More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3674 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 
565 aa  648    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 
563 aa  648    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 
565 aa  650    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
569 aa  638    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3674  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
606 aa  1256    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620823  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 
580 aa  662    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 
561 aa  635    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 
568 aa  643    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 
589 aa  637    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 
564 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
570 aa  636    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 
554 aa  631  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 
555 aa  634  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 
555 aa  632  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 
558 aa  632  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  53.76 
 
 
560 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 
562 aa  628  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 
565 aa  629  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 
553 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 
587 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 
561 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 
565 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 
568 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
556 aa  622  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 
559 aa  623  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 
566 aa  623  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 
559 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 
563 aa  624  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 
561 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 
561 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
564 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 
556 aa  615  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 
567 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 
582 aa  613  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
556 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 
565 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
567 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 
569 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 
567 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  50.65 
 
 
572 aa  610  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
565 aa  608  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 
567 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
556 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 
583 aa  605  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 
556 aa  608  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00970277  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
556 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 
557 aa  603  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
552 aa  600  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
552 aa  600  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 
580 aa  597  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
558 aa  597  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
552 aa  597  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
548 aa  598  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
552 aa  595  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
555 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  50 
 
 
555 aa  592  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  50 
 
 
540 aa  594  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  50.65 
 
 
576 aa  594  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 
576 aa  594  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 
582 aa  595  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
555 aa  594  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
555 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
609 aa  588  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 
576 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 
555 aa  592  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1263  glutaminyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
781 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.578242  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  50 
 
 
552 aa  590  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  50 
 
 
565 aa  586  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
555 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
555 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
553 aa  585  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 
570 aa  588  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
555 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
554 aa  587  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 
579 aa  588  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
555 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
552 aa  587  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
555 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
566 aa  583  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
554 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0421  glutaminyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
559 aa  585  1.0000000000000001e-165  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1133  glutaminyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 
579 aa  582  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.613915  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
564 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 
590 aa  585  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
552 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
554 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  48.66 
 
 
554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
554 aa  581  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1249  glutaminyl-tRNA synthetase  50 
 
 
777 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1350  glutaminyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
777 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0295693  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1012  glutaminyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
705 aa  573  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 
559 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2599  glutaminyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
778 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0790772  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 
580 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
556 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>