More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29079 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_29079  Alcohol dehydrogenase, class V  100 
 
 
374 aa  771    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34588  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  88.74 
 
 
374 aa  649    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88760  alcohol dehydrogenase (NADP dependent)  80.32 
 
 
374 aa  603  1.0000000000000001e-171  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17102  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31312  NAD/NADP dependent alcohol dehydrogenase  49.86 
 
 
371 aa  359  3e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02860  oxidoreductase, zinc-binding (AFU_orthologue; AFUA_3G11900)  43.44 
 
 
360 aa  278  8e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.937367 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45137  NADPH-dependent alcohol dehydrogenase  43.72 
 
 
357 aa  278  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.04 
 
 
346 aa  259  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 
347 aa  256  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.51 
 
 
347 aa  252  9.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.68 
 
 
349 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.31 
 
 
347 aa  244  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05355  zinc-binding alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02430)  41.27 
 
 
359 aa  242  9e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782945  hitchhiker  0.00985876 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  41.9 
 
 
348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.92 
 
 
348 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.12 
 
 
348 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.66 
 
 
348 aa  230  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  41.19 
 
 
352 aa  229  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02940  alcohol dehydrogenase (NADP+), putative  40.71 
 
 
367 aa  228  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.013941  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11177  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01980)  37.97 
 
 
364 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.55 
 
 
350 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  40.55 
 
 
350 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  40.55 
 
 
350 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  39.33 
 
 
348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 
348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 
348 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  38 
 
 
346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 
348 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  36.8 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  40.64 
 
 
347 aa  213  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18470  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  38.76 
 
 
358 aa  212  7.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0560107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.5 
 
 
351 aa  210  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.98 
 
 
353 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
348 aa  209  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1541  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.61 
 
 
409 aa  208  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.57 
 
 
350 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1754  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.19 
 
 
350 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0138485  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 
350 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0771  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.72 
 
 
353 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000114333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 
350 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4928  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.6 
 
 
350 aa  205  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125922  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8883  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.61 
 
 
346 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 
352 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  38.97 
 
 
350 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.66 
 
 
347 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.07 
 
 
348 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2053  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.31 
 
 
412 aa  204  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
352 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  38.17 
 
 
350 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
354 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2715  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.45 
 
 
351 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0152  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.48 
 
 
354 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.49 
 
 
354 aa  202  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.58 
 
 
351 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.39 
 
 
350 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.8 
 
 
350 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.88 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.88 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.43 
 
 
347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.88 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.58 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.88 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.88 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
350 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
350 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
350 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
350 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.08 
 
 
349 aa  200  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  38.65 
 
 
350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.74 
 
 
348 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
350 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.77 
 
 
352 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  38.01 
 
 
348 aa  199  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03030  zinc-binding alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02430)  37.29 
 
 
361 aa  199  9e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.105149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6455  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.9 
 
 
350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0400  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.14 
 
 
352 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.654367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  38.17 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.280173  normal  0.967284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2951  alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05140  zinc-type alcohol dehydrogenase, putative  39.09 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3269  alcohol dehydrogenase  38.17 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1946  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40 
 
 
351 aa  196  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101054  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03296  alcohol dehydrogenase  39.7 
 
 
352 aa  196  8.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.7 
 
 
347 aa  196  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3208  alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
352 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  37.72 
 
 
352 aa  195  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4527  alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 
346 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.45 
 
 
351 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 
359 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  35.73 
 
 
352 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0401  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.38 
 
 
352 aa  193  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.189509  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.17 
 
 
353 aa  193  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.43 
 
 
348 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1098  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.45 
 
 
361 aa  191  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632504  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2634  alcohol dehydrogenase  39.08 
 
 
387 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00621728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3357  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.76 
 
 
352 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.1 
 
 
351 aa  189  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.06 
 
 
351 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3166  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.45 
 
 
352 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1905  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.78 
 
 
358 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>