171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52530 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_52530  putative thioredoxin peroxidase  100 
 
 
166 aa  334  2.9999999999999997e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.58356  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03687  thioredoxin peroxidase/alkyl hydroperoxide reductase (Eurofung)  56.6 
 
 
184 aa  171  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1257  Redoxin domain protein  38.65 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0899  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.52 
 
 
162 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2558  redoxin domain-containing protein  44.83 
 
 
162 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3007  redoxin domain-containing protein  44.52 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3519  anti-oxidant AhpCTSA family protein  39.52 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3544  anti-oxidant AhpCTSA family protein  39.52 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3538  AhpC/TSA family protein  39.52 
 
 
214 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  42.07 
 
 
157 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0592  redoxin domain-containing protein  39.88 
 
 
161 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00120  conserved hypothetical protein  38.27 
 
 
224 aa  105  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.466966  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  38.46 
 
 
166 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  37.42 
 
 
162 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.69 
 
 
157 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1324  AhpC/TSA family protein  38.69 
 
 
190 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3239  AhpC/TSA family protein  38.69 
 
 
185 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  39.05 
 
 
166 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
161 aa  104  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2544  AhpC/TSA family protein  38.69 
 
 
214 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0465  AhpC/TSA family protein  38.69 
 
 
214 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490707  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2472  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  39.75 
 
 
161 aa  104  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.935379  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  39.64 
 
 
161 aa  104  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  35.93 
 
 
169 aa  104  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2596  redoxin domain-containing protein  40.69 
 
 
161 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1124  AhpC/TSA family protein  37.5 
 
 
185 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2325  redoxin domain-containing protein  37.27 
 
 
168 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  40.69 
 
 
157 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  45 
 
 
157 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3057  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.14 
 
 
159 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_56578  predicted protein  39.47 
 
 
202 aa  101  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.651605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  40.69 
 
 
157 aa  101  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  40.69 
 
 
157 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  40.69 
 
 
157 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  40.69 
 
 
157 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  40 
 
 
158 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  41.1 
 
 
158 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0113  redoxin  36.81 
 
 
160 aa  99.8  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  40.69 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2623  Redoxin domain protein  36.2 
 
 
160 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  40.71 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  39.31 
 
 
157 aa  99  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  36.53 
 
 
168 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  34.73 
 
 
167 aa  99  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  38.16 
 
 
166 aa  98.2  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0494  redoxin domain-containing protein  40 
 
 
168 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570161  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  34.73 
 
 
167 aa  97.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2818  Redoxin domain protein  35.58 
 
 
160 aa  97.4  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2595  redoxin domain-containing protein  35.58 
 
 
160 aa  97.4  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3651  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.31 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000135148  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2718  Redoxin domain protein  37.2 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.98 
 
 
167 aa  97.1  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0083  redoxin  39.29 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000103454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0565  redoxin domain-containing protein  39.29 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0157246  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06423  peroxiredoxin  37.58 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  38.62 
 
 
178 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  40.98 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3083  Redoxin domain protein  36.9 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0388194  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0501  Redoxin domain protein  37.41 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  40.41 
 
 
160 aa  96.3  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0536  redoxin domain-containing protein  39.29 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397441  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.99 
 
 
159 aa  95.5  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  32.5 
 
 
249 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17484  predicted protein  35.53 
 
 
156 aa  95.1  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  31.87 
 
 
251 aa  94.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0439  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  35.53 
 
 
162 aa  94.7  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08080  allergen, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01440)  38.85 
 
 
167 aa  94.4  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.804154 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.89 
 
 
168 aa  94.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92238  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  33.73 
 
 
247 aa  94.4  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  33.73 
 
 
247 aa  94.4  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3087  redoxin domain-containing protein  32.53 
 
 
166 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  34.97 
 
 
160 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0619  Redoxin domain protein  35.8 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0042  anti-oxidant AhpCTSA family protein  35.71 
 
 
168 aa  93.2  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0661  Redoxin domain protein  34.97 
 
 
161 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.165122 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  34.38 
 
 
247 aa  93.2  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5199  redoxin domain-containing protein  33.77 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271736  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  36.02 
 
 
157 aa  92  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.09 
 
 
183 aa  91.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144432  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  34.12 
 
 
169 aa  91.7  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0530  redoxin domain-containing protein  33.74 
 
 
161 aa  91.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  35.58 
 
 
161 aa  91.7  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.89 
 
 
168 aa  91.3  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  34.97 
 
 
160 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  34.93 
 
 
160 aa  91.3  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  36.23 
 
 
242 aa  91.3  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  36.6 
 
 
168 aa  90.9  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  32.92 
 
 
162 aa  90.9  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  35.62 
 
 
160 aa  90.9  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  34.68 
 
 
192 aa  90.9  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3915  redoxin domain-containing protein  35.19 
 
 
159 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.145792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2700  redoxin domain protein  33.13 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1324  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant  32.59 
 
 
190 aa  90.1  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.71 
 
 
168 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  33.56 
 
 
242 aa  89.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  34.1 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3052  redoxin domain-containing protein  33.13 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>