More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2933 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2933  superoxide dismutase  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  52.53 
 
 		 199 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  51.52 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0483  superoxide dismutase  47.74 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3417  manganese and iron superoxide dismutase  47.45 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0123938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  46.73 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  45.45 
 
 		 201 aa  195  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  45.32 
 
 		 204 aa  195  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457319 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  46.23 
 
 		 198 aa  194  8.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1632  superoxide dismutase, Fe  47.24 
 
 		 194 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000440787  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  51.27 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  46.73 
 
 		 199 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03014  superoxide dismutase  46.73 
 
 		 199 aa  192  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1920  superoxide dismutase  47.72 
 
 		 194 aa  192  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00591973  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2881  superoxide dismutase, Fe  47.21 
 
 		 194 aa  192  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002934  superoxide dismutase (Fe)  46.73 
 
 		 194 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000374974  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1572  superoxide dismutase  47.21 
 
 		 194 aa  192  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.113962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1647  superoxide dismutase  47.21 
 
 		 194 aa  192  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000641638  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1639  manganese and iron superoxide dismutase  47.21 
 
 		 194 aa  192  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  47.21 
 
 		 193 aa  191  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  47.96 
 
 		 193 aa  191  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0434  superoxide dismutase  49.75 
 
 		 216 aa  191  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  47.21 
 
 		 193 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  47.21 
 
 		 193 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  47.21 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  47.21 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1863  superoxide dismutase  46.46 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.410173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2503  Superoxide dismutase  46.19 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000289489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1775  superoxide dismutase  46.19 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1782  superoxide dismutase  46.19 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000439358  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  46.39 
 
 		 205 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1819  superoxide dismutase  46.19 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000821956  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  47.45 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02750  iron superoxide dismutase  45.18 
 
 		 193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  47.72 
 
 		 193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  47.21 
 
 		 193 aa  188  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  47.21 
 
 		 193 aa  188  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  47.69 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  47.21 
 
 		 193 aa  188  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  47.21 
 
 		 193 aa  188  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  47.21 
 
 		 193 aa  188  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  45.83 
 
 		 229 aa  188  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  47.21 
 
 		 193 aa  188  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  47.21 
 
 		 193 aa  188  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  47.21 
 
 		 193 aa  188  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  47.72 
 
 		 193 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  47.21 
 
 		 193 aa  188  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  47.72 
 
 		 221 aa  188  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0291  superoxide dismutase  47.74 
 
 		 208 aa  188  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3194  Superoxide dismutase  48.22 
 
 		 192 aa  188  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194093  normal  0.452704 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  45.96 
 
 		 192 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000049091  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  47.21 
 
 		 192 aa  187  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  47.72 
 
 		 192 aa  187  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  48.72 
 
 		 209 aa  187  8e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2571  superoxide dismutase  46.46 
 
 		 192 aa  187  8e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.489375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1687  superoxide dismutase  46.43 
 
 		 194 aa  187  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000404322  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  44.72 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  44.72 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  47.72 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  46.19 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  48.21 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0947  Superoxide dismutase  46.46 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.0414637 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  47.72 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  44.67 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205445  hitchhiker  0.00000630572 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  48.22 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  45.69 
 
 		 233 aa  185  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6857  Superoxide dismutase  45.96 
 
 		 197 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0552512 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0298  superoxide dismutase  46.97 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.775999  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1895  superoxide dismutase (Fe)  46.97 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  45.69 
 
 		 233 aa  185  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  46.19 
 
 		 192 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2567  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 192 aa  184  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000701248  normal  0.136578 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1931  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 192 aa  184  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2543  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 192 aa  184  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 221 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 221 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4998  Superoxide dismutase  45.18 
 
 		 193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  46.7 
 
 		 192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1163  Superoxide dismutase  44.04 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  46.7 
 
 		 192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  44.39 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2196  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  hitchhiker  0.00000576689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1963  superoxide dismutase  44.67 
 
 		 194 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  43.43 
 
 		 198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1747  superoxide dismutase  44.16 
 
 		 194 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000473936  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1858  superoxide dismutase [Fe]  46.23 
 
 		 194 aa  181  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3574  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 193 aa  181  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150898  hitchhiker  0.00946106 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2448  superoxide dismutase  47.21 
 
 		 193 aa  181  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103073  normal  0.0475458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2645  Superoxide dismutase  44.67 
 
 		 193 aa  181  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2945  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 193 aa  181  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1395  superoxide dismutase  44.16 
 
 		 193 aa  181  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  47.21 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2067  superoxide dismutase, Fe  45.31 
 
 		 210 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.854961  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1558  Superoxide dismutase  46.7 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  44.67 
 
 		 193 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>