More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_26346 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_26346  predicted protein  100 
 
 
647 aa  1360    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.607128  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34104  predicted protein  42.62 
 
 
746 aa  416  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.121587 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00900  cysteine-tRNA ligase, putative  44.14 
 
 
785 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.151967  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81289  cysteinyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
776 aa  358  9.999999999999999e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  unclonable  0.000000312189 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08800  cysteinyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G09610)  37.67 
 
 
833 aa  339  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.514684  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
476 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
476 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
476 aa  313  9e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 
475 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 
479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 
481 aa  302  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
466 aa  301  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 
484 aa  297  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 
468 aa  297  5e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
493 aa  293  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
464 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
476 aa  290  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
468 aa  289  1e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
466 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 
466 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
465 aa  286  8e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
462 aa  286  8e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
458 aa  286  8e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
460 aa  286  9e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 
474 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
460 aa  285  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 
469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
470 aa  285  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 
459 aa  283  6.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 
499 aa  283  8.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
485 aa  283  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 
460 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
468 aa  281  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
454 aa  281  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 
479 aa  280  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 
447 aa  280  6e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 
494 aa  280  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 
481 aa  279  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 
486 aa  279  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
460 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
460 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  39.9 
 
 
497 aa  277  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
460 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 
467 aa  276  7e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 
480 aa  276  8e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 
480 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
485 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
498 aa  276  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 
465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 
459 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
474 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
470 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
465 aa  274  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
456 aa  275  3e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 
500 aa  275  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
463 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
456 aa  274  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
465 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
461 aa  274  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
472 aa  274  5.000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 
460 aa  273  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
501 aa  273  7e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
460 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
459 aa  273  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
465 aa  273  9e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
465 aa  273  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
465 aa  273  9e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
465 aa  273  9e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
460 aa  273  9e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
465 aa  273  9e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
461 aa  273  9e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 
460 aa  273  9e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
461 aa  272  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
459 aa  272  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
465 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
461 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
453 aa  271  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 
493 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
481 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
459 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 
472 aa  271  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
459 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12151  cysteinyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
516 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.532713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
459 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
459 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 
461 aa  270  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 
466 aa  269  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
458 aa  269  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
474 aa  269  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 
459 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 
461 aa  267  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13051  cysteinyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 
492 aa  267  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 
455 aa  267  5e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 
460 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6809  cysteinyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 
495 aa  266  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
461 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 
448 aa  265  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>