More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_2394 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_2394  predicted protein  100 
 
 
373 aa  775    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26346  predicted protein  38.83 
 
 
647 aa  247  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.607128  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
476 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
475 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2496  cysteinyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.499432  decreased coverage  0.000437171 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
476 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
476 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
458 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
460 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
466 aa  209  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
461 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34104  predicted protein  37.53 
 
 
746 aa  207  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.121587 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1273  cysteinyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
481 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
459 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2590  cysteinyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
481 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0727872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2683  cysteinyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
481 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
464 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
460 aa  206  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 
456 aa  206  7e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
460 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
479 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6809  cysteinyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
495 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
448 aa  203  4e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
456 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
465 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 
474 aa  202  8e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
461 aa  202  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
460 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 
462 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
460 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 
479 aa  200  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
461 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
459 aa  199  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
489 aa  199  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
459 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 
472 aa  199  9e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
485 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
498 aa  198  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
461 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13051  cysteinyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
492 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
459 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
493 aa  196  5.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
465 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
494 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
461 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 
485 aa  196  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
459 aa  196  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 
493 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 
486 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
484 aa  195  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
461 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 
459 aa  195  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
461 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
455 aa  194  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
466 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
480 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
466 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
459 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
461 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
461 aa  193  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
461 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
461 aa  193  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13161  cysteinyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 
489 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0372399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
461 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  35.83 
 
 
461 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
461 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
461 aa  193  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
461 aa  193  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 
487 aa  193  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
485 aa  193  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1237  cysteinyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 
489 aa  193  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
466 aa  192  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
466 aa  192  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
474 aa  192  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 
466 aa  192  7e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
456 aa  192  8e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
478 aa  192  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
460 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
500 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
485 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
469 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
459 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
487 aa  191  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
453 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
465 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
459 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
459 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
459 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 
460 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
463 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0967  cysteinyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 
462 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0501799 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 
466 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
461 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>