More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0744 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0744  RNA methyltransferase  100 
 
 
254 aa  517  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1465  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.93 
 
 
242 aa  199  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3229  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.15 
 
 
247 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004009  RNA methyltransferase TrmH family  38.04 
 
 
244 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01509  hypothetical protein  38.67 
 
 
244 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0453  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.94 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1268  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.55 
 
 
249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0993  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.76 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145842  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12258  putative tRNA/rRNA methyltransferase  37.65 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0330  RNA methyltransferase  37.25 
 
 
257 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1516  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.32 
 
 
262 aa  156  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1675  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.94 
 
 
248 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1916  tRNA and rRNA methylase  36.36 
 
 
249 aa  145  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.581034  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2725  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.11 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1647  hypothetical protein  32.05 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0464  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.92 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0218  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.58 
 
 
271 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1222  RNA methyltransferase  32.32 
 
 
267 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0117794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4688  RNA methyltransferase  34.43 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000546426  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1394  rRNA methylase  31.89 
 
 
253 aa  116  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000633363  hitchhiker  1.76373e-23 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2125  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.92 
 
 
267 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00183225 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1728  rRNA methylase  34.26 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0566  RNA methyltransferase, TrmH family  34.02 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000331759  hitchhiker  0.0000000100751 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4688  RNA methyltransferase, TrmH family  34.02 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000539995  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2492  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.72 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4637  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.96 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0580801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4673  RNA methyltransferase, TrmH family  34.02 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4457  RNA methyltransferase  34.55 
 
 
254 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4305  23S rRNA methyltransferase  34.02 
 
 
254 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0650881  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1735  SpoU rRNA methylase family protein  30.77 
 
 
265 aa  113  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4805  RNA methyltransferase  34.55 
 
 
254 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00212295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4676  RNA methyltransferase, TrmH family  33.61 
 
 
265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90567e-34 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2051  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.28 
 
 
254 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0808  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.13 
 
 
251 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4393  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.29 
 
 
254 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000250925  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0915  rRNA methylase  35.19 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00701819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4295  23S rRNA methyltransferase  33.61 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0334  rRNA methylase  28.52 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.693845  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2211  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.8 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0173286  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.26 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000197241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3250  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.64 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1207  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.68 
 
 
270 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0784669  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0296  SpoU rRNA methylase family protein  32.67 
 
 
265 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172027 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1853  RNA methyltransferase  25.76 
 
 
257 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683239  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1221  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.62 
 
 
258 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000766628  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1923  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.54 
 
 
265 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.21 
 
 
272 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000452495  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1093  23S rRNA methyltransferase  32.17 
 
 
264 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000062165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0417  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.17 
 
 
264 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2169  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.47 
 
 
261 aa  105  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000507695  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0462  RNA methyltransferase  27.89 
 
 
255 aa  105  1e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1800  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.08 
 
 
265 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2397  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.7 
 
 
266 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.004624  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0025  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.59 
 
 
286 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152428 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2650  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.37 
 
 
254 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00276989  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0720  RNA methyltransferase  36.31 
 
 
246 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0561  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.64 
 
 
254 aa  100  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1437  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  27.69 
 
 
269 aa  99.4  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3677  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.72 
 
 
286 aa  98.6  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2787  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.34 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl258  rRNA methylase  27.17 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000982584  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05620  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.85 
 
 
270 aa  97.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147427  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1374  RNA methyltransferase  31.94 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2090  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.52 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.76 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2141  RNA methyltransferase  25.3 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1035  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.58 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1196  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.95 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1218  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.95 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0162  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.06 
 
 
294 aa  96.3  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0863  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.01 
 
 
266 aa  96.3  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1341  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.57 
 
 
241 aa  95.5  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.240976  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3160  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.21 
 
 
257 aa  95.1  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.560125  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0769  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.95 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0387  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.46 
 
 
242 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.77 
 
 
234 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0145  RNA methyltransferase  32.58 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0150  RNA methyltransferase  32.58 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3145  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.03 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00100034  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2951  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.03 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1304  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.88 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357101  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.3 
 
 
268 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0955758  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0414  rRNA methylase  30 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1107  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.51 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0537  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.63 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0842858  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1870  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.83 
 
 
279 aa  91.7  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2224  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.89 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6073  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.18 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389176  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3173  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.63 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0121288  normal  0.209756 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2004  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.18 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0623  rRNA methylase  31.78 
 
 
252 aa  89  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.59 
 
 
277 aa  89  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132475  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5314  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.68 
 
 
260 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300522  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11661  23S rRNA methyltransferase tsnR  31.03 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1436  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.8 
 
 
260 aa  89  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0303105  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2835  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.37 
 
 
277 aa  88.6  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13461  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.13 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0757278  normal  0.982465 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2024  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.38 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146805  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2037  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.18 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.859577  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.14 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479292  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>