65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49902 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_49902  predicted protein  100 
 
 
593 aa  1213    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119575  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing) related protein  39.24 
 
 
548 aa  177  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.11894  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00430  cytoplasm protein, putative  35.31 
 
 
572 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03677  asparagine synthase related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12480)  29.86 
 
 
592 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670692  decreased coverage  0.00785446 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35948  glucosamine 6-phosphate synthetase and asparagine synthase-like protein  31.3 
 
 
659 aa  120  9e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.382239  normal  0.0988202 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24 
 
 
514 aa  83.6  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0725  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.37 
 
 
513 aa  76.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0343792  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0205  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.44 
 
 
530 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1737  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.73 
 
 
513 aa  71.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  28.01 
 
 
488 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0165  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.37 
 
 
513 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.598052  normal  0.507079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  38 
 
 
498 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0465  asparagine synthase  33.33 
 
 
468 aa  52  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371494  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3539  asparagine synthase  29.95 
 
 
389 aa  50.8  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1754  asparagine synthase  30.48 
 
 
387 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  37 
 
 
498 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0733  asparagine synthase  23.59 
 
 
246 aa  49.7  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00503578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2921  asparagine synthase family protein  35.64 
 
 
499 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.458413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.05 
 
 
510 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.96 
 
 
510 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.05 
 
 
510 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.05 
 
 
510 aa  48.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.05 
 
 
510 aa  48.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  32.08 
 
 
492 aa  47.4  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  33.88 
 
 
482 aa  47.4  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  33.33 
 
 
554 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2386  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.6 
 
 
554 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.654629  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  33.33 
 
 
552 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  34.34 
 
 
554 aa  45.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  29.46 
 
 
554 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  35.45 
 
 
503 aa  45.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0834  hypothetical protein  28.14 
 
 
319 aa  45.4  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  29.46 
 
 
554 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  40 
 
 
512 aa  44.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  33.66 
 
 
554 aa  45.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  29.13 
 
 
554 aa  44.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  29.13 
 
 
554 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  29.13 
 
 
554 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  29.13 
 
 
554 aa  44.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  29.13 
 
 
554 aa  44.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.71 
 
 
510 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0774  asparagine synthase  35.25 
 
 
332 aa  44.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.780616  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  29.46 
 
 
554 aa  44.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.71 
 
 
510 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  29.13 
 
 
554 aa  44.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  29.13 
 
 
554 aa  44.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  33 
 
 
554 aa  44.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  28.35 
 
 
554 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.13 
 
 
554 aa  44.3  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  32.32 
 
 
554 aa  44.3  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  28.35 
 
 
554 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  28.35 
 
 
554 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  28.35 
 
 
554 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  28.35 
 
 
554 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  29.13 
 
 
554 aa  44.3  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  32.32 
 
 
553 aa  44.3  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5684  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.37 
 
 
607 aa  44.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.195642  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0855  asparagine synthase  32.8 
 
 
334 aa  44.3  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.489372  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  32.32 
 
 
557 aa  44.3  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.37 
 
 
536 aa  43.9  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  32.67 
 
 
555 aa  43.9  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  32.32 
 
 
554 aa  43.9  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  32.32 
 
 
554 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  32.32 
 
 
554 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  28.35 
 
 
554 aa  43.5  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>