More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0843 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0843  superoxide dismutase, Fe  100 
 
 
205 aa  427  1e-119  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144856  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  53.92 
 
 
201 aa  226  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  53.77 
 
 
209 aa  220  9e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  50.49 
 
 
201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  52.26 
 
 
209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  52.79 
 
 
205 aa  215  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  52.26 
 
 
209 aa  215  4e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1163  Superoxide dismutase  52.79 
 
 
207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2067  superoxide dismutase, Fe  53.81 
 
 
210 aa  210  9e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.854961  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  50 
 
 
200 aa  209  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_002978  WD0738  superoxide dismutase, Fe  51.98 
 
 
206 aa  208  3e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1462  Superoxide dismutase  50.49 
 
 
201 aa  207  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  52.48 
 
 
198 aa  207  8e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  50.49 
 
 
200 aa  207  9e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  51.96 
 
 
227 aa  205  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3417  manganese and iron superoxide dismutase  48.5 
 
 
241 aa  203  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0123938 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  50.49 
 
 
200 aa  203  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  51.49 
 
 
193 aa  202  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205445  hitchhiker  0.00000630572 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  53 
 
 
192 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  53 
 
 
192 aa  201  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2066  Superoxide dismutase  51.01 
 
 
236 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1963  superoxide dismutase  50.25 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1834  superoxide dismutase  50.74 
 
 
194 aa  199  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000110112  normal  0.958041 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1775  superoxide dismutase  49.26 
 
 
194 aa  197  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1782  superoxide dismutase  49.26 
 
 
194 aa  197  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000439358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2503  Superoxide dismutase  49.26 
 
 
194 aa  197  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000289489  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1819  superoxide dismutase  49.26 
 
 
194 aa  197  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000821956  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3476  superoxide dismutase  49.26 
 
 
194 aa  197  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  50.74 
 
 
194 aa  197  9e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  50.76 
 
 
204 aa  196  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.457319 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  48.04 
 
 
199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  49.75 
 
 
200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2881  superoxide dismutase, Fe  48.77 
 
 
194 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1572  superoxide dismutase  48.77 
 
 
194 aa  195  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.113962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1647  superoxide dismutase  48.77 
 
 
194 aa  195  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000641638  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1639  manganese and iron superoxide dismutase  48.77 
 
 
194 aa  195  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  47.52 
 
 
200 aa  194  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  47.52 
 
 
200 aa  194  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1687  superoxide dismutase  48.28 
 
 
194 aa  192  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000404322  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  52.22 
 
 
193 aa  192  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  48.47 
 
 
229 aa  192  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  51.49 
 
 
192 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  50.74 
 
 
193 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03014  superoxide dismutase  50 
 
 
199 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  51.23 
 
 
193 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1632  superoxide dismutase, Fe  50.99 
 
 
194 aa  192  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000440787  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1639  superoxide dismutase  49.26 
 
 
194 aa  192  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000140033  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1747  superoxide dismutase  48.77 
 
 
194 aa  192  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000473936  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  50.74 
 
 
193 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  50.5 
 
 
221 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  50.74 
 
 
193 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  50.74 
 
 
193 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  50.74 
 
 
193 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  47 
 
 
197 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.545768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  50.25 
 
 
193 aa  191  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  50.25 
 
 
193 aa  191  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  50.25 
 
 
193 aa  191  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  50 
 
 
221 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  50.25 
 
 
193 aa  191  8e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  50.25 
 
 
193 aa  191  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  50.25 
 
 
193 aa  191  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  50.25 
 
 
193 aa  191  8e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  50.25 
 
 
193 aa  191  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  50.25 
 
 
193 aa  191  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  50.5 
 
 
192 aa  191  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  50.5 
 
 
233 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  50 
 
 
192 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  50 
 
 
192 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  50 
 
 
192 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  50 
 
 
192 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  49.5 
 
 
221 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  48.04 
 
 
199 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  50.5 
 
 
233 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  51.23 
 
 
193 aa  190  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  50 
 
 
192 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1858  superoxide dismutase [Fe]  49.5 
 
 
194 aa  189  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  49.75 
 
 
198 aa  189  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002934  superoxide dismutase (Fe)  49.01 
 
 
194 aa  189  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000374974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  50.25 
 
 
193 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2256  superoxide dismutase  47.96 
 
 
234 aa  188  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00421807  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  50.25 
 
 
193 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0913  manganese and iron superoxide dismutase  46.8 
 
 
201 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  49.5 
 
 
192 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  49.5 
 
 
192 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1920  superoxide dismutase  47.29 
 
 
194 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00591973  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  48.51 
 
 
192 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  49.5 
 
 
192 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  49.01 
 
 
192 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  50.25 
 
 
193 aa  185  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  47.03 
 
 
193 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0535  superoxide dismutase  47.5 
 
 
205 aa  185  4e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.478108  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  49.01 
 
 
193 aa  185  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2159  superoxide dismutase  48.02 
 
 
193 aa  185  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2463  Superoxide dismutase  48.02 
 
 
193 aa  184  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  48.5 
 
 
192 aa  185  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000049091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1986  Superoxide dismutase  47.67 
 
 
238 aa  184  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2567  superoxide dismutase  49.5 
 
 
192 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000701248  normal  0.136578 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1931  superoxide dismutase  49.5 
 
 
192 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2543  superoxide dismutase  49.5 
 
 
192 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  47.21 
 
 
199 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>