More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2256 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2256  superoxide dismutase  100 
 
 		 234 aa  488  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00421807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3417  manganese and iron superoxide dismutase  57.73 
 
 		 241 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0123938 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  54.64 
 
 		 205 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2067  superoxide dismutase, Fe  55.67 
 
 		 210 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.854961  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2066  Superoxide dismutase  52.31 
 
 		 236 aa  232  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1163  Superoxide dismutase  53.12 
 
 		 207 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  51.55 
 
 		 198 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  48.97 
 
 		 201 aa  214  7e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  50.77 
 
 		 200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0822  superoxide dismutase  49.02 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.600443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  49.21 
 
 		 229 aa  211  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  47.42 
 
 		 199 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  50.51 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  46.15 
 
 		 200 aa  207  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  46.15 
 
 		 200 aa  207  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  46.57 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1986  Superoxide dismutase  48.48 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  48.19 
 
 		 200 aa  205  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  46.88 
 
 		 198 aa  204  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1462  Superoxide dismutase  51.55 
 
 		 201 aa  202  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 200 aa  202  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  47.18 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  48.45 
 
 		 200 aa  198  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  44.79 
 
 		 197 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  45.54 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  48.21 
 
 		 192 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  45.07 
 
 		 221 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  48.21 
 
 		 192 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  48.21 
 
 		 192 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  48.21 
 
 		 192 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  48.21 
 
 		 192 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  48.21 
 
 		 192 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 193 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  43.3 
 
 		 204 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  46.67 
 
 		 193 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  46.67 
 
 		 193 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  44.6 
 
 		 221 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0843  superoxide dismutase, Fe  47.96 
 
 		 205 aa  188  5e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144856  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  47.69 
 
 		 192 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  47.69 
 
 		 192 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2567  superoxide dismutase  47.69 
 
 		 192 aa  187  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000701248  normal  0.136578 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1931  superoxide dismutase  47.69 
 
 		 192 aa  187  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2543  superoxide dismutase  47.69 
 
 		 192 aa  187  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2645  Superoxide dismutase  45.6 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  47.69 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  47.69 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4998  Superoxide dismutase  45.13 
 
 		 193 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  45.77 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  45.77 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  47.18 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  47.18 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  47.18 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 193 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  46.91 
 
 		 193 aa  185  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03014  superoxide dismutase  46.31 
 
 		 199 aa  185  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 192 aa  185  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 193 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  45.13 
 
 		 192 aa  184  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  45.41 
 
 		 193 aa  184  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  45.13 
 
 		 192 aa  184  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  46.63 
 
 		 193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  45.88 
 
 		 193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0073  Superoxide dismutase  44.85 
 
 		 198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  44.27 
 
 		 199 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1632  superoxide dismutase, Fe  47.45 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000440787  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  44.62 
 
 		 192 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  43.59 
 
 		 192 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  44.39 
 
 		 193 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205445  hitchhiker  0.00000630572 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0483  superoxide dismutase  47.15 
 
 		 204 aa  181  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002934  superoxide dismutase (Fe)  46.43 
 
 		 194 aa  181  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000374974  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  45.13 
 
 		 193 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  44.9 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  44.62 
 
 		 198 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  44.1 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  44.62 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  44.1 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000049091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  44.62 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3194  Superoxide dismutase  43.59 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194093  normal  0.452704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3219  Superoxide dismutase  43.59 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  45.13 
 
 		 194 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  43.68 
 
 		 200 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1863  superoxide dismutase  43.59 
 
 		 192 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.410173  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1676  Superoxide dismutase  41.67 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  44.62 
 
 		 198 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1646  superoxide dismutase  42.11 
 
 		 199 aa  177  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.571059  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6857  Superoxide dismutase  41.54 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0552512 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  43.98 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  43.98 
 
 		 209 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2571  superoxide dismutase  43.59 
 
 		 192 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.489375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  43.46 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  44.62 
 
 		 192 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1927  superoxide dismutase  42.49 
 
 		 193 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>