31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4821 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4821  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1635  hypothetical protein  63.46 
 
 
235 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0142491  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0855  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  59.22 
 
 
247 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1094  hypothetical protein  54.63 
 
 
232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.117694  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2527  hypothetical protein  41.97 
 
 
222 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0459  hypothetical protein  37.37 
 
 
228 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973172  normal  0.217109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0058  hypothetical protein  34.78 
 
 
253 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0056  uncharacterized protein involved in ubiquinone biosynthesis  34.78 
 
 
253 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107681  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20781  hypothetical protein  32.72 
 
 
222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1400  hypothetical protein  32.35 
 
 
220 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3834  hypothetical protein  32.33 
 
 
253 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2142  hypothetical protein  30.09 
 
 
253 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0304  hypothetical protein  37.27 
 
 
215 aa  118  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0768  hypothetical protein  32.06 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.022382  normal  0.202851 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08681  hypothetical protein  33.17 
 
 
219 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3348  hypothetical protein  29.65 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3628  hypothetical protein  27.74 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3728  hypothetical protein  26.78 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04757  Coenzyme Q (ubiquinone) biosynthesis protein Coq4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06410)  27.03 
 
 
316 aa  62.8  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90569  predicted protein  24.71 
 
 
320 aa  60.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.452398  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3630  hypothetical protein  29.94 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55838  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_38985  predicted protein  26.11 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0827  hypothetical protein  42.86 
 
 
101 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119511  Ubiquinone biosynthesis protein COQ4-like protein  24.56 
 
 
224 aa  52.4  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1641  hypothetical protein  24.2 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03000  ubiquinone metabolism-related protein, putative  21.3 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1010  hypothetical protein  24.71 
 
 
241 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.708438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1464  hypothetical protein  30.77 
 
 
260 aa  48.9  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3277  hypothetical protein  28.95 
 
 
297 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625674  normal  0.209771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2257  hypothetical protein  27.72 
 
 
268 aa  45.4  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448335  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3710  hypothetical protein  21.67 
 
 
284 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0407682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>