134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_35948 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_35948  glucosamine 6-phosphate synthetase and asparagine synthase-like protein  100 
 
 
659 aa  1362    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.382239  normal  0.0988202 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03677  asparagine synthase related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12480)  32.2 
 
 
592 aa  213  7.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670692  decreased coverage  0.00785446 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00430  cytoplasm protein, putative  27.44 
 
 
572 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119575  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing) related protein  27.24 
 
 
548 aa  150  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.11894  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49902  predicted protein  30.5 
 
 
593 aa  107  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0165  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.6 
 
 
513 aa  97.8  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.598052  normal  0.507079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  23.91 
 
 
488 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.8 
 
 
514 aa  87.8  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0205  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.34 
 
 
530 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0725  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.78 
 
 
513 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0343792  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1737  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.16 
 
 
513 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0465  asparagine synthase  23.59 
 
 
468 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  21.14 
 
 
554 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  21.14 
 
 
554 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.14 
 
 
554 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  21.14 
 
 
554 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  21.14 
 
 
554 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  21.14 
 
 
554 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  21.14 
 
 
554 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  22.35 
 
 
554 aa  68.6  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  21.14 
 
 
554 aa  68.2  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  22.38 
 
 
554 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  23.49 
 
 
498 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  22.18 
 
 
554 aa  65.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  21.01 
 
 
554 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  21.79 
 
 
556 aa  65.1  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  22.18 
 
 
554 aa  64.7  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  22.18 
 
 
554 aa  64.7  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  21.3 
 
 
554 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  21.97 
 
 
554 aa  64.3  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  21.97 
 
 
554 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  22.2 
 
 
554 aa  63.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  22.54 
 
 
554 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  22.01 
 
 
554 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1617  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.69 
 
 
583 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  22.02 
 
 
554 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  22.02 
 
 
554 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1366  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.04 
 
 
642 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  22.02 
 
 
554 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  21.24 
 
 
554 aa  62.4  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  22.54 
 
 
554 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  22.52 
 
 
498 aa  60.8  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  21.5 
 
 
554 aa  60.1  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3348  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.17 
 
 
643 aa  58.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  22.22 
 
 
573 aa  58.5  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  21.66 
 
 
554 aa  58.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  22.24 
 
 
553 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  22.16 
 
 
557 aa  58.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  20.96 
 
 
602 aa  57  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  21.17 
 
 
554 aa  56.6  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2386  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.22 
 
 
554 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.654629  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2216  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.23 
 
 
596 aa  57  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  22.35 
 
 
554 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  20.68 
 
 
554 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  21.81 
 
 
554 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  21.81 
 
 
554 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2388  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.13 
 
 
627 aa  55.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  20.43 
 
 
554 aa  54.7  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  20.83 
 
 
633 aa  54.3  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  20.83 
 
 
633 aa  54.3  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  20.83 
 
 
633 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  20.83 
 
 
633 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  20.83 
 
 
633 aa  54.3  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  20.83 
 
 
633 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  20.83 
 
 
633 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  20.83 
 
 
633 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3533  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  24.81 
 
 
621 aa  53.9  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3175  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  24.42 
 
 
643 aa  53.9  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  20.85 
 
 
605 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000628708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3317  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  22.1 
 
 
629 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  20.4 
 
 
633 aa  52.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  20.78 
 
 
632 aa  53.1  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  20.78 
 
 
632 aa  52.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.36 
 
 
528 aa  52  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3256  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.83 
 
 
634 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00445489  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.02 
 
 
633 aa  52.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  20.13 
 
 
632 aa  52.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0961  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.41 
 
 
628 aa  52  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  21.64 
 
 
537 aa  51.2  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0733  asparagine synthase  24.03 
 
 
246 aa  51.2  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00503578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04798  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.62 
 
 
646 aa  51.2  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  22 
 
 
554 aa  51.2  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  22.95 
 
 
639 aa  50.8  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  20.42 
 
 
556 aa  50.8  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0058  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  20.66 
 
 
629 aa  50.8  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  31.75 
 
 
554 aa  50.8  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1636  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.63 
 
 
643 aa  50.4  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.2 
 
 
634 aa  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  31.75 
 
 
552 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  23.2 
 
 
503 aa  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1501  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.6 
 
 
614 aa  50.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2327  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  21.41 
 
 
629 aa  49.7  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.752356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10620  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  21.36 
 
 
642 aa  49.7  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.295992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  20.18 
 
 
610 aa  49.7  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0474  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.49 
 
 
633 aa  49.3  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.23 
 
 
629 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0668  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  21.8 
 
 
651 aa  49.3  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.223123  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  30.93 
 
 
555 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.96 
 
 
633 aa  48.9  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13023  probable asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  22.22 
 
 
597 aa  48.5  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>