More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_72287 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_72287  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 799 aa  1654    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579144  normal  0.826623 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00740  glutamine-tRNA ligase, putative  43.72 
 
 		 858 aa  689    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09157  Glutaminyl-tRNA synthetase (Eurofung)  52.6 
 
 		 628 aa  620  1e-176  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 568 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 552 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 570 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 563 aa  450  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 587 aa  450  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 569 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 555 aa  446  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 555 aa  446  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 555 aa  446  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 555 aa  446  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 555 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 554 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 554 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 554 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  44.43 
 
 		 554 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 554 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 554 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 554 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 554 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 554 aa  441  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 554 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 555 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 552 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 556 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 555 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 555 aa  439  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 555 aa  439  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 552 aa  435  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 552 aa  434  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 556 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 555 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23867  predicted protein  44.76 
 
 		 541 aa  432  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 567 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 567 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 567 aa  429  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 548 aa  428  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 555 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 580 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 572 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 567 aa  426  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 556 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 556 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 556 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 565 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 556 aa  420  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 569 aa  422  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 573 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 557 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 609 aa  422  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 576 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 558 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 556 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 564 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 561 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 566 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 556 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 556 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 556 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 562 aa  415  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 561 aa  415  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 571 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 568 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 556 aa  416  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 564 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 556 aa  415  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 569 aa  416  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 564 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 554 aa  412  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 556 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00615688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 569 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 556 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 563 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2758  glutaminyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 556 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112039  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 559 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 582 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 555 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 570 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 560 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 566 aa  409  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 569 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 580 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03410  glutaminyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 555 aa  409  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 576 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 565 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 555 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 561 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 561 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 552 aa  409  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 565 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 565 aa  409  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 569 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>