73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44133 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_44131  predicted protein  40.63 
 
 
1111 aa  769    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847147  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44133  predicted protein  100 
 
 
1012 aa  2086    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54411  predicted protein  30.6 
 
 
626 aa  145  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0187117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  31.1 
 
 
663 aa  77.4  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  27.59 
 
 
523 aa  74.3  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  26.4 
 
 
504 aa  68.2  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  28.09 
 
 
659 aa  67.4  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.17 
 
 
508 aa  67  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.23 
 
 
509 aa  65.9  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.84 
 
 
503 aa  65.5  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  26.96 
 
 
518 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.96 
 
 
518 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.96 
 
 
518 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.67 
 
 
627 aa  63.9  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  27.16 
 
 
638 aa  64.3  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  26.96 
 
 
518 aa  63.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  26.96 
 
 
518 aa  63.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  28.32 
 
 
512 aa  62.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  25.74 
 
 
575 aa  62.4  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  25.49 
 
 
574 aa  61.6  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.57 
 
 
533 aa  61.2  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3478  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.43 
 
 
508 aa  60.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622587  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.38 
 
 
607 aa  61.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  24.21 
 
 
580 aa  60.1  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.41 
 
 
508 aa  60.1  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  25.96 
 
 
657 aa  60.1  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.41 
 
 
508 aa  60.1  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  29.29 
 
 
556 aa  60.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.5 
 
 
605 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  23.79 
 
 
530 aa  59.3  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  31.63 
 
 
515 aa  58.9  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.59 
 
 
516 aa  59.3  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.47 
 
 
587 aa  58.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  28.47 
 
 
523 aa  57.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.9 
 
 
517 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  27.54 
 
 
523 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  27.78 
 
 
520 aa  56.2  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  27.78 
 
 
520 aa  56.2  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  28.97 
 
 
539 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.78 
 
 
523 aa  55.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.05 
 
 
523 aa  55.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  28.24 
 
 
663 aa  53.5  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.08 
 
 
517 aa  53.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  28.36 
 
 
529 aa  52.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  24.07 
 
 
520 aa  52.4  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  25.51 
 
 
558 aa  52  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.18 
 
 
1284 aa  50.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10661  5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14310)  26.79 
 
 
666 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  27 
 
 
532 aa  50.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.22 
 
 
530 aa  49.7  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  25 
 
 
529 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2186  5'-Nucleotidase domain protein  31.48 
 
 
260 aa  48.5  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0888112  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  25 
 
 
526 aa  48.1  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  25 
 
 
872 aa  48.5  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1472  5'-nucleotidase  24.62 
 
 
505 aa  48.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.092078 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.04 
 
 
561 aa  47.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1750  5'-nucleotidase  24.62 
 
 
500 aa  47.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.398789 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  25.46 
 
 
529 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  30.84 
 
 
504 aa  47  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  25.33 
 
 
772 aa  46.6  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  25.33 
 
 
772 aa  46.6  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.48 
 
 
1202 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.48 
 
 
1215 aa  47  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  25.98 
 
 
529 aa  46.2  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  25.46 
 
 
529 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3839  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.66 
 
 
502 aa  46.2  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0174247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.51 
 
 
722 aa  46.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4645  5'-Nucleotidase domain protein  28.78 
 
 
506 aa  45.8  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  25.46 
 
 
529 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2137  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.14 
 
 
571 aa  45.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000210765  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.14 
 
 
555 aa  45.4  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.98 
 
 
529 aa  45.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  26.43 
 
 
580 aa  44.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>