More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0387 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0387  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
242 aa  504  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02637  rRNA methyltransferase  54.79 
 
 
261 aa  280  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1093  23S rRNA methyltransferase  35.25 
 
 
264 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000062165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0417  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.26 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253805  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1268  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.6 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05620  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.13 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147427  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0561  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.38 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2169  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.41 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000507695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0218  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.31 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299971  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2090  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.37 
 
 
263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1222  RNA methyltransferase  30.95 
 
 
267 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0117794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1207  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.92 
 
 
270 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0784669  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.2 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0955758  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.56 
 
 
260 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1853  RNA methyltransferase  28.98 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2051  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.76 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154178  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1735  SpoU rRNA methylase family protein  35.1 
 
 
265 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0464  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.33 
 
 
257 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3068  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.71 
 
 
283 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.914691 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0462  RNA methyltransferase  30 
 
 
255 aa  107  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2039  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  33.59 
 
 
277 aa  105  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.928617 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.12 
 
 
267 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000197241  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0720  RNA methyltransferase  31.69 
 
 
246 aa  105  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2397  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.55 
 
 
266 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.004624  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1465  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.13 
 
 
242 aa  105  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1437  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.91 
 
 
269 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2125  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.2 
 
 
267 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00183225 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0808  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.14 
 
 
251 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2492  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.12 
 
 
269 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3145  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.02 
 
 
260 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00100034  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2951  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.02 
 
 
260 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3166  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.42 
 
 
264 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.197409  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1757  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.37 
 
 
255 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3036  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.2 
 
 
261 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142554  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1923  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.8 
 
 
265 aa  102  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2650  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.08 
 
 
254 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00276989  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5480  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.04 
 
 
272 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666691  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01509  hypothetical protein  31.73 
 
 
244 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2415  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.88 
 
 
265 aa  102  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3055  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.17 
 
 
236 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4637  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.3 
 
 
262 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0580801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1675  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.93 
 
 
248 aa  101  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.82 
 
 
276 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11661  23S rRNA methyltransferase tsnR  33.98 
 
 
260 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1199  tRNA/rRNA methyltransferase  33.61 
 
 
234 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354486  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0330  RNA methyltransferase  30.61 
 
 
257 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1819  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.76 
 
 
269 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.175485  normal  0.555192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1800  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.95 
 
 
265 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0334  rRNA methylase  29.92 
 
 
257 aa  100  3e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.693845  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004009  RNA methyltransferase TrmH family  30.04 
 
 
244 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3539  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.58 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0474859  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.5 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1516  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.05 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1221  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.45 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000766628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0453  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.58 
 
 
243 aa  99  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2142  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.77 
 
 
289 aa  98.6  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00455486  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2382  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.81 
 
 
254 aa  98.6  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1916  tRNA and rRNA methylase  27.35 
 
 
249 aa  98.2  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.581034  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2063  putative rRNA methylase  31.18 
 
 
275 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00825348  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1606  RNA methyltransferase  31.33 
 
 
247 aa  97.1  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0012787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0993  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.6 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145842  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1196  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.52 
 
 
246 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1218  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.52 
 
 
246 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2141  RNA methyltransferase  27.54 
 
 
257 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2211  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.57 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0173286  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49741  predicted protein  27.9 
 
 
343 aa  96.7  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3229  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.43 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12258  putative tRNA/rRNA methyltransferase  31.45 
 
 
244 aa  96.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25660  rRNA methylase  31.75 
 
 
257 aa  96.3  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2725  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.98 
 
 
253 aa  95.5  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1341  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.96 
 
 
241 aa  95.5  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.240976  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0744  RNA methyltransferase  33.46 
 
 
254 aa  95.1  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5470  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.82 
 
 
282 aa  95.1  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1483  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.56 
 
 
297 aa  95.1  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2462  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.84 
 
 
237 aa  95.1  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3250  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.33 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0769  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.86 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4305  23S rRNA methyltransferase  32.11 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0650881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0537  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.65 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0842858  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0623  rRNA methylase  31.73 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1728  rRNA methylase  32.64 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4676  RNA methyltransferase, TrmH family  32.11 
 
 
265 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90567e-34 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1311  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.49 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.662329  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2993  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.13 
 
 
248 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.246575  normal  0.0568105 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4295  23S rRNA methyltransferase  32.11 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4688  RNA methyltransferase, TrmH family  32.11 
 
 
254 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000539995  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1394  rRNA methylase  30 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000633363  hitchhiker  1.76373e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4688  RNA methyltransferase  31.71 
 
 
254 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000546426  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14560  rRNA methylase  29.93 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0566  RNA methyltransferase, TrmH family  32.11 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000331759  hitchhiker  0.0000000100751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1035  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.23 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4457  RNA methyltransferase  31.71 
 
 
254 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4805  RNA methyltransferase  31.71 
 
 
254 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00212295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4673  RNA methyltransferase, TrmH family  31.71 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2978  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.65 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3022  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.65 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1107  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.34 
 
 
260 aa  91.7  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.35 
 
 
250 aa  91.7  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3173  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.8 
 
 
261 aa  91.7  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0121288  normal  0.209756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4393  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.71 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000250925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>