More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60889 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_60889  Manganese superoxide dismutase  100 
 
 		 261 aa  550  1e-155  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.385714 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05148  Fe superoxide dismutase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07210)  31.2 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000120882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01314  superoxide dismutase  32.53 
 
 		 192 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.241762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1920  superoxide dismutase  26.32 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00591973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  28.92 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1963  superoxide dismutase  24.26 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  28.43 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  27.94 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1373  Superoxide dismutase  28.95 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.509917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03014  superoxide dismutase  24.58 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2023  superoxide dismutase  26.32 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0032  superoxide dismutase(Fe)  30.2 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000179018  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  27.94 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  27.94 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  26.47 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  26.47 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  26.47 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  26.47 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  26.47 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  26.47 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  26.47 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  26.47 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  26.47 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  27.11 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002934  superoxide dismutase (Fe)  24.26 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000374974  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87011  Mn-superoxide dismutase  26.33 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3164  superoxide dismutase  27.78 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.657671 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  23.48 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3476  superoxide dismutase  24.89 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1320  Superoxide dismutase  29.74 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2445  superoxide dismutase  26.51 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.103269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  25.82 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2503  Superoxide dismutase  24.28 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000289489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1775  superoxide dismutase  24.28 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1819  superoxide dismutase  24.28 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000821956  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00022  superoxide dismutase  28.47 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00410451  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1782  superoxide dismutase  24.28 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000439358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1687  superoxide dismutase  24.56 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000404322  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2571  superoxide dismutase  23.4 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.489375  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2881  superoxide dismutase, Fe  23.84 
 
 		 194 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  24.51 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  24.51 
 
 		 192 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0072  Superoxide dismutase  28.57 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1572  superoxide dismutase  23.84 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.113962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1647  superoxide dismutase  23.84 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000641638  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1639  manganese and iron superoxide dismutase  23.84 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_002950  PG1545  superoxide dismutase, Fe-Mn  25 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2159  superoxide dismutase  25.79 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  25.49 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1834  superoxide dismutase  25 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000110112  normal  0.958041 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0947  Superoxide dismutase  23.7 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.0414637 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  27.5 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0814  Superoxide dismutase  26.37 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.486373 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  26.67 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12583  precursor of mutase superoxide dismutase [Fe/Mn]  25.52 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1632  superoxide dismutase, Fe  25.52 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000440787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2196  superoxide dismutase  25.58 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  hitchhiker  0.00000576689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  23.4 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000049091  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  24.51 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1350  superoxide dismutase  27.98 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.772755  normal  0.0350639 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1863  superoxide dismutase  23.4 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.410173  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  24.51 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  24.51 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  24.51 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2693  Fe/Mn family superoxide dismutase  27.46 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  25 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  25 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  24.51 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  24.51 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3417  manganese and iron superoxide dismutase  25.61 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0123938 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  24.05 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0056  Superoxide dismutase  28.57 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1858  superoxide dismutase [Fe]  24.26 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  26.63 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1747  superoxide dismutase  23.68 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000473936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  25.25 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  24.02 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2066  Superoxide dismutase  25.31 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  24.08 
 
 		 193 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205445  hitchhiker  0.00000630572 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1897  Superoxide dismutase  26.58 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  24.51 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  25 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  25 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  25.25 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  26.98 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  25.49 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  25.49 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  25 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  25.49 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  26.42 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2067  superoxide dismutase, Fe  24.48 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.854961  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0328  superoxide dismutase (Fe)  26.67 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.731602  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  24.1 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  24.51 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2567  superoxide dismutase  25 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000701248  normal  0.136578 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1639  superoxide dismutase  26.45 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000140033  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1931  superoxide dismutase  25 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2543  superoxide dismutase  25 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  24.68 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  23.97 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>