More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3164 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3164  superoxide dismutase  100 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.657671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0082  superoxide dismutase  55.98 
 
 		 205 aa  206  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.078547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0483  superoxide dismutase  47.8 
 
 		 204 aa  188  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0291  superoxide dismutase  43.14 
 
 		 208 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 193 aa  175  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  45.96 
 
 		 201 aa  175  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  46.67 
 
 		 198 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  46.67 
 
 		 198 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  46.67 
 
 		 198 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  47.15 
 
 		 194 aa  174  8e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  46.67 
 
 		 198 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2933  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  46.7 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1895  superoxide dismutase (Fe)  45.69 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0298  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.775999  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  44.56 
 
 		 193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  45.69 
 
 		 193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  44.74 
 
 		 227 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3476  superoxide dismutase  44.1 
 
 		 194 aa  172  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 193 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  46.67 
 
 		 192 aa  171  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03014  superoxide dismutase  44.74 
 
 		 199 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 193 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002934  superoxide dismutase (Fe)  44.5 
 
 		 194 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000374974  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  46.67 
 
 		 192 aa  170  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  46.19 
 
 		 193 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  44.5 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  46.15 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  43.52 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  44.62 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  45.18 
 
 		 193 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  44.33 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000049091  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1687  superoxide dismutase  41.84 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000404322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1747  superoxide dismutase  42.13 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000473936  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  45.18 
 
 		 193 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1863  superoxide dismutase  43.81 
 
 		 192 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.410173  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0947  Superoxide dismutase  44.85 
 
 		 193 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.0414637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  45.18 
 
 		 193 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1395  superoxide dismutase  45.13 
 
 		 193 aa  169  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  44.16 
 
 		 193 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  44.16 
 
 		 193 aa  168  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  44.16 
 
 		 193 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  44.16 
 
 		 193 aa  168  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  44.16 
 
 		 193 aa  168  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  44.16 
 
 		 193 aa  168  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  44.16 
 
 		 193 aa  168  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  44.16 
 
 		 193 aa  168  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  44.16 
 
 		 193 aa  168  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2463  Superoxide dismutase  44.56 
 
 		 193 aa  168  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2571  superoxide dismutase  43.81 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.489375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  44.95 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  41.54 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205445  hitchhiker  0.00000630572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  42.49 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2067  superoxide dismutase, Fe  43.92 
 
 		 210 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.854961  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  43.01 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1632  superoxide dismutase, Fe  43.3 
 
 		 194 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000440787  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  41.54 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  43.01 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2881  superoxide dismutase, Fe  41.03 
 
 		 194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1782  superoxide dismutase  41.03 
 
 		 194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000439358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4998  Superoxide dismutase  43.81 
 
 		 193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2503  Superoxide dismutase  41.03 
 
 		 194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000289489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1819  superoxide dismutase  41.03 
 
 		 194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000821956  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1927  superoxide dismutase  44.04 
 
 		 193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1775  superoxide dismutase  41.03 
 
 		 194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  44.04 
 
 		 192 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1572  superoxide dismutase  41.03 
 
 		 194 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.113962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1647  superoxide dismutase  41.03 
 
 		 194 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000641638  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1639  manganese and iron superoxide dismutase  41.03 
 
 		 194 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1963  superoxide dismutase  41.12 
 
 		 194 aa  165  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2448  superoxide dismutase  42.78 
 
 		 193 aa  165  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103073  normal  0.0475458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2645  Superoxide dismutase  43.3 
 
 		 193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  43.52 
 
 		 192 aa  164  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3194  Superoxide dismutase  43.52 
 
 		 192 aa  164  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194093  normal  0.452704 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1834  superoxide dismutase  42.64 
 
 		 194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000110112  normal  0.958041 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02750  iron superoxide dismutase  42.56 
 
 		 193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  44.79 
 
 		 193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3574  superoxide dismutase  44.04 
 
 		 193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150898  hitchhiker  0.00946106 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1920  superoxide dismutase  41.03 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00591973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  43.3 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2945  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  42.71 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457319 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1858  superoxide dismutase [Fe]  43.81 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1639  superoxide dismutase  41.12 
 
 		 194 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000140033  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2301  superoxide dismutase  44.04 
 
 		 193 aa  162  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0685377 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  43.68 
 
 		 229 aa  161  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 192 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 192 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  43.01 
 
 		 192 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 192 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  43.01 
 
 		 192 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  43.01 
 
 		 192 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  39.39 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>