More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1639 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1639  superoxide dismutase  100 
 
 		 194 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000140033  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1747  superoxide dismutase  94.85 
 
 		 194 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000473936  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2503  Superoxide dismutase  84.02 
 
 		 194 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000289489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1782  superoxide dismutase  84.02 
 
 		 194 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000439358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1819  superoxide dismutase  84.02 
 
 		 194 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000821956  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1775  superoxide dismutase  84.02 
 
 		 194 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1687  superoxide dismutase  82.99 
 
 		 194 aa  353  6.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000404322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2881  superoxide dismutase, Fe  82.99 
 
 		 194 aa  353  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1572  superoxide dismutase  82.99 
 
 		 194 aa  352  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.113962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1647  superoxide dismutase  82.99 
 
 		 194 aa  352  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000641638  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1639  manganese and iron superoxide dismutase  82.99 
 
 		 194 aa  352  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1963  superoxide dismutase  83.51 
 
 		 194 aa  352  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1920  superoxide dismutase  83.51 
 
 		 194 aa  352  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00591973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1834  superoxide dismutase  86.08 
 
 		 194 aa  345  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000110112  normal  0.958041 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  79.27 
 
 		 193 aa  333  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205445  hitchhiker  0.00000630572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2159  superoxide dismutase  82.9 
 
 		 193 aa  332  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03014  superoxide dismutase  78.76 
 
 		 199 aa  330  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002934  superoxide dismutase (Fe)  78.76 
 
 		 194 aa  330  6e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000374974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2445  superoxide dismutase  81.35 
 
 		 193 aa  329  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.103269 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1632  superoxide dismutase, Fe  77.72 
 
 		 194 aa  328  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000440787  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3476  superoxide dismutase  76.8 
 
 		 194 aa  323  8.000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1858  superoxide dismutase [Fe]  79.27 
 
 		 194 aa  322  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  75.26 
 
 		 193 aa  311  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1395  superoxide dismutase  74.61 
 
 		 193 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  75.26 
 
 		 193 aa  311  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2448  superoxide dismutase  75.13 
 
 		 193 aa  311  3.9999999999999997e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103073  normal  0.0475458 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02750  iron superoxide dismutase  72.54 
 
 		 193 aa  310  7.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  74.74 
 
 		 193 aa  309  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  74.74 
 
 		 193 aa  309  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  74.23 
 
 		 193 aa  308  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  73.71 
 
 		 193 aa  308  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  73.71 
 
 		 193 aa  308  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  73.71 
 
 		 193 aa  308  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  73.71 
 
 		 193 aa  308  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  73.71 
 
 		 193 aa  308  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  73.71 
 
 		 193 aa  308  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  73.71 
 
 		 193 aa  308  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  73.71 
 
 		 193 aa  308  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  73.71 
 
 		 193 aa  308  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2023  superoxide dismutase  73.58 
 
 		 192 aa  305  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2571  superoxide dismutase  71.88 
 
 		 192 aa  301  5.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.489375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  72.4 
 
 		 192 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000049091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1863  superoxide dismutase  71.88 
 
 		 192 aa  298  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.410173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2180  superoxide dismutase  70.77 
 
 		 194 aa  291  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.678123  normal  0.116868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2196  superoxide dismutase  68.91 
 
 		 192 aa  289  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  hitchhiker  0.00000576689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  69.07 
 
 		 193 aa  288  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  68.56 
 
 		 193 aa  287  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  69.79 
 
 		 198 aa  285  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  69.79 
 
 		 198 aa  286  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  69.07 
 
 		 193 aa  286  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  68.56 
 
 		 193 aa  284  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1791  superoxide dismutase  71.65 
 
 		 193 aa  283  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.027396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  68.56 
 
 		 193 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  68.56 
 
 		 193 aa  282  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  67.71 
 
 		 198 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  67.71 
 
 		 198 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  67.71 
 
 		 198 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  68.21 
 
 		 194 aa  280  8.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  67.36 
 
 		 233 aa  279  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  67.36 
 
 		 233 aa  279  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  66.32 
 
 		 193 aa  275  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2463  Superoxide dismutase  68.04 
 
 		 193 aa  275  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  65.8 
 
 		 221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  65.28 
 
 		 221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  65.8 
 
 		 192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  65.8 
 
 		 192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  65.28 
 
 		 221 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  65.8 
 
 		 192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0947  Superoxide dismutase  64.55 
 
 		 193 aa  272  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.0414637 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  65.8 
 
 		 192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  65.8 
 
 		 192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  63.92 
 
 		 193 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  63.73 
 
 		 192 aa  269  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  63.21 
 
 		 192 aa  269  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  62.69 
 
 		 192 aa  266  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  64.25 
 
 		 192 aa  265  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3194  Superoxide dismutase  62.18 
 
 		 192 aa  265  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194093  normal  0.452704 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1895  superoxide dismutase (Fe)  61.34 
 
 		 193 aa  266  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0298  superoxide dismutase  61.34 
 
 		 193 aa  266  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.775999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2526  superoxide dismutase [Fe] protein  67.88 
 
 		 192 aa  263  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0270769 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  63.21 
 
 		 192 aa  261  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  63.21 
 
 		 192 aa  261  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  63.21 
 
 		 192 aa  261  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  62.18 
 
 		 192 aa  262  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3574  superoxide dismutase  64.43 
 
 		 193 aa  260  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150898  hitchhiker  0.00946106 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2567  superoxide dismutase  63.21 
 
 		 192 aa  259  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000701248  normal  0.136578 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1931  superoxide dismutase  63.21 
 
 		 192 aa  259  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2543  superoxide dismutase  63.21 
 
 		 192 aa  259  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6857  Superoxide dismutase  60.1 
 
 		 197 aa  258  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0552512 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2568  superoxide dismutase  62.56 
 
 		 194 aa  256  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28771  decreased coverage  0.00195196 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1558  Superoxide dismutase  62.89 
 
 		 193 aa  256  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2301  superoxide dismutase  62.89 
 
 		 193 aa  254  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0685377 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  58.33 
 
 		 192 aa  254  7e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1927  superoxide dismutase  62.37 
 
 		 193 aa  254  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630056  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  57.81 
 
 		 192 aa  252  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  61.86 
 
 		 193 aa  252  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2945  superoxide dismutase  61.34 
 
 		 193 aa  250  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1861  superoxide dismutase  60.42 
 
 		 193 aa  248  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4998  Superoxide dismutase  59.79 
 
 		 193 aa  248  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3151  superoxide dismutase  60.82 
 
 		 193 aa  246  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.540565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>