More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_27385 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_27385  predicted protein  100 
 
 		 697 aa  1458    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.648257  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23867  predicted protein  42.49 
 
 		 541 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 580 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 569 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 563 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 555 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 587 aa  392  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72287  glutaminyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 799 aa  391  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579144  normal  0.826623 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 555 aa  391  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 555 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 556 aa  392  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 552 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 548 aa  386  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 568 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 565 aa  382  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 565 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 556 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09157  Glutaminyl-tRNA synthetase (Eurofung)  36.82 
 
 		 628 aa  381  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 565 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 565 aa  382  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 566 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 561 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 572 aa  382  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 568 aa  382  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 567 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 555 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 561 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 560 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 567 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 556 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00970277  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 570 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 556 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 554 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 554 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 554 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 567 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 554 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 555 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 554 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 555 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 554 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 554 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 556 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 554 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 555 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  39.76 
 
 		 554 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 567 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 555 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 565 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 554 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 589 aa  379  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 554 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3240  glutaminyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 556 aa  375  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00746606  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 564 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1012  glutaminyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 705 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 556 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 556 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 564 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 564 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 558 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 556 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 556 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 556 aa  372  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 559 aa  372  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 555 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 569 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00740  glutamine-tRNA ligase, putative  35.55 
 
 		 858 aa  367  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 552 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 559 aa  369  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 563 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 552 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 		 561 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 559 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 583 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 561 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 576 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 552 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 562 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 556 aa  369  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 566 aa  365  1e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03410  glutaminyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 555 aa  365  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 556 aa  365  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 559 aa  365  2e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 553 aa  365  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 552 aa  363  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 556 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1133  glutaminyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 579 aa  363  7.0000000000000005e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.613915  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3674  glutaminyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 606 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620823  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 555 aa  362  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 571 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2758  glutaminyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 556 aa  361  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112039  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 553 aa  360  5e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 558 aa  360  5e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 556 aa  360  6e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 556 aa  360  7e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00615688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>