155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1989 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  85.76 
 
 
593 aa  1046    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  68.06 
 
 
594 aa  812    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  66.83 
 
 
586 aa  816    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 
630 aa  1272    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  71.43 
 
 
589 aa  876    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
577 aa  529  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1419  glycyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
576 aa  509  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
607 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1156  glycyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
576 aa  503  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0814  glycyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
573 aa  500  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
581 aa  498  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1061  glycyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
573 aa  492  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.238733  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1707  glycyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
572 aa  488  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 
574 aa  488  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
574 aa  483  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
579 aa  484  1e-135  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
574 aa  478  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
575 aa  475  1e-132  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
557 aa  459  9.999999999999999e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1628  glycyl-tRNA synthetase  39.97 
 
 
588 aa  417  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1433  glycyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 
583 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0895  glycyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
585 aa  415  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12730  predicted protein  38.31 
 
 
677 aa  409  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.384524 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1420  glycyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
574 aa  404  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2213  glycyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 
571 aa  403  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.472902  hitchhiker  0.00000523773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1821  glycyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
585 aa  393  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19761  predicted protein  35.73 
 
 
702 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11125  glycyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05920)  34.91 
 
 
689 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26972  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00730  glycine-tRNA ligase, putative  35.31 
 
 
699 aa  374  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64855  cyl-tRNA synthase  36.04 
 
 
661 aa  375  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0270271 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0336  glycyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 
590 aa  375  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
485 aa  270  8e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 
497 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  32.18 
 
 
539 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 
530 aa  248  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0046  glycyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 
530 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
460 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
460 aa  226  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 
466 aa  223  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
458 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0020  glycyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
451 aa  219  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.485977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
458 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
458 aa  219  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
458 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
458 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
458 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
458 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  36 
 
 
457 aa  219  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
458 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
458 aa  219  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
458 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
458 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 
443 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
462 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
445 aa  213  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 
456 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
433 aa  213  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
451 aa  211  2e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000087846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 
462 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
462 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1410  glycyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 
434 aa  209  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 
468 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
456 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1132  glycyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
463 aa  208  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
468 aa  206  9e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
468 aa  206  9e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1623  glycyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
463 aa  205  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1657  glycyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
463 aa  205  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 
467 aa  205  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 
467 aa  205  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 
462 aa  204  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
468 aa  204  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
462 aa  201  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
467 aa  201  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2477  glycyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
481 aa  201  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  32.86 
 
 
506 aa  200  6e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0861  glycyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 
462 aa  200  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.651582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 
461 aa  199  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000023951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 
461 aa  199  9e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06090  glycyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 
471 aa  197  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 
490 aa  197  6e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13710  glycyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 
463 aa  196  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0373  glycyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 
445 aa  196  9e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0564  glycyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 
473 aa  196  1e-48  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.425616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 
460 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1532  glycyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 
461 aa  195  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.605257  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2346  anticodon binding domain protein  32.76 
 
 
461 aa  195  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 
462 aa  193  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2067  glycyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 
456 aa  193  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13710  glycyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 
462 aa  193  8e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797043  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1330  glycyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 
461 aa  193  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2743  glycyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
478 aa  193  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3249  glycyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 
495 aa  193  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281053  decreased coverage  0.00448945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3224  glycyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 
462 aa  193  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0778215  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 
466 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1926  glycyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 
460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0030323  hitchhiker  0.00269107 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>