 		 508 aa  207  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 		 462 aa  207  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 456 aa  207  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 		 456 aa  206  1e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 466 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 462 aa  203  9e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 443 aa  196  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 458 aa  196  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 458 aa  196  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 458 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 458 aa  196  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 458 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 458 aa  196  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 		 462 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 458 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1410  glycyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 434 aa  196  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 460 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 		 461 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 458 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 458 aa  194  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000087846  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0861  glycyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.651582  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2743  glycyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1263  glycyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 		 462 aa  192  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 468 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2477  glycyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 468 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 468 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 468 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1132  glycyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 		 463 aa  189  8e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2346  anticodon binding domain protein  33.43 
 
 		 461 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1657  glycyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 463 aa  186  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1623  glycyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 463 aa  186  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 471 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 467 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12383  glycyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 463 aa  183  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>