170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2325 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2325  redoxin domain-containing protein  100 
 
 		 168 aa  342  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2472  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  57.23 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.935379  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3007  redoxin domain-containing protein  52.5 
 
 		 162 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0899  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50.62 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2558  redoxin domain-containing protein  50 
 
 		 162 aa  167  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0439  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50.92 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0113  redoxin  50.32 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  45.62 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.51 
 
 		 167 aa  147  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4027  peroxiredoxin-like protein  45 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  46.25 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1343  peroxiredoxin-like protein  44.65 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255262  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  45.62 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  45 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  44.65 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  43.4 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.17 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  44.65 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4075  peroxiredoxin-like protein  43.83 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.896251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0619  Redoxin domain protein  44.79 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1067  peroxiredoxin  43.75 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  43.12 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0661  Redoxin domain protein  44.38 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.165122 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0530  redoxin domain-containing protein  43.12 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4747  Redoxin domain protein  42.14 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  39.88 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2818  Redoxin domain protein  40.74 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  43.59 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  43.59 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  43.59 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2595  redoxin domain-containing protein  40.74 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.59 
 
 		 158 aa  124  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  43.59 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  41.51 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2596  redoxin domain-containing protein  42.14 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2623  Redoxin domain protein  40.12 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  43.59 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  44.23 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  43.59 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  43.59 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3915  redoxin domain-containing protein  40.62 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145792 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.59 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  42.95 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0483  thiol peroxidase  40.88 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06423  peroxiredoxin  41.67 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  42.68 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0951  putative peroxiredoxin  46.04 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.148763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  42.42 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3732  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  40.25 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3057  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.25 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  41.67 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3083  Redoxin domain protein  42.51 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0388194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  40.37 
 
 		 161 aa  117  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1257  Redoxin domain protein  38.65 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2718  Redoxin domain protein  41.92 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.16 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.79 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.59 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  40.76 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  39.62 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  42.44 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0501  Redoxin domain protein  41.4 
 
 		 158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.72 
 
 		 168 aa  114  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  41.21 
 
 		 168 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0592  redoxin domain-containing protein  40 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  41.18 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2686  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.25 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  40.85 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  40.24 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0283  Redoxin domain protein  41.82 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00098707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  41.14 
 
 		 185 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  40.61 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3020  Redoxin domain protein  38.75 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.02 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144432  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  38.46 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  39.38 
 
 		 249 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  40 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  40.32 
 
 		 157 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  38.96 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  38.18 
 
 		 166 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  38.96 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  37.2 
 
 		 251 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  37.8 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0494  redoxin domain-containing protein  38.32 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  37.5 
 
 		 248 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  37.5 
 
 		 248 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  38.41 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  36.25 
 
 		 243 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  36.25 
 
 		 243 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  39.29 
 
 		 245 aa  103  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_56578  predicted protein  37.06 
 
 		 202 aa  103  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.651605  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  33.33 
 
 		 247 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  33.33 
 
 		 247 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.54 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52530  putative thioredoxin peroxidase  37.27 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.58356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17484  predicted protein  42.86 
 
 		 156 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6651  Redoxin domain protein  37.9 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  37.2 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  33.75 
 
 		 245 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>