More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1539 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  100 
 
 		 200 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  78.5 
 
 		 200 aa  340  5.999999999999999e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  78 
 
 		 200 aa  337  8e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  78.57 
 
 		 198 aa  330  7.000000000000001e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  75.5 
 
 		 200 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  73.87 
 
 		 201 aa  322  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1462  Superoxide dismutase  72.5 
 
 		 201 aa  293  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  65.33 
 
 		 199 aa  278  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  63.82 
 
 		 199 aa  272  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  62.31 
 
 		 200 aa  270  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  62.31 
 
 		 200 aa  270  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  64.62 
 
 		 205 aa  266  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3417  manganese and iron superoxide dismutase  61.54 
 
 		 241 aa  260  8e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0123938 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  61.69 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  62.3 
 
 		 229 aa  258  6e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1163  Superoxide dismutase  61.78 
 
 		 207 aa  256  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  58.59 
 
 		 198 aa  252  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2066  Superoxide dismutase  60 
 
 		 236 aa  249  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  60 
 
 		 209 aa  250  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2067  superoxide dismutase, Fe  61.05 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.854961  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  58.16 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  59 
 
 		 200 aa  248  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  58.97 
 
 		 209 aa  248  4e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  56.78 
 
 		 227 aa  246  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  58.38 
 
 		 199 aa  244  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  57.14 
 
 		 197 aa  241  6e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  57.87 
 
 		 194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1986  Superoxide dismutase  55.28 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  56.06 
 
 		 221 aa  227  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 192 aa  227  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  56.06 
 
 		 221 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  56.06 
 
 		 192 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  56.06 
 
 		 192 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  56.06 
 
 		 192 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  56.06 
 
 		 192 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  56.06 
 
 		 192 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  53.54 
 
 		 192 aa  225  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  55.56 
 
 		 221 aa  225  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  53.54 
 
 		 192 aa  225  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3219  Superoxide dismutase  54.04 
 
 		 194 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  53.54 
 
 		 204 aa  224  9e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457319 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0822  superoxide dismutase  54.12 
 
 		 238 aa  222  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.600443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  55.56 
 
 		 192 aa  222  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  55.56 
 
 		 192 aa  221  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  55.56 
 
 		 192 aa  221  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  55 
 
 		 193 aa  221  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  55 
 
 		 193 aa  221  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  55 
 
 		 193 aa  221  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  54.5 
 
 		 193 aa  220  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1931  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 192 aa  220  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2543  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 192 aa  220  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2567  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 192 aa  220  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000701248  normal  0.136578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  55.05 
 
 		 233 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  54.5 
 
 		 193 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  54.5 
 
 		 193 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  54.5 
 
 		 193 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  54.5 
 
 		 193 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  55.56 
 
 		 192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  55.05 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2463  Superoxide dismutase  51.78 
 
 		 193 aa  218  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  54.04 
 
 		 192 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  53.03 
 
 		 192 aa  217  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000049091  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  52.76 
 
 		 193 aa  217  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  52.76 
 
 		 193 aa  217  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0738  superoxide dismutase, Fe  51.49 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  52.76 
 
 		 193 aa  217  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1963  superoxide dismutase  54 
 
 		 194 aa  216  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0298  superoxide dismutase  51.26 
 
 		 193 aa  217  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.775999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  52.76 
 
 		 193 aa  217  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  52.76 
 
 		 193 aa  217  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  52.76 
 
 		 193 aa  217  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1895  superoxide dismutase (Fe)  51.26 
 
 		 193 aa  217  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  54.04 
 
 		 192 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  52.76 
 
 		 193 aa  217  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  53.54 
 
 		 192 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  52.76 
 
 		 193 aa  217  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  54.5 
 
 		 193 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  52.76 
 
 		 193 aa  217  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  53.5 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1863  superoxide dismutase  52.53 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.410173  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2571  superoxide dismutase  52.53 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.489375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2196  superoxide dismutase  52.28 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  hitchhiker  0.00000576689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  53.5 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  53.5 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  53.81 
 
 		 193 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2023  superoxide dismutase  54.04 
 
 		 192 aa  215  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02750  iron superoxide dismutase  53.77 
 
 		 193 aa  215  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  53.5 
 
 		 198 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  53.77 
 
 		 193 aa  214  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205445  hitchhiker  0.00000630572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  53.54 
 
 		 193 aa  214  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  53.5 
 
 		 198 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  54 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  50.51 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1015  superoxide dismutase, Fe  50 
 
 		 194 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.011206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3194  Superoxide dismutase  52.53 
 
 		 192 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194093  normal  0.452704 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0073  Superoxide dismutase  53.06 
 
 		 198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  53.54 
 
 		 193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6857  Superoxide dismutase  50.52 
 
 		 197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0552512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1819  superoxide dismutase  53.27 
 
 		 194 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000821956  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1782  superoxide dismutase  53.27 
 
 		 194 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000439358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>