240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2558 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2558  redoxin domain-containing protein  100 
 
 		 162 aa  327  6e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0899  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  99.38 
 
 		 162 aa  325  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3007  redoxin domain-containing protein  90.12 
 
 		 162 aa  303  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2472  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  72.67 
 
 		 161 aa  250  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.935379  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0113  redoxin  71.88 
 
 		 160 aa  247  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0439  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  54.94 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  51.85 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2325  redoxin domain-containing protein  50 
 
 		 168 aa  167  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  52.8 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2596  redoxin domain-containing protein  49.38 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.91 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.07 
 
 		 157 aa  154  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  43.83 
 
 		 162 aa  153  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.91 
 
 		 167 aa  153  9e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  49.38 
 
 		 161 aa  152  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3915  redoxin domain-containing protein  45.96 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  49.69 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  49.69 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  49.69 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  49.69 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  49.69 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  49.69 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0619  Redoxin domain protein  47.17 
 
 		 161 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0661  Redoxin domain protein  47.17 
 
 		 161 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.165122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  48.45 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  48.45 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  46.3 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0483  thiol peroxidase  48.15 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2623  Redoxin domain protein  44.44 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2818  Redoxin domain protein  44.44 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  45.06 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2595  redoxin domain-containing protein  44.44 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06423  peroxiredoxin  49.07 
 
 		 157 aa  147  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  48.45 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  50.34 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0592  redoxin domain-containing protein  47.17 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  45.06 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  49.07 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4027  peroxiredoxin-like protein  46.91 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0530  redoxin domain-containing protein  45.91 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3732  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  45.06 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  43.83 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1343  peroxiredoxin-like protein  45.68 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255262  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4075  peroxiredoxin-like protein  45.68 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.896251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.3 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  48.45 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  47.8 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  45.96 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0501  Redoxin domain protein  46.58 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1257  Redoxin domain protein  45.91 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3020  Redoxin domain protein  48.43 
 
 		 160 aa  141  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563791 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1067  peroxiredoxin  44.03 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  44.03 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.34 
 
 		 157 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  43.45 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  41.98 
 
 		 159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2686  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.21 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  42.77 
 
 		 169 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  45.18 
 
 		 168 aa  137  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  46.95 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4747  Redoxin domain protein  45.4 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2700  redoxin domain protein  44.31 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3052  redoxin domain-containing protein  44.31 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  43.37 
 
 		 168 aa  137  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  44.05 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  44.64 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  43.45 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  46.06 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  43.45 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  44.72 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  50.76 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3087  redoxin domain-containing protein  43.11 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17484  predicted protein  47.06 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.2 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  42.42 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.37 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144432  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.26 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  43.45 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  42.77 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_56578  predicted protein  44.2 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.651605  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  42.86 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  42.26 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0951  putative peroxiredoxin  44.76 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.148763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3544  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.45 
 
 		 168 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3218  redoxin domain-containing protein  42.26 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0848811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3519  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.45 
 
 		 168 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1324  AhpC/TSA family protein  43.45 
 
 		 190 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3239  AhpC/TSA family protein  43.45 
 
 		 185 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  42.26 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1124  AhpC/TSA family protein  42.86 
 
 		 185 aa  127  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0494  redoxin domain-containing protein  42.86 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2718  Redoxin domain protein  42.86 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2544  AhpC/TSA family protein  43.45 
 
 		 214 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3538  AhpC/TSA family protein  43.45 
 
 		 214 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0465  AhpC/TSA family protein  43.45 
 
 		 214 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490707  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.17 
 
 		 168 aa  127  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0042  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.76 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0283  Redoxin domain protein  42.42 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00098707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  42.17 
 
 		 185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3651  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.86 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000135148  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>