More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2067 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2067  superoxide dismutase, Fe  100 
 
 		 210 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.854961  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  75.13 
 
 		 205 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1163  Superoxide dismutase  70.5 
 
 		 207 aa  311  3.9999999999999997e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3417  manganese and iron superoxide dismutase  66.99 
 
 		 241 aa  309  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0123938 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2066  Superoxide dismutase  67.8 
 
 		 236 aa  295  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  64.74 
 
 		 198 aa  266  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  61.05 
 
 		 200 aa  249  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  58.95 
 
 		 200 aa  248  4e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  59.59 
 
 		 201 aa  245  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  60 
 
 		 200 aa  245  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  56.84 
 
 		 201 aa  244  8e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 227 aa  241  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2256  superoxide dismutase  55.67 
 
 		 234 aa  241  7.999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00421807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  57.29 
 
 		 197 aa  239  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  56.84 
 
 		 200 aa  238  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1462  Superoxide dismutase  59.07 
 
 		 201 aa  234  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  55.73 
 
 		 198 aa  234  7e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  56.54 
 
 		 199 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  56.48 
 
 		 204 aa  228  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457319 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  54.4 
 
 		 199 aa  227  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1986  Superoxide dismutase  54.74 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0822  superoxide dismutase  54.21 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.600443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  57.73 
 
 		 192 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  57.22 
 
 		 221 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  56.7 
 
 		 221 aa  225  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  57.22 
 
 		 192 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  57.22 
 
 		 192 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  57.22 
 
 		 192 aa  225  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  57.22 
 
 		 192 aa  225  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  57.22 
 
 		 192 aa  225  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  56.7 
 
 		 221 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3219  Superoxide dismutase  55.67 
 
 		 194 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  56.7 
 
 		 192 aa  223  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  56.25 
 
 		 209 aa  224  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  55.08 
 
 		 229 aa  223  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  57.51 
 
 		 192 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  54.21 
 
 		 199 aa  223  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  57.73 
 
 		 194 aa  222  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  53.09 
 
 		 193 aa  222  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  56.19 
 
 		 193 aa  222  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  56.7 
 
 		 192 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2567  superoxide dismutase  57.22 
 
 		 192 aa  222  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000701248  normal  0.136578 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1931  superoxide dismutase  57.22 
 
 		 192 aa  222  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  56.7 
 
 		 192 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2543  superoxide dismutase  57.22 
 
 		 192 aa  222  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  56.99 
 
 		 192 aa  221  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0738  superoxide dismutase, Fe  53.3 
 
 		 206 aa  221  7e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  50.26 
 
 		 200 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  50.26 
 
 		 200 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  54.64 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  54.64 
 
 		 233 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  54.69 
 
 		 209 aa  218  5e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  55.67 
 
 		 193 aa  218  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0073  Superoxide dismutase  55.5 
 
 		 198 aa  217  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0882  superoxide dismutase  54.46 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343803  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  54.12 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  54.64 
 
 		 192 aa  215  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  54.12 
 
 		 192 aa  215  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 193 aa  215  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1558  Superoxide dismutase  53.09 
 
 		 193 aa  214  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25329  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 193 aa  214  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 193 aa  214  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 193 aa  214  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  55.21 
 
 		 193 aa  214  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  55.21 
 
 		 193 aa  214  8e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  55.21 
 
 		 193 aa  214  8e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 193 aa  214  8e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 193 aa  214  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 193 aa  214  8e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 193 aa  214  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 193 aa  214  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 193 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  55.21 
 
 		 193 aa  214  8e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2301  superoxide dismutase  53.09 
 
 		 193 aa  214  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0685377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1927  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  52.33 
 
 		 200 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  54.69 
 
 		 192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000049091  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3194  Superoxide dismutase  53.61 
 
 		 192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194093  normal  0.452704 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2463  Superoxide dismutase  54.12 
 
 		 193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1863  superoxide dismutase  54.17 
 
 		 192 aa  212  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.410173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2568  superoxide dismutase  53.09 
 
 		 194 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28771  decreased coverage  0.00195196 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  54.92 
 
 		 193 aa  211  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205445  hitchhiker  0.00000630572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3574  superoxide dismutase  52.58 
 
 		 193 aa  210  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150898  hitchhiker  0.00946106 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0843  superoxide dismutase, Fe  53.81 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2571  superoxide dismutase  54.17 
 
 		 192 aa  210  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.489375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4998  Superoxide dismutase  51.03 
 
 		 193 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2645  Superoxide dismutase  51.03 
 
 		 193 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  54.69 
 
 		 193 aa  209  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  54.12 
 
 		 192 aa  208  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2023  superoxide dismutase  54.17 
 
 		 192 aa  208  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0291  superoxide dismutase  53.16 
 
 		 208 aa  207  9e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1632  superoxide dismutase, Fe  54.4 
 
 		 194 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000440787  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3476  superoxide dismutase  52.82 
 
 		 194 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03014  superoxide dismutase  53.37 
 
 		 199 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0535  superoxide dismutase  50.51 
 
 		 205 aa  206  1e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.478108  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6857  Superoxide dismutase  51.31 
 
 		 197 aa  207  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0552512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  54.17 
 
 		 193 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0493  superoxide dismutase, Fe  50.51 
 
 		 205 aa  207  1e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3212  manganese and iron superoxide dismutase  51.03 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000662131  normal  0.274821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>