More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88760 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_88760  alcohol dehydrogenase (NADP dependent)  100 
 
 
374 aa  768    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17102  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29079  Alcohol dehydrogenase, class V  80.32 
 
 
374 aa  603  1.0000000000000001e-171  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34588  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  77.36 
 
 
374 aa  568  1e-161  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31312  NAD/NADP dependent alcohol dehydrogenase  51.5 
 
 
371 aa  366  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02860  oxidoreductase, zinc-binding (AFU_orthologue; AFUA_3G11900)  42.74 
 
 
360 aa  272  8.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.937367 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45137  NADPH-dependent alcohol dehydrogenase  40.98 
 
 
357 aa  265  1e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.44 
 
 
346 aa  242  9e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  41.9 
 
 
347 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40 
 
 
347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05355  zinc-binding alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02430)  39.94 
 
 
359 aa  233  6e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782945  hitchhiker  0.00985876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.28 
 
 
349 aa  232  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.43 
 
 
348 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  38.33 
 
 
348 aa  230  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.48 
 
 
347 aa  229  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11177  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01980)  39.52 
 
 
364 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  40.62 
 
 
352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.68 
 
 
348 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.42 
 
 
348 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 
348 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  41.23 
 
 
348 aa  216  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  37.31 
 
 
348 aa  212  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  39.33 
 
 
348 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 
348 aa  209  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02940  alcohol dehydrogenase (NADP+), putative  38.42 
 
 
367 aa  208  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.013941  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.86 
 
 
350 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  38.86 
 
 
350 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  38.86 
 
 
350 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18470  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  37.71 
 
 
358 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0560107  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8883  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.2 
 
 
346 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  39 
 
 
347 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.28 
 
 
353 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1541  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37 
 
 
409 aa  206  7e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.5 
 
 
351 aa  206  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.69 
 
 
349 aa  205  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.89 
 
 
350 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05140  zinc-type alcohol dehydrogenase, putative  37.22 
 
 
353 aa  204  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40 
 
 
352 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  36.96 
 
 
346 aa  203  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0401  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.92 
 
 
352 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.189509  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2053  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.98 
 
 
412 aa  202  6e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 
348 aa  202  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2715  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.45 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1754  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.94 
 
 
350 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0138485  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0771  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000114333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.53 
 
 
351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.69 
 
 
352 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 
350 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0400  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.69 
 
 
352 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.654367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.09 
 
 
350 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.24 
 
 
348 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  38.87 
 
 
354 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.58 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.28 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.28 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.28 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.28 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.28 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  37.69 
 
 
350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03030  zinc-binding alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02430)  37.29 
 
 
361 aa  196  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.105149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.03 
 
 
351 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
350 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1098  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.66 
 
 
361 aa  194  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632504  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2951  alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 
349 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 
350 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
352 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4928  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.44 
 
 
350 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125922  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  36.8 
 
 
352 aa  193  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  37.13 
 
 
352 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
350 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0972  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.44 
 
 
349 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0846  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.44 
 
 
349 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.41 
 
 
351 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
353 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.32 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.07 
 
 
350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  37.83 
 
 
350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.83 
 
 
350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  37.83 
 
 
350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  36.34 
 
 
350 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.280173  normal  0.967284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.16 
 
 
348 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.92 
 
 
347 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3269  alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
350 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  36.07 
 
 
348 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0152  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.09 
 
 
354 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
350 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
350 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35470  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 
349 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  36.95 
 
 
350 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3208  alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
352 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0478  NADP-alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
352 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32390  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.12 
 
 
351 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6455  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.24 
 
 
350 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2634  alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
387 aa  186  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00621728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.84 
 
 
354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  36.97 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.46 
 
 
374 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1946  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.21 
 
 
351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101054  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0418  alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.820032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.18 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1575  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.36 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.847733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>